35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1077 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1077  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  841    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618924  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0737  hypothetical protein  53.78 
 
 		 421 aa  386  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107641  normal  0.209363 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0376  chaperonin GroEL  42.65 
 
 		 412 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0163  hypothetical protein  30.5 
 
 		 361 aa  104  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0163647  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0507  hypothetical protein  32.14 
 
 		 382 aa  90.1  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0573  hypothetical protein  33.33 
 
 		 367 aa  88.2  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.973448  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1412  hypothetical protein  33.33 
 
 		 381 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.208559  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0330  hypothetical protein  32.14 
 
 		 381 aa  87  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0902342  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0574  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components  23.04 
 
 		 364 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3487  twin-arginine translocation pathway signal  31.68 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3795  twin-arginine translocation pathway signal  31.68 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.296999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3869  twin-arginine translocation pathway signal  30.69 
 
 		 408 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0223785 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1735  twin-arginine translocation pathway signal  36.62 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2834  twin-arginine translocation pathway signal  26.09 
 
 		 411 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.960299 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1644  twin-arginine translocation pathway signal  30.53 
 
 		 343 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.76466  decreased coverage  0.00621187 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1155  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.41 
 
 		 313 aa  49.7  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0033  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  28.26 
 
 		 417 aa  49.7  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2097  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.42 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3636  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  25.42 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429182  normal  0.917862 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0457  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  24.59 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0520  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.69 
 
 		 323 aa  47.4  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0308  twin-arginine translocation pathway signal  22.83 
 
 		 414 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2276  ABC transporter, periplasmic binding protein  24.58 
 
 		 401 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.278656  normal  0.376143 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0437  extracellular solute-binding protein family 3  28.42 
 
 		 319 aa  46.6  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0271798  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2149  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems protein  29.81 
 
 		 341 aa  46.6  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34510  hypothetical protein  21.56 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0531773  normal  0.0856491 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1411  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  29.29 
 
 		 320 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.214398 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0543  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  31.86 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2931  hypothetical protein  21.29 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0955897  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2629  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  25.66 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.272886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1130  twin-arginine translocation pathway signal  32.97 
 
 		 305 aa  44.3  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.471389  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2205  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  40 
 
 		 332 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142056  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1901  twin-arginine translocation pathway signal  26.14 
 
 		 321 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00273857  hitchhiker  0.00000000000094829 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0851  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.46 
 
 		 328 aa  43.1  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0219644  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0292  ABC transporter nitrate-binding protein  27.78 
 
 		 451 aa  43.1  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>