64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3108 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3108  aspartate dehydrogenase  100 
 
 		 257 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1041  aspartate dehydrogenase  42.97 
 
 		 265 aa  199  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01727  L-aspartate dehydrogenase  44.49 
 
 		 268 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3686  L-aspartate dehydrogenase  45.56 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.585588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3576  L-aspartate dehydrogenase  42.97 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0854934  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3958  L-aspartate dehydrogenase  44.92 
 
 		 264 aa  192  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4503  L-aspartate dehydrogenase  42.97 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.812861 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4635  L-aspartate dehydrogenase  42.97 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.274384  normal  0.0742078 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4702  L-aspartate dehydrogenase  41.79 
 
 		 275 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000199944  normal  0.165404 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5598  L-aspartate dehydrogenase  41.79 
 
 		 275 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.617624 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3665  L-aspartate dehydrogenase  41.79 
 
 		 275 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4240  L-aspartate dehydrogenase  41.35 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4561  L-aspartate dehydrogenase  41.13 
 
 		 275 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166685  hitchhiker  0.00306473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0952  L-aspartate dehydrogenase  43.91 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0141  L-aspartate dehydrogenase  45.42 
 
 		 265 aa  186  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4096  L-aspartate dehydrogenase  40.75 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0824  aspartate dehydrogenase  38.7 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00374726  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1112  L-aspartate dehydrogenase  41.04 
 
 		 271 aa  185  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0146525  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0182  L-aspartate dehydrogenase  39.55 
 
 		 276 aa  178  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1494  L-aspartate dehydrogenase  41.79 
 
 		 271 aa  176  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1451  L-aspartate dehydrogenase  47.88 
 
 		 253 aa  175  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2501  L-aspartate dehydrogenase  41.79 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3991  L-aspartate dehydrogenase  40.75 
 
 		 276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123605  normal  0.0295536 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0979  L-aspartate dehydrogenase  41.42 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00837942  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1241  L-aspartate dehydrogenase  41.42 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1314  L-aspartate dehydrogenase  41.42 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243465  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0588  L-aspartate dehydrogenase  41.42 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1329  L-aspartate dehydrogenase  41.42 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0312  L-aspartate dehydrogenase  41.42 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0379705  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7066  L-aspartate dehydrogenase  39.55 
 
 		 276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3166  L-aspartate dehydrogenase  42.57 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0239  aspartate dehydrogenase  40.7 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4396  aspartate dehydrogenase  37.64 
 
 		 268 aa  148  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1681  L-aspartate dehydrogenase  34.46 
 
 		 271 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000249643  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1256  L-aspartate dehydrogenase  35.48 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.428363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5291  aspartate dehydrogenase  39.02 
 
 		 270 aa  138  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00146413  normal  0.0452822 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1595  L-aspartate dehydrogenase  42.11 
 
 		 262 aa  135  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1866  L-aspartate dehydrogenase  33.21 
 
 		 271 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.306299 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1416  Aspartate dehydrogenase  36.6 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.350472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1240  aspartate dehydrogenase  30.8 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0848  L-aspartate dehydrogenase  28.09 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0242  aspartate dehydrogenase  32.33 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0148  L-aspartate dehydrogenase  29.62 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1148  L-aspartate dehydrogenase  30.27 
 
 		 241 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0845  L-aspartate dehydrogenase  29.23 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0766  hypothetical protein  32.4 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00261979 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1758  L-aspartate dehydrogenase  29.62 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.99388  normal  0.0655973 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2777  Aspartate dehydrogenase  31.3 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0362  Aspartate dehydrogenase  29.76 
 
 		 249 aa  98.6  8e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0819  aspartate dehydrogenase  31.23 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0412876  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1186  L-aspartate dehydrogenase  29.5 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0147  putative L-aspartate dehydrogenase  30.45 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1607  L-aspartate dehydrogenase  25.77 
 
 		 267 aa  93.6  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00593098  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2124  aspartate dehydrogenase  27.31 
 
 		 261 aa  90.1  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.231784  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2354  aspartate dehydrogenase  30.12 
 
 		 252 aa  86.7  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0500  aspartate dehydrogenase  28.74 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.431353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1582  L-aspartate dehydrogenase  26.09 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00462542  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1665  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.46 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.643155  hitchhiker  0.00000000000624086 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9150  dinucleotide-utilizing enzyme  31.66 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3282  dihydrodipicolinate reductase  32.39 
 
 		 358 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.522617  normal  0.898974 
 
 
-
 
NC_002950  PG0806  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.56 
 
 		 301 aa  44.7  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4922  dihydrodipicolinate reductase  39.02 
 
 		 358 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437676 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0532  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  25.69 
 
 		 512 aa  43.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.147571  normal  0.119991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1824  dihydrodipicolinate reductase  38.67 
 
 		 358 aa  42  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>