39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0376 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0376  chaperonin GroEL  100 
 
 		 412 aa  843    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1077  hypothetical protein  42.65 
 
 		 413 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618924  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0737  hypothetical protein  42.86 
 
 		 421 aa  289  7e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107641  normal  0.209363 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0163  hypothetical protein  37.99 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0163647  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0507  hypothetical protein  37.57 
 
 		 382 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0330  hypothetical protein  37.57 
 
 		 381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0902342  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0573  hypothetical protein  39.05 
 
 		 367 aa  113  5e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.973448  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1412  hypothetical protein  38.69 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.208559  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0574  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components  29.76 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0520  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.18 
 
 		 323 aa  62  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1735  twin-arginine translocation pathway signal  31.68 
 
 		 319 aa  53.1  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2097  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  31 
 
 		 401 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1920  NMT1/THI5 like domain protein  29.36 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3636  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  31 
 
 		 401 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429182  normal  0.917862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2276  ABC transporter, periplasmic binding protein  31 
 
 		 401 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.278656  normal  0.376143 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1901  twin-arginine translocation pathway signal  29.59 
 
 		 321 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00273857  hitchhiker  0.00000000000094829 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3869  twin-arginine translocation pathway signal  29.63 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0223785 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0100  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227114  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3487  twin-arginine translocation pathway signal  30.56 
 
 		 408 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3795  twin-arginine translocation pathway signal  30.56 
 
 		 408 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.296999 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0144  twin-arginine translocation pathway signal  31.18 
 
 		 413 aa  50.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1540  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.23 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2629  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  31.11 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.272886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34510  hypothetical protein  37.7 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0531773  normal  0.0856491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2931  hypothetical protein  37.7 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0955897  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0437  extracellular solute-binding protein family 3  30.53 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0271798  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5823  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  30 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.437918  normal  0.494999 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6336  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.7 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1297  putative substrate-binding protein of aliphatic sulfonate ABC transporter  26.51 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2834  twin-arginine translocation pathway signal  41.18 
 
 		 411 aa  45.8  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.960299 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  29.41 
 
 		 460 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2205  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  28.57 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142056  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0851  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.56 
 
 		 328 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0219644  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6747  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system periplasmic component  28.7 
 
 		 396 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.248513 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6513  twin-arginine translocation pathway signal  28.7 
 
 		 396 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.47119  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0308  twin-arginine translocation pathway signal  28.89 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0457  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  27.68 
 
 		 400 aa  43.9  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0292  ABC transporter nitrate-binding protein  29.27 
 
 		 451 aa  43.5  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3487  putative nitrate transporter component, nrtA  30.38 
 
 		 464 aa  43.1  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>