59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5291 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010335  Caul_5291  aspartate dehydrogenase  100 
 
 
270 aa  520  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00146413  normal  0.0452822 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0824  aspartate dehydrogenase  40.86 
 
 
270 aa  185  8e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00374726  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4702  L-aspartate dehydrogenase  43.89 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000199944  normal  0.165404 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5598  L-aspartate dehydrogenase  43.89 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.617624 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3665  L-aspartate dehydrogenase  43.89 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1112  L-aspartate dehydrogenase  42.91 
 
 
271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0146525  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3108  aspartate dehydrogenase  39.02 
 
 
257 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4561  L-aspartate dehydrogenase  42.15 
 
 
275 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166685  hitchhiker  0.00306473 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4096  L-aspartate dehydrogenase  42.15 
 
 
275 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4240  L-aspartate dehydrogenase  41.76 
 
 
269 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3576  L-aspartate dehydrogenase  42.47 
 
 
268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0854934  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1256  L-aspartate dehydrogenase  37.25 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.428363  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0182  L-aspartate dehydrogenase  41 
 
 
276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1494  L-aspartate dehydrogenase  43.24 
 
 
271 aa  162  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0979  L-aspartate dehydrogenase  44.02 
 
 
271 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00837942  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1241  L-aspartate dehydrogenase  44.02 
 
 
271 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1314  L-aspartate dehydrogenase  44.02 
 
 
271 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243465  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0588  L-aspartate dehydrogenase  44.02 
 
 
271 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0312  L-aspartate dehydrogenase  44.02 
 
 
271 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0379705  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3991  L-aspartate dehydrogenase  43.13 
 
 
276 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123605  normal  0.0295536 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1329  L-aspartate dehydrogenase  44.02 
 
 
271 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2501  L-aspartate dehydrogenase  43.63 
 
 
271 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0141  L-aspartate dehydrogenase  43.4 
 
 
265 aa  159  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7066  L-aspartate dehydrogenase  41.38 
 
 
276 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218064  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3958  L-aspartate dehydrogenase  38.52 
 
 
264 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1041  aspartate dehydrogenase  44.8 
 
 
265 aa  156  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3166  L-aspartate dehydrogenase  44.44 
 
 
264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4635  L-aspartate dehydrogenase  39.62 
 
 
267 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.274384  normal  0.0742078 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4503  L-aspartate dehydrogenase  39.62 
 
 
267 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.812861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3686  L-aspartate dehydrogenase  41.51 
 
 
267 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.585588  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4396  aspartate dehydrogenase  37.55 
 
 
268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01727  L-aspartate dehydrogenase  40.46 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0952  L-aspartate dehydrogenase  40.79 
 
 
267 aa  145  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1451  L-aspartate dehydrogenase  45.49 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0239  aspartate dehydrogenase  41.98 
 
 
253 aa  135  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1866  L-aspartate dehydrogenase  37.88 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.306299 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1681  L-aspartate dehydrogenase  34.18 
 
 
271 aa  125  6e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000249643  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0848  L-aspartate dehydrogenase  29.57 
 
 
266 aa  123  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0242  aspartate dehydrogenase  38.05 
 
 
269 aa  122  6e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1240  aspartate dehydrogenase  30.86 
 
 
272 aa  116  5e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1595  L-aspartate dehydrogenase  41.13 
 
 
262 aa  115  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0148  L-aspartate dehydrogenase  28.51 
 
 
267 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1758  L-aspartate dehydrogenase  27.63 
 
 
267 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.99388  normal  0.0655973 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1186  L-aspartate dehydrogenase  27.31 
 
 
241 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0147  putative L-aspartate dehydrogenase  35.56 
 
 
272 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1148  L-aspartate dehydrogenase  28.2 
 
 
241 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0845  L-aspartate dehydrogenase  27.78 
 
 
267 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0819  aspartate dehydrogenase  32.69 
 
 
252 aa  97.4  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0412876  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2124  aspartate dehydrogenase  30.29 
 
 
261 aa  97.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.231784  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1607  L-aspartate dehydrogenase  25.46 
 
 
267 aa  97.1  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00593098  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1416  Aspartate dehydrogenase  32.95 
 
 
302 aa  92.8  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.350472  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0500  aspartate dehydrogenase  31.01 
 
 
252 aa  86.7  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.431353  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2777  Aspartate dehydrogenase  27.41 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0362  Aspartate dehydrogenase  25 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2354  aspartate dehydrogenase  27.45 
 
 
252 aa  82  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1582  L-aspartate dehydrogenase  25.95 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00462542  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0766  hypothetical protein  29.44 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00261979 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1665  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.84 
 
 
252 aa  77  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.643155  hitchhiker  0.00000000000624086 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9150  dinucleotide-utilizing enzyme  33.94 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>