71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0766 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0766  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  525  1e-148  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00261979 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1665  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  62.15 
 
 		 252 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.643155  hitchhiker  0.00000000000624086 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0819  aspartate dehydrogenase  53.2 
 
 		 252 aa  293  2e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0412876  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0500  aspartate dehydrogenase  52.4 
 
 		 252 aa  270  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.431353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2777  Aspartate dehydrogenase  46.61 
 
 		 255 aa  267  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2354  aspartate dehydrogenase  50.6 
 
 		 252 aa  248  6e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1416  Aspartate dehydrogenase  46.25 
 
 		 302 aa  246  4e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.350472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0362  Aspartate dehydrogenase  39.6 
 
 		 249 aa  196  5.000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0848  L-aspartate dehydrogenase  35.47 
 
 		 266 aa  169  6e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0845  L-aspartate dehydrogenase  36.47 
 
 		 267 aa  168  7e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0148  L-aspartate dehydrogenase  36.6 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0242  aspartate dehydrogenase  36.7 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1607  L-aspartate dehydrogenase  34.21 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00593098  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1758  L-aspartate dehydrogenase  34.59 
 
 		 267 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.99388  normal  0.0655973 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1866  L-aspartate dehydrogenase  37.64 
 
 		 271 aa  155  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.306299 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1681  L-aspartate dehydrogenase  33.83 
 
 		 271 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000249643  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1240  aspartate dehydrogenase  34.62 
 
 		 272 aa  128  7.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1186  L-aspartate dehydrogenase  33.6 
 
 		 241 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1582  L-aspartate dehydrogenase  33.83 
 
 		 244 aa  125  7e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00462542  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1148  L-aspartate dehydrogenase  33.99 
 
 		 241 aa  125  7e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2124  aspartate dehydrogenase  27.61 
 
 		 261 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.231784  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0824  aspartate dehydrogenase  29.96 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00374726  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1041  aspartate dehydrogenase  33.98 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3108  aspartate dehydrogenase  32.06 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1112  L-aspartate dehydrogenase  31.97 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0146525  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1256  L-aspartate dehydrogenase  33.33 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.428363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3665  L-aspartate dehydrogenase  31.97 
 
 		 275 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4702  L-aspartate dehydrogenase  31.97 
 
 		 275 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000199944  normal  0.165404 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5598  L-aspartate dehydrogenase  31.97 
 
 		 275 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.617624 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4635  L-aspartate dehydrogenase  30.27 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.274384  normal  0.0742078 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4503  L-aspartate dehydrogenase  30.27 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.812861 
 
 
-
 
NC_003296  RS01727  L-aspartate dehydrogenase  29.77 
 
 		 268 aa  99.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3958  L-aspartate dehydrogenase  31.08 
 
 		 264 aa  98.6  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0952  L-aspartate dehydrogenase  28.74 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4096  L-aspartate dehydrogenase  30.34 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3686  L-aspartate dehydrogenase  29.21 
 
 		 267 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.585588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4561  L-aspartate dehydrogenase  30.86 
 
 		 275 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166685  hitchhiker  0.00306473 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4240  L-aspartate dehydrogenase  29.93 
 
 		 269 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0182  L-aspartate dehydrogenase  30.22 
 
 		 276 aa  95.9  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3576  L-aspartate dehydrogenase  30.42 
 
 		 268 aa  95.1  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0854934  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0147  putative L-aspartate dehydrogenase  28.94 
 
 		 272 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7066  L-aspartate dehydrogenase  29.35 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1494  L-aspartate dehydrogenase  30.4 
 
 		 271 aa  90.5  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3991  L-aspartate dehydrogenase  31.6 
 
 		 276 aa  90.1  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123605  normal  0.0295536 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0141  L-aspartate dehydrogenase  32.76 
 
 		 265 aa  89.4  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3166  L-aspartate dehydrogenase  29.3 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4396  aspartate dehydrogenase  29.06 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2501  L-aspartate dehydrogenase  30.04 
 
 		 271 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0532  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34 
 
 		 512 aa  87  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.147571  normal  0.119991 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1329  L-aspartate dehydrogenase  30.04 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0312  L-aspartate dehydrogenase  30.04 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0379705  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0979  L-aspartate dehydrogenase  30.04 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00837942  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1241  L-aspartate dehydrogenase  30.04 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1314  L-aspartate dehydrogenase  30.04 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243465  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0588  L-aspartate dehydrogenase  30.04 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1595  L-aspartate dehydrogenase  34.95 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1451  L-aspartate dehydrogenase  31.38 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9150  dinucleotide-utilizing enzyme  28.5 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5291  aspartate dehydrogenase  32.32 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00146413  normal  0.0452822 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0239  aspartate dehydrogenase  28.09 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  40.91 
 
 		 345 aa  52.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 373 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1282  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000882586  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 368 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 369 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  30.92 
 
 		 388 aa  45.4  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  24.72 
 
 		 358 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  25.56 
 
 		 379 aa  42.7  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  29.76 
 
 		 333 aa  42.7  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>