60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0242 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0242  aspartate dehydrogenase  100 
 
 		 269 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1681  L-aspartate dehydrogenase  49.26 
 
 		 271 aa  266  2e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000249643  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1866  L-aspartate dehydrogenase  48.89 
 
 		 271 aa  261  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.306299 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1240  aspartate dehydrogenase  44.28 
 
 		 272 aa  218  6e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0848  L-aspartate dehydrogenase  38.75 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0148  L-aspartate dehydrogenase  41.11 
 
 		 267 aa  195  6e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1758  L-aspartate dehydrogenase  39.63 
 
 		 267 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.99388  normal  0.0655973 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0845  L-aspartate dehydrogenase  40 
 
 		 267 aa  188  9e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1416  Aspartate dehydrogenase  43.12 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.350472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0819  aspartate dehydrogenase  40.82 
 
 		 252 aa  183  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0412876  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0362  Aspartate dehydrogenase  38.29 
 
 		 249 aa  182  6e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0147  putative L-aspartate dehydrogenase  38.15 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2777  Aspartate dehydrogenase  40.45 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1607  L-aspartate dehydrogenase  36.06 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00593098  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0500  aspartate dehydrogenase  40.07 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.431353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2354  aspartate dehydrogenase  39.55 
 
 		 252 aa  162  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0766  hypothetical protein  36.44 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00261979 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1665  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  41.47 
 
 		 252 aa  149  5e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.643155  hitchhiker  0.00000000000624086 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3958  L-aspartate dehydrogenase  40.69 
 
 		 264 aa  142  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1041  aspartate dehydrogenase  37.35 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4096  L-aspartate dehydrogenase  36.5 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4561  L-aspartate dehydrogenase  36.5 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166685  hitchhiker  0.00306473 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4702  L-aspartate dehydrogenase  37.26 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000199944  normal  0.165404 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3665  L-aspartate dehydrogenase  37.26 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5598  L-aspartate dehydrogenase  37.26 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.617624 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1112  L-aspartate dehydrogenase  36.5 
 
 		 271 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0146525  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0182  L-aspartate dehydrogenase  35.88 
 
 		 276 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4240  L-aspartate dehydrogenase  35.61 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4503  L-aspartate dehydrogenase  35.07 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.812861 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4635  L-aspartate dehydrogenase  35.07 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.274384  normal  0.0742078 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0141  L-aspartate dehydrogenase  41.79 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0952  L-aspartate dehydrogenase  36.33 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7066  L-aspartate dehydrogenase  35.11 
 
 		 276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3166  L-aspartate dehydrogenase  36.47 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3576  L-aspartate dehydrogenase  35.69 
 
 		 268 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0854934  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01727  L-aspartate dehydrogenase  34.57 
 
 		 268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3991  L-aspartate dehydrogenase  36.12 
 
 		 276 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123605  normal  0.0295536 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1494  L-aspartate dehydrogenase  36.5 
 
 		 271 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3686  L-aspartate dehydrogenase  35.71 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.585588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4396  aspartate dehydrogenase  36.64 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1582  L-aspartate dehydrogenase  36.11 
 
 		 244 aa  122  7e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00462542  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1256  L-aspartate dehydrogenase  33.82 
 
 		 263 aa  122  8e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.428363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2501  L-aspartate dehydrogenase  35.74 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1148  L-aspartate dehydrogenase  34.46 
 
 		 241 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0979  L-aspartate dehydrogenase  35.74 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00837942  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1241  L-aspartate dehydrogenase  35.74 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1314  L-aspartate dehydrogenase  35.74 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243465  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0588  L-aspartate dehydrogenase  35.74 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0312  L-aspartate dehydrogenase  35.74 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0379705  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1329  L-aspartate dehydrogenase  35.74 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1186  L-aspartate dehydrogenase  34.08 
 
 		 241 aa  119  7e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5291  aspartate dehydrogenase  33.82 
 
 		 270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00146413  normal  0.0452822 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1451  L-aspartate dehydrogenase  34.96 
 
 		 253 aa  115  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0824  aspartate dehydrogenase  36.04 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00374726  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3108  aspartate dehydrogenase  32.33 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1595  L-aspartate dehydrogenase  36.63 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2124  aspartate dehydrogenase  31.44 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.231784  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0239  aspartate dehydrogenase  31.82 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0532  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.52 
 
 		 512 aa  87.8  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.147571  normal  0.119991 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9150  dinucleotide-utilizing enzyme  33.19 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>