68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0148 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0148  L-aspartate dehydrogenase  100 
 
 
267 aa  532  1e-150  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0845  L-aspartate dehydrogenase  96.63 
 
 
267 aa  518  1e-146  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1758  L-aspartate dehydrogenase  95.13 
 
 
267 aa  511  1e-144  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.99388  normal  0.0655973 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1607  L-aspartate dehydrogenase  79.4 
 
 
267 aa  432  1e-120  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00593098  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0848  L-aspartate dehydrogenase  62.17 
 
 
266 aa  349  3e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1866  L-aspartate dehydrogenase  43.22 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.306299 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0242  aspartate dehydrogenase  39.93 
 
 
269 aa  191  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1681  L-aspartate dehydrogenase  43.22 
 
 
271 aa  187  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000249643  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0362  Aspartate dehydrogenase  41.95 
 
 
249 aa  178  8e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2777  Aspartate dehydrogenase  40.45 
 
 
255 aa  178  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1416  Aspartate dehydrogenase  40.07 
 
 
302 aa  169  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.350472  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0819  aspartate dehydrogenase  37.08 
 
 
252 aa  166  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0412876  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2354  aspartate dehydrogenase  40.82 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1240  aspartate dehydrogenase  37.59 
 
 
272 aa  159  5e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0766  hypothetical protein  35.66 
 
 
259 aa  150  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00261979 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0500  aspartate dehydrogenase  37.13 
 
 
252 aa  145  6e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.431353  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3576  L-aspartate dehydrogenase  32.58 
 
 
268 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0854934  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4503  L-aspartate dehydrogenase  33.96 
 
 
267 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.812861 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4635  L-aspartate dehydrogenase  33.96 
 
 
267 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.274384  normal  0.0742078 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1665  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  36.09 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.643155  hitchhiker  0.00000000000624086 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1041  aspartate dehydrogenase  37.96 
 
 
265 aa  132  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01727  L-aspartate dehydrogenase  31.23 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0952  L-aspartate dehydrogenase  31.84 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0147  putative L-aspartate dehydrogenase  34.18 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0182  L-aspartate dehydrogenase  30.5 
 
 
276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3686  L-aspartate dehydrogenase  31.66 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.585588  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4240  L-aspartate dehydrogenase  31.3 
 
 
269 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3166  L-aspartate dehydrogenase  31.35 
 
 
264 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3665  L-aspartate dehydrogenase  32.17 
 
 
275 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5598  L-aspartate dehydrogenase  32.17 
 
 
275 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.617624 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4702  L-aspartate dehydrogenase  32.17 
 
 
275 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000199944  normal  0.165404 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7066  L-aspartate dehydrogenase  31.13 
 
 
276 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218064  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4096  L-aspartate dehydrogenase  31.78 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4396  aspartate dehydrogenase  32.82 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4561  L-aspartate dehydrogenase  31.78 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166685  hitchhiker  0.00306473 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1256  L-aspartate dehydrogenase  33.8 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.428363  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0141  L-aspartate dehydrogenase  32.57 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0824  aspartate dehydrogenase  31.94 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00374726  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2124  aspartate dehydrogenase  29.81 
 
 
261 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.231784  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1582  L-aspartate dehydrogenase  37.5 
 
 
244 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00462542  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1112  L-aspartate dehydrogenase  34.47 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0146525  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3958  L-aspartate dehydrogenase  30.08 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3991  L-aspartate dehydrogenase  31.92 
 
 
276 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123605  normal  0.0295536 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1148  L-aspartate dehydrogenase  34.27 
 
 
241 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1451  L-aspartate dehydrogenase  32.34 
 
 
253 aa  106  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1494  L-aspartate dehydrogenase  30.38 
 
 
271 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1186  L-aspartate dehydrogenase  34.13 
 
 
241 aa  105  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1329  L-aspartate dehydrogenase  30.77 
 
 
271 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0979  L-aspartate dehydrogenase  30.77 
 
 
271 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00837942  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1241  L-aspartate dehydrogenase  30.77 
 
 
271 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1314  L-aspartate dehydrogenase  30.77 
 
 
271 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243465  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0588  L-aspartate dehydrogenase  30.77 
 
 
271 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0312  L-aspartate dehydrogenase  30.77 
 
 
271 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0379705  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2501  L-aspartate dehydrogenase  30.77 
 
 
271 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3108  aspartate dehydrogenase  29.62 
 
 
257 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1595  L-aspartate dehydrogenase  30.96 
 
 
262 aa  98.2  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5291  aspartate dehydrogenase  29.11 
 
 
270 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00146413  normal  0.0452822 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0239  aspartate dehydrogenase  28.57 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0532  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.37 
 
 
512 aa  83.2  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.147571  normal  0.119991 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9150  dinucleotide-utilizing enzyme  27.68 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 
358 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  31.18 
 
 
359 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  32.67 
 
 
330 aa  47.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  34.62 
 
 
323 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  34.62 
 
 
324 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  27.97 
 
 
330 aa  43.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4570  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  27.78 
 
 
336 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0690283  normal  0.180174 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4437  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  27.78 
 
 
336 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>