68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0845 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0845  L-aspartate dehydrogenase  100 
 
 
267 aa  535  1e-151  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0148  L-aspartate dehydrogenase  96.63 
 
 
267 aa  518  1e-146  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1758  L-aspartate dehydrogenase  92.51 
 
 
267 aa  500  1e-140  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.99388  normal  0.0655973 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1607  L-aspartate dehydrogenase  79.78 
 
 
267 aa  430  1e-119  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00593098  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0848  L-aspartate dehydrogenase  61.42 
 
 
266 aa  348  7e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1866  L-aspartate dehydrogenase  42.49 
 
 
271 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.306299 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0242  aspartate dehydrogenase  38.81 
 
 
269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1681  L-aspartate dehydrogenase  42.12 
 
 
271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000249643  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2777  Aspartate dehydrogenase  41.2 
 
 
255 aa  183  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0362  Aspartate dehydrogenase  40.45 
 
 
249 aa  169  4e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1416  Aspartate dehydrogenase  40.45 
 
 
302 aa  167  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.350472  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0819  aspartate dehydrogenase  35.96 
 
 
252 aa  164  9e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0412876  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2354  aspartate dehydrogenase  39.7 
 
 
252 aa  159  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1240  aspartate dehydrogenase  36.13 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0766  hypothetical protein  35.66 
 
 
259 aa  151  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00261979 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0500  aspartate dehydrogenase  36.03 
 
 
252 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.431353  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4503  L-aspartate dehydrogenase  32.84 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.812861 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4635  L-aspartate dehydrogenase  32.84 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.274384  normal  0.0742078 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3576  L-aspartate dehydrogenase  31.09 
 
 
268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0854934  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1665  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  35.71 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.643155  hitchhiker  0.00000000000624086 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1041  aspartate dehydrogenase  34.88 
 
 
265 aa  129  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01727  L-aspartate dehydrogenase  30.11 
 
 
268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0147  putative L-aspartate dehydrogenase  33.45 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0952  L-aspartate dehydrogenase  30.71 
 
 
267 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3686  L-aspartate dehydrogenase  30.5 
 
 
267 aa  125  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.585588  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3166  L-aspartate dehydrogenase  30.56 
 
 
264 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0182  L-aspartate dehydrogenase  29.34 
 
 
276 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4240  L-aspartate dehydrogenase  29.77 
 
 
269 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4096  L-aspartate dehydrogenase  31.01 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4561  L-aspartate dehydrogenase  31.01 
 
 
275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166685  hitchhiker  0.00306473 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4396  aspartate dehydrogenase  32.43 
 
 
268 aa  119  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2124  aspartate dehydrogenase  30.19 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.231784  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7066  L-aspartate dehydrogenase  29.96 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218064  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3665  L-aspartate dehydrogenase  31.01 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4702  L-aspartate dehydrogenase  31.01 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000199944  normal  0.165404 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5598  L-aspartate dehydrogenase  31.01 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.617624 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1256  L-aspartate dehydrogenase  34.27 
 
 
263 aa  115  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.428363  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0824  aspartate dehydrogenase  30.8 
 
 
270 aa  115  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00374726  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3991  L-aspartate dehydrogenase  31.15 
 
 
276 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123605  normal  0.0295536 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3958  L-aspartate dehydrogenase  31.98 
 
 
264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1582  L-aspartate dehydrogenase  36.57 
 
 
244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00462542  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1112  L-aspartate dehydrogenase  30.62 
 
 
271 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0146525  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0141  L-aspartate dehydrogenase  31.19 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1186  L-aspartate dehydrogenase  34.13 
 
 
241 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1148  L-aspartate dehydrogenase  34.27 
 
 
241 aa  105  6e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1494  L-aspartate dehydrogenase  30 
 
 
271 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2501  L-aspartate dehydrogenase  30.38 
 
 
271 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1451  L-aspartate dehydrogenase  31.97 
 
 
253 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3108  aspartate dehydrogenase  29.23 
 
 
257 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1329  L-aspartate dehydrogenase  30.38 
 
 
271 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0979  L-aspartate dehydrogenase  30.38 
 
 
271 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00837942  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1241  L-aspartate dehydrogenase  30.38 
 
 
271 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1314  L-aspartate dehydrogenase  30.38 
 
 
271 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243465  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0588  L-aspartate dehydrogenase  30.38 
 
 
271 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0312  L-aspartate dehydrogenase  30.38 
 
 
271 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0379705  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1595  L-aspartate dehydrogenase  30.46 
 
 
262 aa  99  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5291  aspartate dehydrogenase  28.02 
 
 
270 aa  85.9  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00146413  normal  0.0452822 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0532  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.16 
 
 
512 aa  83.6  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.147571  normal  0.119991 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0239  aspartate dehydrogenase  27.8 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9150  dinucleotide-utilizing enzyme  27.04 
 
 
257 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  31.18 
 
 
359 aa  47  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  24.14 
 
 
358 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  38.04 
 
 
324 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  38.04 
 
 
323 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  31.13 
 
 
330 aa  46.2  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4570  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  27.59 
 
 
336 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0690283  normal  0.180174 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4437  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  27.59 
 
 
336 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0182  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
335 aa  42.7  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.53393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>