29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0737 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0737  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  843    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107641  normal  0.209363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1077  hypothetical protein  50.12 
 
 		 413 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618924  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0376  chaperonin GroEL  42.89 
 
 		 412 aa  318  1e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0163  hypothetical protein  32.49 
 
 		 361 aa  103  6e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0163647  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0507  hypothetical protein  34.32 
 
 		 382 aa  94.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0573  hypothetical protein  37.5 
 
 		 367 aa  92.4  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.973448  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0330  hypothetical protein  34.34 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0902342  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1412  hypothetical protein  33.93 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.208559  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0574  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components  22.16 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1297  putative substrate-binding protein of aliphatic sulfonate ABC transporter  35.19 
 
 		 357 aa  51.2  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1155  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.23 
 
 		 313 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7929  ABC transporter substrate binding protein  26.79 
 
 		 335 aa  47  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0520  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.4 
 
 		 323 aa  47  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0736  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.52 
 
 		 346 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  29.67 
 
 		 669 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2205  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  28.12 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142056  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1981  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  29.36 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  31.52 
 
 		 657 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1735  twin-arginine translocation pathway signal  30.95 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2206  putative nitrate transporter component, NrtA  32.97 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0409  putative substrate-binding protein of aliphatic sulfonate ABC transporter  33.62 
 
 		 348 aa  45.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.830213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0465  ABC transporter substrate-binding protein  28.57 
 
 		 342 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0160657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3487  putative nitrate transporter component, nrtA  34.57 
 
 		 464 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3972  ABC transporter nitrate-binding protein  32.05 
 
 		 471 aa  45.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1032  putative aliphatic sulfonate binding protein precursor  30.28 
 
 		 327 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0838  taurine transporter substrate binding subunit  34.34 
 
 		 320 aa  43.9  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2589  putative nitrate transporter component  31.58 
 
 		 475 aa  44.3  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200575 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  31.58 
 
 		 432 aa  43.5  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0292  ABC transporter nitrate-binding protein  32.1 
 
 		 451 aa  43.1  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>