66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1665 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1665  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  100 
 
 		 252 aa  520  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.643155  hitchhiker  0.00000000000624086 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0819  aspartate dehydrogenase  60.16 
 
 		 252 aa  324  9e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0412876  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2777  Aspartate dehydrogenase  59.76 
 
 		 255 aa  317  9e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0766  hypothetical protein  60.43 
 
 		 259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00261979 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0500  aspartate dehydrogenase  59.76 
 
 		 252 aa  296  2e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.431353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2354  aspartate dehydrogenase  58.33 
 
 		 252 aa  285  4e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1416  Aspartate dehydrogenase  51.79 
 
 		 302 aa  279  3e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.350472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0362  Aspartate dehydrogenase  45.42 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0242  aspartate dehydrogenase  41.47 
 
 		 269 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1607  L-aspartate dehydrogenase  34.96 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00593098  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0848  L-aspartate dehydrogenase  36.6 
 
 		 266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0148  L-aspartate dehydrogenase  36.09 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0845  L-aspartate dehydrogenase  35.71 
 
 		 267 aa  160  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1866  L-aspartate dehydrogenase  37.41 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.306299 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1758  L-aspartate dehydrogenase  34.96 
 
 		 267 aa  156  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.99388  normal  0.0655973 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1681  L-aspartate dehydrogenase  37.27 
 
 		 271 aa  151  8e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000249643  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1240  aspartate dehydrogenase  37.02 
 
 		 272 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1582  L-aspartate dehydrogenase  39.3 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00462542  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1148  L-aspartate dehydrogenase  33.85 
 
 		 241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1186  L-aspartate dehydrogenase  33.46 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4240  L-aspartate dehydrogenase  31.01 
 
 		 269 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3686  L-aspartate dehydrogenase  30.97 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.585588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0182  L-aspartate dehydrogenase  30.5 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1112  L-aspartate dehydrogenase  31.01 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0146525  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0824  aspartate dehydrogenase  32.82 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00374726  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3665  L-aspartate dehydrogenase  31.54 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4561  L-aspartate dehydrogenase  30.89 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166685  hitchhiker  0.00306473 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5598  L-aspartate dehydrogenase  31.54 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.617624 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4702  L-aspartate dehydrogenase  31.54 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000199944  normal  0.165404 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4096  L-aspartate dehydrogenase  30.89 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7066  L-aspartate dehydrogenase  30.89 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2124  aspartate dehydrogenase  27.27 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.231784  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1041  aspartate dehydrogenase  32.18 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4503  L-aspartate dehydrogenase  31.3 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.812861 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3958  L-aspartate dehydrogenase  28.46 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4635  L-aspartate dehydrogenase  31.3 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.274384  normal  0.0742078 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0141  L-aspartate dehydrogenase  33.33 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01727  L-aspartate dehydrogenase  29.43 
 
 		 268 aa  102  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1256  L-aspartate dehydrogenase  31.15 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.428363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3991  L-aspartate dehydrogenase  30.62 
 
 		 276 aa  95.9  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123605  normal  0.0295536 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3576  L-aspartate dehydrogenase  30 
 
 		 268 aa  95.1  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0854934  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3108  aspartate dehydrogenase  28.57 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0532  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.16 
 
 		 512 aa  93.6  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.147571  normal  0.119991 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3166  L-aspartate dehydrogenase  30.89 
 
 		 264 aa  92.8  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4396  aspartate dehydrogenase  30.23 
 
 		 268 aa  92.4  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1494  L-aspartate dehydrogenase  29.59 
 
 		 271 aa  92.4  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0952  L-aspartate dehydrogenase  28.2 
 
 		 267 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0147  putative L-aspartate dehydrogenase  29.21 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1241  L-aspartate dehydrogenase  29.7 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2501  L-aspartate dehydrogenase  29.7 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0312  L-aspartate dehydrogenase  29.7 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0379705  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0588  L-aspartate dehydrogenase  29.7 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1314  L-aspartate dehydrogenase  29.7 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243465  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0979  L-aspartate dehydrogenase  29.7 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00837942  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1329  L-aspartate dehydrogenase  29.7 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1595  L-aspartate dehydrogenase  30.21 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1451  L-aspartate dehydrogenase  30.27 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5291  aspartate dehydrogenase  28.46 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00146413  normal  0.0452822 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9150  dinucleotide-utilizing enzyme  26.07 
 
 		 257 aa  72  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0239  aspartate dehydrogenase  30.14 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 		 345 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  32.95 
 
 		 368 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1826  dehydrogenase related protein  29.67 
 
 		 326 aa  45.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2388  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  31.43 
 
 		 323 aa  44.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00285003  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  38.36 
 
 		 356 aa  44.3  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  35.59 
 
 		 356 aa  42  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>