58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9150 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9150  dinucleotide-utilizing enzyme  100 
 
 		 257 aa  510  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1866  L-aspartate dehydrogenase  30.86 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.306299 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1681  L-aspartate dehydrogenase  27.76 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000249643  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3958  L-aspartate dehydrogenase  32.21 
 
 		 264 aa  85.9  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1186  L-aspartate dehydrogenase  25.51 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1148  L-aspartate dehydrogenase  25.51 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1416  Aspartate dehydrogenase  39.39 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.350472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1240  aspartate dehydrogenase  28.49 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3108  aspartate dehydrogenase  31.66 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0141  L-aspartate dehydrogenase  33.89 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0362  Aspartate dehydrogenase  25.43 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0766  hypothetical protein  28.5 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00261979 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2354  aspartate dehydrogenase  30.37 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3576  L-aspartate dehydrogenase  28.87 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0854934  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5598  L-aspartate dehydrogenase  28.74 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.617624 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0819  aspartate dehydrogenase  31.58 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0412876  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4702  L-aspartate dehydrogenase  28.74 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000199944  normal  0.165404 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3665  L-aspartate dehydrogenase  28.74 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0500  aspartate dehydrogenase  31.48 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.431353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2777  Aspartate dehydrogenase  28.51 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4503  L-aspartate dehydrogenase  27.62 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.812861 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4635  L-aspartate dehydrogenase  27.62 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.274384  normal  0.0742078 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4561  L-aspartate dehydrogenase  28.35 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166685  hitchhiker  0.00306473 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4096  L-aspartate dehydrogenase  28.35 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_003296  RS01727  L-aspartate dehydrogenase  28.63 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0148  L-aspartate dehydrogenase  27.68 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1758  L-aspartate dehydrogenase  26.79 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.99388  normal  0.0655973 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0242  aspartate dehydrogenase  32.31 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1112  L-aspartate dehydrogenase  28.63 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0146525  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0182  L-aspartate dehydrogenase  28.4 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0848  L-aspartate dehydrogenase  28.89 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0824  aspartate dehydrogenase  28.1 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00374726  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3166  L-aspartate dehydrogenase  29.11 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1665  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  26.54 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.643155  hitchhiker  0.00000000000624086 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4240  L-aspartate dehydrogenase  25.88 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1256  L-aspartate dehydrogenase  26.07 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.428363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7066  L-aspartate dehydrogenase  28.4 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1582  L-aspartate dehydrogenase  27.33 
 
 		 244 aa  62  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00462542  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3991  L-aspartate dehydrogenase  28.74 
 
 		 276 aa  62  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123605  normal  0.0295536 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0845  L-aspartate dehydrogenase  27.04 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0147  putative L-aspartate dehydrogenase  31.68 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1494  L-aspartate dehydrogenase  39.56 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0952  L-aspartate dehydrogenase  27.87 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1607  L-aspartate dehydrogenase  25.99 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00593098  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3686  L-aspartate dehydrogenase  27.5 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.585588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2501  L-aspartate dehydrogenase  40.66 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1041  aspartate dehydrogenase  32.95 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0979  L-aspartate dehydrogenase  39.56 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00837942  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1241  L-aspartate dehydrogenase  39.56 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1314  L-aspartate dehydrogenase  39.56 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243465  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0588  L-aspartate dehydrogenase  39.56 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0312  L-aspartate dehydrogenase  39.56 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0379705  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1329  L-aspartate dehydrogenase  39.56 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0239  aspartate dehydrogenase  38.46 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4396  aspartate dehydrogenase  26.75 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2124  aspartate dehydrogenase  24.05 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.231784  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5291  aspartate dehydrogenase  33.02 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00146413  normal  0.0452822 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1451  L-aspartate dehydrogenase  33.52 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>