243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflt017 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mflt017  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00428757  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0748  tRNA-Phe  95.83 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0039  tRNA-Phe  91.67 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0073  tRNA-Phe  91.67 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0011  tRNA-Phe  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443176  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0002  tRNA-Phe  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.133114  normal  0.804364 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0159  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.369913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2797  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS02241  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000057797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0070  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00525701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0021  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.824976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0060  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102319 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0006  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137166  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0001  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0354  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.570155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0169  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601595  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0136  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.740325  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0058  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0062  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2361  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.979776  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0028  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748301  normal  0.0311431 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2283  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00760405  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4594  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0003  tRNA-Phe  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0075  tRNA-Phe  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0075  tRNA-Phe  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283393  normal  0.209265 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60610  tRNA-Phe  88.33 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.820326  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna30  tRNA-Phe  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.319262  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0046  tRNA-Phe  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60620  tRNA-Phe  88.33 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.787941  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0018  tRNA-Phe  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5887  tRNA-Phe  88.33 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0049  tRNA-Phe  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000790035  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0076  tRNA-Phe  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148621  hitchhiker  0.00000000192681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0086  tRNA-Phe  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0056  tRNA-Phe  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0075  tRNA-Phe  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68030  tRNA-Phe  88.33 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351538  hitchhiker  0.008643 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0055  tRNA-Phe  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000546221  normal  0.72027 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0072  tRNA-Phe  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0389238  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0005  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.497838 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  88.14 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.856426  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  88.14 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.856426  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  88.14 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0065  tRNA-Phe  88.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0010  tRNA-Phe  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0066  tRNA-Phe  88.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0398911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0022  tRNA-Phe  88.14 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.052558  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0566  tRNA-Phe  88.14 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0036  tRNA-Phe  88.14 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0089  tRNA-Phe  88.14 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.837843  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0442  tRNA-Phe  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0080  tRNA-Phe  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000484766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2270  tRNA-Phe  88.89 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.105735  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2143  tRNA-Phe  88.89 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0289  tRNA-Phe  88.89 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1750  tRNA-Phe  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1586  tRNA-Phe  88.89 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.158615  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0043  tRNA-Phe  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.57647 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0044  tRNA-Phe  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1570  tRNA-Phe  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1596  tRNA-Phe  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250101  normal  0.561376 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1605  tRNA-Phe  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.841854 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1357  tRNA-Phe  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.503492  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0004  tRNA-Phe  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t03  tRNA-Phe  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.485115  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0082  tRNA-Phe  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0264  tRNA-Phe  89.8 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00100178  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0002  tRNA-Phe  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0029  tRNA-Phe  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0001  tRNA-Phe  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238457 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0014  tRNA-Phe  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.58788  hitchhiker  0.00239858 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0052  tRNA-Phe  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000909923  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0055  tRNA-Phe  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0059  tRNA-Phe  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.383057  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0015  tRNA-Phe  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.312952  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0037  tRNA-Phe  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0008  tRNA-Phe  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0053  tRNA-Phe  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.744233  normal  0.828825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t60  tRNA-Phe  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0001  tRNA-Phe  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0826979  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0005  tRNA-Phe  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0005  tRNA-Phe  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0032  tRNA-Phe  85.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA76  tRNA-Phe  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0007  tRNA-Phe  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412685  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R9  tRNA-Phe  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0016  tRNA-Phe  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000022275  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0010  tRNA-Phe  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0024  tRNA-Phe  89.13 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.117036 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0035  tRNA-Phe  85.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0179  tRNA-Phe  85.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0628271  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0010  tRNA-Phe  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00225756  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0006  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0067  tRNA-Phe  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0034  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000955426  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0113  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465386  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>