40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_28032 on replicon NC_009370
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009370  OSTLU_28032  predicted protein  100 
 
 
273 aa  565  1e-160  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0307251  normal  0.690356 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18991  predicted protein  44.44 
 
 
622 aa  69.7  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0475639  normal  0.137229 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04730  nonhistone protein 6, putative  43.06 
 
 
116 aa  65.5  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0853417  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32255  predicted protein  34.09 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25566  predicted protein  38.57 
 
 
338 aa  63.2  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02885  Non-histone chromosomal protein 6 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B995]  37.78 
 
 
106 aa  62  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00549573  normal  0.269501 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00360  SWIB/MDM2 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02020)  36.59 
 
 
279 aa  60.1  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.156113  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24886  predicted protein  36.36 
 
 
200 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.845597  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0926  SWIB/MDM2 domain-containing protein  39.24 
 
 
120 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0300157  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1312  SWIB/MDM2 domain protein  37.5 
 
 
110 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345633  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11286  predicted protein  34.72 
 
 
75 aa  56.2  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.673219  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_23779  Nonhistone chromosomal protein 6A  35 
 
 
85 aa  56.2  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.667446  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3324  SWIB/MDM2 domain protein  35.48 
 
 
110 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.263816 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4742  SWIB/MDM2 domain protein  36.25 
 
 
106 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166438  hitchhiker  0.00240226 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3448  SWIB/MDM2 domain protein  32.63 
 
 
110 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.655611  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3127  SWIB/MDM2 domain-containing protein  32.63 
 
 
110 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.13314 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_31946  predicted protein  38.89 
 
 
95 aa  53.5  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12674  predicted protein  32.88 
 
 
90 aa  52.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.42555  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_12709  non-histone protein 10  30.43 
 
 
218 aa  52.4  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0597181  normal  0.318516 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39880  predicted protein  28.32 
 
 
287 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34626  predicted protein  28.32 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000000196337  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3522  SWIB/MDM2 domain-containing protein  33.75 
 
 
119 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0884  DNA topoisomerase III  36.47 
 
 
975 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.979089 
 
 
-
 
NC_002620  TC0012  DNA topoisomerase I/SWI domain fusion protein  33.33 
 
 
865 aa  47  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25431  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0745  hypothetical protein  35.14 
 
 
86 aa  47  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.352276  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02810  conserved hypothetical protein  22.93 
 
 
252 aa  46.2  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0056  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  46.6  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55535  normal  0.101968 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16581  predicted protein  38.89 
 
 
133 aa  46.2  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2404  SWIB/MDM2 domain-containing protein  41.18 
 
 
96 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.609198  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1444  SWIB/MDM2 domain protein  41.18 
 
 
96 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3339  DNA topoisomerase III  34.25 
 
 
981 aa  44.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3990  DNA topoisomerase III  34.25 
 
 
981 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.250381  normal  0.105693 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14486  predicted protein  33.33 
 
 
1782 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00353687  normal  0.194877 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0747  SWIB/MDM2 domain-containing protein  34.72 
 
 
84 aa  43.9  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000104692  hitchhiker  0.0000000000199042 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6025  predicted protein  33.82 
 
 
147 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1834  SWIB/MDM2 domain protein  31.94 
 
 
108 aa  42.7  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0550627 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32993  predicted protein  30.67 
 
 
306 aa  42.4  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161398  normal  0.121587 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2373  SWIB/MDM2 domain-containing protein  41.67 
 
 
134 aa  42.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.460369  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0195  SWIB/MDM2 domain-containing protein  38.46 
 
 
133 aa  42.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4627  DNA topoisomerase III  35 
 
 
982 aa  42  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957836  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>