60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3166 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3166  L-aspartate dehydrogenase  100 
 
 		 264 aa  509  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3576  L-aspartate dehydrogenase  66.04 
 
 		 268 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0854934  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4635  L-aspartate dehydrogenase  64.29 
 
 		 267 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.274384  normal  0.0742078 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4503  L-aspartate dehydrogenase  64.29 
 
 		 267 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.812861 
 
 
-
 
NC_003296  RS01727  L-aspartate dehydrogenase  63.67 
 
 		 268 aa  324  9e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3686  L-aspartate dehydrogenase  64.34 
 
 		 267 aa  320  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.585588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0952  L-aspartate dehydrogenase  66.79 
 
 		 267 aa  317  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5598  L-aspartate dehydrogenase  58.27 
 
 		 275 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.617624 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4702  L-aspartate dehydrogenase  58.27 
 
 		 275 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000199944  normal  0.165404 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3665  L-aspartate dehydrogenase  58.27 
 
 		 275 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4240  L-aspartate dehydrogenase  57.2 
 
 		 269 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4561  L-aspartate dehydrogenase  56.39 
 
 		 275 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166685  hitchhiker  0.00306473 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1112  L-aspartate dehydrogenase  56.39 
 
 		 271 aa  268  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0146525  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0182  L-aspartate dehydrogenase  56.49 
 
 		 276 aa  268  8e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4096  L-aspartate dehydrogenase  55.26 
 
 		 275 aa  263  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3991  L-aspartate dehydrogenase  56.87 
 
 		 276 aa  257  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123605  normal  0.0295536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7066  L-aspartate dehydrogenase  56.11 
 
 		 276 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1241  L-aspartate dehydrogenase  56.49 
 
 		 271 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1314  L-aspartate dehydrogenase  56.49 
 
 		 271 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243465  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0979  L-aspartate dehydrogenase  56.49 
 
 		 271 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00837942  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1329  L-aspartate dehydrogenase  56.49 
 
 		 271 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0588  L-aspartate dehydrogenase  56.49 
 
 		 271 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0312  L-aspartate dehydrogenase  56.49 
 
 		 271 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0379705  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2501  L-aspartate dehydrogenase  56.11 
 
 		 271 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1494  L-aspartate dehydrogenase  56.11 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1041  aspartate dehydrogenase  45.93 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0824  aspartate dehydrogenase  44.07 
 
 		 270 aa  198  7e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00374726  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0141  L-aspartate dehydrogenase  50 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3958  L-aspartate dehydrogenase  49.23 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1256  L-aspartate dehydrogenase  39.45 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.428363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3108  aspartate dehydrogenase  41.86 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4396  aspartate dehydrogenase  41.06 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1451  L-aspartate dehydrogenase  47.28 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1595  L-aspartate dehydrogenase  48.51 
 
 		 262 aa  158  8e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1681  L-aspartate dehydrogenase  33.96 
 
 		 271 aa  150  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000249643  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1866  L-aspartate dehydrogenase  35.5 
 
 		 271 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.306299 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1240  aspartate dehydrogenase  33.71 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0239  aspartate dehydrogenase  42.42 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0242  aspartate dehydrogenase  36.64 
 
 		 269 aa  135  8e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1186  L-aspartate dehydrogenase  33.46 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0147  putative L-aspartate dehydrogenase  37.92 
 
 		 272 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0148  L-aspartate dehydrogenase  30.89 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5291  aspartate dehydrogenase  44.49 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00146413  normal  0.0452822 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0845  L-aspartate dehydrogenase  29.7 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1758  L-aspartate dehydrogenase  30.5 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.99388  normal  0.0655973 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1607  L-aspartate dehydrogenase  28.95 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00593098  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1148  L-aspartate dehydrogenase  31.68 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0848  L-aspartate dehydrogenase  27.91 
 
 		 266 aa  117  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0362  Aspartate dehydrogenase  29.64 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2777  Aspartate dehydrogenase  32.43 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1416  Aspartate dehydrogenase  33.59 
 
 		 302 aa  104  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.350472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0500  aspartate dehydrogenase  33.08 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.431353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1582  L-aspartate dehydrogenase  26.6 
 
 		 244 aa  88.6  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00462542  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0766  hypothetical protein  29.2 
 
 		 259 aa  86.7  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00261979 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2354  aspartate dehydrogenase  28.52 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1665  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.68 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.643155  hitchhiker  0.00000000000624086 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0819  aspartate dehydrogenase  30.53 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0412876  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2124  aspartate dehydrogenase  24.16 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.231784  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9150  dinucleotide-utilizing enzyme  29.69 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0532  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.57 
 
 		 512 aa  49.7  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.147571  normal  0.119991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>