62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0574 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0574  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components  100 
 
 		 364 aa  739    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0507  hypothetical protein  33.68 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0163  hypothetical protein  30.14 
 
 		 361 aa  166  4e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0163647  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0573  hypothetical protein  31.07 
 
 		 367 aa  166  5e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.973448  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0330  hypothetical protein  30.51 
 
 		 381 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0902342  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1412  hypothetical protein  33.66 
 
 		 381 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.208559  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1077  hypothetical protein  23.04 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618924  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0376  chaperonin GroEL  29.48 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0737  hypothetical protein  21.64 
 
 		 421 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107641  normal  0.209363 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2932  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  27.12 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1032  putative aliphatic sulfonate binding protein precursor  22.59 
 
 		 327 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3636  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  22.95 
 
 		 401 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429182  normal  0.917862 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0851  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.61 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0219644  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3941  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.76 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0774649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2097  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  22.26 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3742  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 467 aa  52.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2276  ABC transporter, periplasmic binding protein  22.95 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.278656  normal  0.376143 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4404  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.76 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.116895 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0308  twin-arginine translocation pathway signal  21.57 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5674  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  26.85 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.679378 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6747  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system periplasmic component  23.05 
 
 		 396 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.248513 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6513  twin-arginine translocation pathway signal  23.05 
 
 		 396 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.47119  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1715  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.42 
 
 		 327 aa  50.1  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1257  putative regulatory protein NasS  22.64 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0276079  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0332  putative regulatory protein NasS  22.64 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0240199  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1760  putative regulatory protein  22.64 
 
 		 353 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0089  putative regulatory protein NasS  22.64 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.964988  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1091  putative regulatory protein NasS  22.64 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6336  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.37 
 
 		 396 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4373  nitrate transport protein, NrtC like protein  23.26 
 
 		 461 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4435  nitrate transporter, putative  23.26 
 
 		 461 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.210676 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1166  regulatory protein NasS, putative  22.45 
 
 		 353 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241228  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1047  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  25 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817619  normal  0.872745 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1981  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.71 
 
 		 335 aa  47.4  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2206  putative nitrate transporter component, NrtA  22.3 
 
 		 457 aa  47.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  23.43 
 
 		 460 aa  47.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  22.42 
 
 		 668 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0457  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  21.05 
 
 		 400 aa  47  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1339  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  24.65 
 
 		 353 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1672  putative regulatory protein  22.3 
 
 		 353 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34510  hypothetical protein  21.25 
 
 		 399 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0531773  normal  0.0856491 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5793  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  25 
 
 		 350 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1735  twin-arginine translocation pathway signal  23.73 
 
 		 319 aa  46.6  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0247  nitrate transport ATP-binding protein  22.3 
 
 		 353 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3857  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  25 
 
 		 350 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4511  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25 
 
 		 353 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000302779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7929  ABC transporter substrate binding protein  24.46 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4143  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.32 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553251 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2834  twin-arginine translocation pathway signal  22.22 
 
 		 411 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.960299 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3446  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  25.4 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3487  putative nitrate transporter component, nrtA  22.94 
 
 		 464 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0085  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  28.1 
 
 		 350 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1973  NLPA lipoprotein  21.26 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000524772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4678  ABC-type bicarbonate transport system substrate-binding protein  22.79 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2931  hypothetical protein  20.31 
 
 		 399 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0955897  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2205  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  22.37 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142056  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0033  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  33.98 
 
 		 417 aa  43.5  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0292  ABC transporter nitrate-binding protein  21.69 
 
 		 451 aa  43.5  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2149  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems protein  21.11 
 
 		 341 aa  43.1  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0997  ABC transporter nitrate-binding protein  21.76 
 
 		 457 aa  42.7  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1540  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  20.22 
 
 		 396 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0100  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  20.22 
 
 		 396 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227114  normal  0.537489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>