64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1412 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0330  hypothetical protein  92.39 
 
 		 381 aa  697    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0902342  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1412  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  773    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.208559  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0507  hypothetical protein  90.05 
 
 		 382 aa  680    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0573  hypothetical protein  75.96 
 
 		 367 aa  587  1e-166  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.973448  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0163  hypothetical protein  54.55 
 
 		 361 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0163647  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0574  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components  33.86 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0376  chaperonin GroEL  38.69 
 
 		 412 aa  110  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0737  hypothetical protein  33.93 
 
 		 421 aa  91.3  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107641  normal  0.209363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1077  hypothetical protein  33.33 
 
 		 413 aa  89  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618924  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0520  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.13 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0851  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.53 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0219644  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0085  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.91 
 
 		 350 aa  75.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1032  putative aliphatic sulfonate binding protein precursor  24.92 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2131  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.27 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603164  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2205  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.17 
 
 		 332 aa  72.8  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142056  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0167  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  24.69 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1981  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.36 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2834  twin-arginine translocation pathway signal  25.88 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.960299 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3674  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.04 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  normal  0.880422 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0308  twin-arginine translocation pathway signal  24.64 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4146  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.13 
 
 		 318 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.287587  normal  0.0410042 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2804  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.93 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2802  NLPA lipoprotein  22.88 
 
 		 327 aa  53.1  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000138117  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4340  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.88 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5147  extracellular solute-binding protein family 3  24.06 
 
 		 326 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0576524  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7929  ABC transporter substrate binding protein  21.98 
 
 		 335 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3487  twin-arginine translocation pathway signal  29.94 
 
 		 408 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4507  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  26.83 
 
 		 326 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3795  twin-arginine translocation pathway signal  29.94 
 
 		 408 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.296999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5823  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  25.37 
 
 		 387 aa  50.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.437918  normal  0.494999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1761  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  27.27 
 
 		 317 aa  50.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588538 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4250  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.34 
 
 		 317 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.125058  normal  0.0898326 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3267  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.34 
 
 		 317 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1901  twin-arginine translocation pathway signal  23.17 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00273857  hitchhiker  0.00000000000094829 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0033  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  26.45 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3869  twin-arginine translocation pathway signal  28.85 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0223785 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1735  twin-arginine translocation pathway signal  23 
 
 		 319 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4116  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.34 
 
 		 317 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2789  NLPA lipoprotein  22.4 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6336  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26 
 
 		 396 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3484  twin-arginine translocation pathway signal:ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  28.8 
 
 		 327 aa  47  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224965  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1540  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.14 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2952  NMT1/THI5 like domain protein  23.87 
 
 		 318 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1472  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  23.97 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3606  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.79 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2149  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems protein  20.7 
 
 		 341 aa  45.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31360  ABC transporter periplasmic aliphatic sulfonate-binding protein  26.13 
 
 		 323 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.694075  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6747  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system periplasmic component  25.5 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.248513 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  23.28 
 
 		 460 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6513  twin-arginine translocation pathway signal  25.5 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.47119  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0144  twin-arginine translocation pathway signal  31.82 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4373  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  25 
 
 		 352 aa  43.9  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0694  ABC taurine transporter, periplasmic ligand binding protein  23.24 
 
 		 363 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101106  normal  0.0226571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1791  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, aliphatic sulfonates family  25.68 
 
 		 329 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3636  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  25 
 
 		 401 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429182  normal  0.917862 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0409  putative substrate-binding protein of aliphatic sulfonate ABC transporter  22.13 
 
 		 348 aa  43.1  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.830213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0621  twin-arginine translocation pathway signal  26.94 
 
 		 305 aa  43.5  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000550698  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1788  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, aliphatic sulfonates family  22.52 
 
 		 323 aa  43.5  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4569  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.09 
 
 		 316 aa  43.1  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1130  twin-arginine translocation pathway signal  24.28 
 
 		 305 aa  43.1  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.471389  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2932  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  21.79 
 
 		 346 aa  43.1  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0041  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25 
 
 		 338 aa  42.7  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.487407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0122  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  24.84 
 
 		 345 aa  42.7  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.592711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1151  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic component  22.6 
 
 		 322 aa  42.7  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.220033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>