More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_R0007 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_R0007  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  228  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.146572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0055  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  228  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0551184  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0052  5S ribosomal RNA  91.26 
 
 		 115 bp  133  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.903426  normal  0.0492547 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0020  5S ribosomal RNA  91.26 
 
 		 115 bp  133  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00562128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna55  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 		 115 bp  75.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0884571  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0013  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 		 113 bp  75.8  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.118637  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna48  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 		 115 bp  75.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0243319  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0007  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 		 113 bp  75.8  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.951123  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0013  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 		 114 bp  75.8  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.149045  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0007  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 		 114 bp  75.8  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00219563  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6503  5S ribosomal RNA  92.45 
 
 		 119 bp  73.8  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4503  5S ribosomal RNA  92.45 
 
 		 119 bp  73.8  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4506  5S ribosomal RNA  92.45 
 
 		 119 bp  73.8  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6506  5S ribosomal RNA  92.45 
 
 		 119 bp  73.8  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0058  5S ribosomal RNA  92.45 
 
 		 114 bp  73.8  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0046  5S ribosomal RNA  92.45 
 
 		 114 bp  73.8  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0040  5S ribosomal RNA  92.45 
 
 		 115 bp  73.8  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0050  23S ribosomal RNA  92.45 
 
 		 115 bp  73.8  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0037  5S ribosomal RNA  92.45 
 
 		 114 bp  73.8  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.10728 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0022  5S ribosomal RNA  95.12 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0058  5S ribosomal RNA  90.57 
 
 		 114 bp  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.751089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0047  5S ribosomal RNA  90.57 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0060  5S ribosomal RNA  90.57 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.307461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0036  5S ribosomal RNA  90.57 
 
 		 114 bp  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.840936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  90.57 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0011  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.712208  hitchhiker  0.00122523 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0038  5S ribosomal RNA  90.57 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0086  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919882  normal  0.263092 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0012  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.702393  hitchhiker  0.00125226 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0045  5S ribosomal RNA  90.57 
 
 		 114 bp  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  90.57 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0006  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000380355  hitchhiker  0.00390757 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0081  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.258574 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0048  5S ribosomal RNA  92.86 
 
 		 115 bp  60  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46778  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0020  5S ribosomal RNA  92.86 
 
 		 115 bp  60  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0017  5S ribosomal RNA  86.15 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00334647  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0034  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0055  5S ribosomal RNA  86.15 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0028  5S ribosomal RNA  86.15 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000903183  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0053  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0106  5S ribosomal RNA  86.15 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0009  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 114 bp  58  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0007  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0012  5S ribosomal RNA  86.15 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0031  5S ribosomal RNA  86.15 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0005  5S ribosomal RNA  86.15 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.493215  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0063  5S ribosomal RNA  86.15 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00852672  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0060  5S ribosomal RNA  86.15 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0030  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 114 bp  58  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0014  5S ribosomal RNA  86.15 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0028  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0011  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0067  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0025  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 118 bp  56  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0005  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0068  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0024  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 122 bp  56  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0025  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0004  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  56  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0005  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  56  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0024  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  56  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0064  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  56  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0065  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  56  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0069  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  56  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0071  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0011  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 115 bp  56  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0060  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 118 bp  54  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0028  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.348714  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0053  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 121 bp  54  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0018  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 118 bp  54  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0004  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0016  5S ribosomal RNA  85.07 
 
 		 115 bp  54  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0035  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 118 bp  54  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0048  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 119 bp  52  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000922958  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0039  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0042  5S ribosomal RNA  86.21 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0020  5S ribosomal RNA  86.21 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12425  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0031  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 119 bp  52  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00046496  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0014  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.873356  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0026  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0041  5S ribosomal RNA  86.21 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0021  5S ribosomal RNA  86.21 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0053  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 119 bp  52  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.545293  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0009  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 119 bp  52  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0045  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 118 bp  52  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.367607  normal  0.064154 
 
 
-
 
NC_004310  BR_r01  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 126 bp  50.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_r04  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 126 bp  50.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.596836  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0010  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.629957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0078  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000574865  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0070  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.45639  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0010  5S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 115 bp  50.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0020  5S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 115 bp  50.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.8682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0055  5S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 115 bp  50.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.533028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0038  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000916251  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0057  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0060  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000527991  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0069  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107578  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0065  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133126  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0021  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000104076  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1017  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 123 bp  50.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>