64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0573 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0573  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  751    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.973448  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0330  hypothetical protein  75.41 
 
 
381 aa  578  1e-164  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0902342  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1412  hypothetical protein  75.69 
 
 
381 aa  578  1e-164  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.208559  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0507  hypothetical protein  74.86 
 
 
382 aa  578  1e-164  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0163  hypothetical protein  57.42 
 
 
361 aa  420  1e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0163647  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0574  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components  31.66 
 
 
364 aa  164  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0376  chaperonin GroEL  39.05 
 
 
412 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0737  hypothetical protein  37.5 
 
 
421 aa  92  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107641  normal  0.209363 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0851  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.57 
 
 
328 aa  89.4  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0219644  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1077  hypothetical protein  33.33 
 
 
413 aa  88.2  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618924  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1032  putative aliphatic sulfonate binding protein precursor  27.64 
 
 
327 aa  87  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0520  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.97 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0085  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.6 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0167  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.5 
 
 
385 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2205  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  28.5 
 
 
332 aa  63.2  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142056  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1981  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  23.79 
 
 
335 aa  62.8  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169392  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5823  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  26.32 
 
 
387 aa  62.8  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.437918  normal  0.494999 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2131  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.48 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603164  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5147  extracellular solute-binding protein family 3  24.49 
 
 
326 aa  57  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0576524  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1540  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.19 
 
 
396 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4507  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  24.9 
 
 
326 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1901  twin-arginine translocation pathway signal  23.2 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00273857  hitchhiker  0.00000000000094829 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0100  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.6 
 
 
396 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227114  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6336  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.9 
 
 
396 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2149  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems protein  24.22 
 
 
341 aa  54.3  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6747  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system periplasmic component  24.52 
 
 
396 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.248513 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6513  twin-arginine translocation pathway signal  24.52 
 
 
396 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.47119  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3636  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  25.72 
 
 
401 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429182  normal  0.917862 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1735  twin-arginine translocation pathway signal  22.64 
 
 
319 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2804  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  22.58 
 
 
345 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2097  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.36 
 
 
401 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0308  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 
414 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2932  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  22.4 
 
 
346 aa  50.4  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2834  twin-arginine translocation pathway signal  21.89 
 
 
411 aa  49.7  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.960299 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2276  ABC transporter, periplasmic binding protein  24.64 
 
 
401 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.278656  normal  0.376143 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0337  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.22 
 
 
335 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2629  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  21.12 
 
 
407 aa  47.4  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.272886  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4675  ABC transporter substrate-binding protein  22.3 
 
 
338 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4146  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.63 
 
 
318 aa  46.6  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.287587  normal  0.0410042 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5036  ABC transporter substrate-binding protein  22.3 
 
 
325 aa  46.6  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.647768  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4340  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.92 
 
 
320 aa  46.6  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0694  ABC taurine transporter, periplasmic ligand binding protein  27.1 
 
 
363 aa  46.2  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101106  normal  0.0226571 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0144  twin-arginine translocation pathway signal  31.82 
 
 
413 aa  46.2  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4900  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.3 
 
 
335 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0033  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  25.49 
 
 
417 aa  44.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4373  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  29.41 
 
 
352 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742305  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4901  putative ABC transporter, substrate-binding protein  21.86 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3674  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.09 
 
 
318 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  normal  0.880422 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4935  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  21.15 
 
 
325 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3606  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  23.92 
 
 
323 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4533  ABC transporter, substrate-binding protein  21.95 
 
 
335 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1788  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, aliphatic sulfonates family  23.7 
 
 
323 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  24.01 
 
 
430 aa  43.5  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3487  twin-arginine translocation pathway signal  25.7 
 
 
408 aa  43.5  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3309  putative alkanesulfonate ABC transporter, substrate binding protein  25.98 
 
 
313 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.891866  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3874  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.21 
 
 
343 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3795  twin-arginine translocation pathway signal  25.7 
 
 
408 aa  43.5  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.296999 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4613  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.22 
 
 
335 aa  43.1  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0825  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.23 
 
 
335 aa  43.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.262946  normal  0.791109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3484  twin-arginine translocation pathway signal:ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.93 
 
 
327 aa  43.1  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224965  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36967  predicted protein  25.07 
 
 
307 aa  43.1  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.177714  normal  0.228714 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  23.89 
 
 
430 aa  42.7  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  23.89 
 
 
430 aa  42.7  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2802  NLPA lipoprotein  23.57 
 
 
327 aa  42.7  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000138117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>