62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1416 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1416  Aspartate dehydrogenase  100 
 
 		 302 aa  598  1e-170  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.350472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2777  Aspartate dehydrogenase  62.85 
 
 		 255 aa  332  5e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0819  aspartate dehydrogenase  55.56 
 
 		 252 aa  296  3e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0412876  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2354  aspartate dehydrogenase  56.75 
 
 		 252 aa  287  1e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0500  aspartate dehydrogenase  53.97 
 
 		 252 aa  273  3e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.431353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1665  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  51.79 
 
 		 252 aa  247  2e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.643155  hitchhiker  0.00000000000624086 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0766  hypothetical protein  44.64 
 
 		 259 aa  222  7e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00261979 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0362  Aspartate dehydrogenase  41.83 
 
 		 249 aa  209  6e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0242  aspartate dehydrogenase  42.32 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0848  L-aspartate dehydrogenase  36.84 
 
 		 266 aa  175  7e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0148  L-aspartate dehydrogenase  40.07 
 
 		 267 aa  169  7e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0845  L-aspartate dehydrogenase  40.45 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1758  L-aspartate dehydrogenase  39.7 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.99388  normal  0.0655973 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1607  L-aspartate dehydrogenase  38.38 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00593098  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1866  L-aspartate dehydrogenase  38.6 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.306299 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1681  L-aspartate dehydrogenase  36.9 
 
 		 271 aa  159  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000249643  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1240  aspartate dehydrogenase  34.69 
 
 		 272 aa  145  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1148  L-aspartate dehydrogenase  34.52 
 
 		 241 aa  142  7e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1186  L-aspartate dehydrogenase  35.46 
 
 		 241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1582  L-aspartate dehydrogenase  37.62 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00462542  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1041  aspartate dehydrogenase  40.09 
 
 		 265 aa  125  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3108  aspartate dehydrogenase  36.6 
 
 		 257 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4503  L-aspartate dehydrogenase  34.88 
 
 		 267 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.812861 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4635  L-aspartate dehydrogenase  34.88 
 
 		 267 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.274384  normal  0.0742078 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0141  L-aspartate dehydrogenase  42.36 
 
 		 265 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3958  L-aspartate dehydrogenase  39.59 
 
 		 264 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0182  L-aspartate dehydrogenase  35.58 
 
 		 276 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01727  L-aspartate dehydrogenase  38.14 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4240  L-aspartate dehydrogenase  37.84 
 
 		 269 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1112  L-aspartate dehydrogenase  35.96 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0146525  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5598  L-aspartate dehydrogenase  38.38 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.617624 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4702  L-aspartate dehydrogenase  38.38 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000199944  normal  0.165404 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3665  L-aspartate dehydrogenase  38.38 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3686  L-aspartate dehydrogenase  32.96 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.585588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4561  L-aspartate dehydrogenase  31.79 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166685  hitchhiker  0.00306473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0824  aspartate dehydrogenase  33.49 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00374726  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4096  L-aspartate dehydrogenase  31.43 
 
 		 275 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0952  L-aspartate dehydrogenase  37.7 
 
 		 267 aa  105  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7066  L-aspartate dehydrogenase  35.58 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3166  L-aspartate dehydrogenase  33.73 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1256  L-aspartate dehydrogenase  34.33 
 
 		 263 aa  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.428363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1494  L-aspartate dehydrogenase  37.84 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3576  L-aspartate dehydrogenase  32.83 
 
 		 268 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0854934  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2124  aspartate dehydrogenase  30.68 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.231784  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3991  L-aspartate dehydrogenase  35.47 
 
 		 276 aa  96.3  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123605  normal  0.0295536 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2501  L-aspartate dehydrogenase  37.84 
 
 		 271 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4396  aspartate dehydrogenase  37.17 
 
 		 268 aa  95.9  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1329  L-aspartate dehydrogenase  37.3 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0979  L-aspartate dehydrogenase  37.3 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00837942  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1241  L-aspartate dehydrogenase  37.3 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1314  L-aspartate dehydrogenase  37.3 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243465  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0588  L-aspartate dehydrogenase  37.3 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0312  L-aspartate dehydrogenase  37.3 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0379705  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1451  L-aspartate dehydrogenase  34.87 
 
 		 253 aa  93.2  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0147  putative L-aspartate dehydrogenase  33.64 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1595  L-aspartate dehydrogenase  36.95 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9150  dinucleotide-utilizing enzyme  39.39 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5291  aspartate dehydrogenase  31.58 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00146413  normal  0.0452822 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0532  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  35.34 
 
 		 512 aa  77  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.147571  normal  0.119991 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0239  aspartate dehydrogenase  32.45 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  34.44 
 
 		 379 aa  46.2  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  35.96 
 
 		 366 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>