78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1607 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1607  L-aspartate dehydrogenase  100 
 
 
267 aa  528  1e-149  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00593098  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0148  L-aspartate dehydrogenase  79.4 
 
 
267 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0845  L-aspartate dehydrogenase  79.78 
 
 
267 aa  430  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1758  L-aspartate dehydrogenase  78.28 
 
 
267 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.99388  normal  0.0655973 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0848  L-aspartate dehydrogenase  60.3 
 
 
266 aa  330  1e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1866  L-aspartate dehydrogenase  41.76 
 
 
271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.306299 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2777  Aspartate dehydrogenase  39.33 
 
 
255 aa  187  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1681  L-aspartate dehydrogenase  40.66 
 
 
271 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000249643  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0242  aspartate dehydrogenase  35.82 
 
 
269 aa  176  4e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0362  Aspartate dehydrogenase  39.1 
 
 
249 aa  166  5e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0819  aspartate dehydrogenase  36.67 
 
 
252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0412876  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1416  Aspartate dehydrogenase  38.38 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.350472  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2354  aspartate dehydrogenase  36.7 
 
 
252 aa  155  8e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0766  hypothetical protein  33.2 
 
 
259 aa  146  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00261979 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1240  aspartate dehydrogenase  35.87 
 
 
272 aa  145  5e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0500  aspartate dehydrogenase  34.08 
 
 
252 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.431353  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4503  L-aspartate dehydrogenase  32.21 
 
 
267 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.812861 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4635  L-aspartate dehydrogenase  32.21 
 
 
267 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.274384  normal  0.0742078 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1665  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  34.96 
 
 
252 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.643155  hitchhiker  0.00000000000624086 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3576  L-aspartate dehydrogenase  31.88 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0854934  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4240  L-aspartate dehydrogenase  31.46 
 
 
269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1256  L-aspartate dehydrogenase  32.71 
 
 
263 aa  125  6e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.428363  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3665  L-aspartate dehydrogenase  30.57 
 
 
275 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4702  L-aspartate dehydrogenase  30.57 
 
 
275 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000199944  normal  0.165404 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5598  L-aspartate dehydrogenase  30.57 
 
 
275 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.617624 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0182  L-aspartate dehydrogenase  31.09 
 
 
276 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4561  L-aspartate dehydrogenase  30.19 
 
 
275 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166685  hitchhiker  0.00306473 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4096  L-aspartate dehydrogenase  30.19 
 
 
275 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1041  aspartate dehydrogenase  33.01 
 
 
265 aa  122  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0147  putative L-aspartate dehydrogenase  32.96 
 
 
272 aa  121  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1582  L-aspartate dehydrogenase  34.89 
 
 
244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00462542  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3166  L-aspartate dehydrogenase  29.76 
 
 
264 aa  118  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3991  L-aspartate dehydrogenase  31.44 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123605  normal  0.0295536 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1112  L-aspartate dehydrogenase  29.66 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0146525  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0824  aspartate dehydrogenase  30.08 
 
 
270 aa  115  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00374726  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01727  L-aspartate dehydrogenase  29.67 
 
 
268 aa  115  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3686  L-aspartate dehydrogenase  28.95 
 
 
267 aa  115  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.585588  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7066  L-aspartate dehydrogenase  31.09 
 
 
276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218064  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2124  aspartate dehydrogenase  28.52 
 
 
261 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.231784  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0952  L-aspartate dehydrogenase  27.72 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0141  L-aspartate dehydrogenase  31.84 
 
 
265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1494  L-aspartate dehydrogenase  31.9 
 
 
271 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4396  aspartate dehydrogenase  30.98 
 
 
268 aa  108  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3958  L-aspartate dehydrogenase  27.86 
 
 
264 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1186  L-aspartate dehydrogenase  34.91 
 
 
241 aa  105  7e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0588  L-aspartate dehydrogenase  31.9 
 
 
271 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0979  L-aspartate dehydrogenase  31.9 
 
 
271 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00837942  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1241  L-aspartate dehydrogenase  31.9 
 
 
271 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1314  L-aspartate dehydrogenase  31.9 
 
 
271 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243465  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0312  L-aspartate dehydrogenase  31.9 
 
 
271 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0379705  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1451  L-aspartate dehydrogenase  30.74 
 
 
253 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2501  L-aspartate dehydrogenase  31.9 
 
 
271 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1329  L-aspartate dehydrogenase  31.9 
 
 
271 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1148  L-aspartate dehydrogenase  32.87 
 
 
241 aa  102  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3108  aspartate dehydrogenase  25.77 
 
 
257 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1595  L-aspartate dehydrogenase  27.72 
 
 
262 aa  87.4  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5291  aspartate dehydrogenase  26.85 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00146413  normal  0.0452822 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0532  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.2 
 
 
512 aa  76.3  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.147571  normal  0.119991 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0239  aspartate dehydrogenase  27.55 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9150  dinucleotide-utilizing enzyme  25.99 
 
 
257 aa  59.7  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  34.07 
 
 
370 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  29.35 
 
 
358 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  32.26 
 
 
359 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  29.21 
 
 
379 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  27.47 
 
 
336 aa  46.6  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  25 
 
 
340 aa  45.4  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  27.56 
 
 
359 aa  45.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  28.89 
 
 
357 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  31.11 
 
 
380 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  29.67 
 
 
387 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  26.74 
 
 
330 aa  43.1  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  30.3 
 
 
348 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.47 
 
 
330 aa  43.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0182  oxidoreductase domain-containing protein  30.57 
 
 
335 aa  42.7  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.53393  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.47 
 
 
334 aa  42.7  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4570  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  27.12 
 
 
336 aa  42.7  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0690283  normal  0.180174 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4437  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  27.12 
 
 
336 aa  42.7  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  30.34 
 
 
350 aa  42.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>