More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_R0065 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_R0065  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  230  6e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133126  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0010  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  230  6e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.629957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0021  5S ribosomal RNA  99.14 
 
 		 116 bp  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000104076  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0078  5S ribosomal RNA  99.14 
 
 		 116 bp  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000574865  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0070  5S ribosomal RNA  99.14 
 
 		 116 bp  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.45639  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0016  5S ribosomal RNA  90.77 
 
 		 117 bp  81.8  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.384299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0005  5S ribosomal RNA  90.77 
 
 		 117 bp  81.8  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.52738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0049  5S ribosomal RNA  84.76 
 
 		 117 bp  81.8  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0033  5S ribosomal RNA  84.76 
 
 		 117 bp  81.8  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0076  5S ribosomal RNA  84.76 
 
 		 117 bp  81.8  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0052  5S ribosomal RNA  84.76 
 
 		 117 bp  81.8  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0020  5S ribosomal RNA  84.76 
 
 		 117 bp  81.8  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0018  5S ribosomal RNA  84.76 
 
 		 117 bp  81.8  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0092  5S ribosomal RNA  84.76 
 
 		 117 bp  81.8  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.214269  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0005  5S ribosomal RNA  84.76 
 
 		 117 bp  81.8  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0009  5S ribosomal RNA  90.62 
 
 		 114 bp  79.8  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0030  5S ribosomal RNA  90.62 
 
 		 114 bp  79.8  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0025  5S ribosomal RNA  92.45 
 
 		 117 bp  73.8  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.102792  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0036  5S ribosomal RNA  92.45 
 
 		 117 bp  73.8  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.484974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0050  5S ribosomal RNA  92.45 
 
 		 117 bp  73.8  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00973992  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0060  5S ribosomal RNA  92.45 
 
 		 117 bp  73.8  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136348  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0028  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  89.06 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0071  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0067  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0011  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0005  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0025  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0068  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0014  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  89.06 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0106  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0035  5S ribosomal RNA  86.67 
 
 		 116 bp  69.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0016  5S ribosomal RNA  86.67 
 
 		 116 bp  69.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0035  5S ribosomal RNA  86.67 
 
 		 116 bp  69.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0015  5S ribosomal RNA  86.67 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0034  5S ribosomal RNA  86.67 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0016  5S ribosomal RNA  86.67 
 
 		 116 bp  69.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0032  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0054  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0070  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.260067  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0037  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.047404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0022  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0069  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0059  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0022  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0044  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 132 bp  67.9  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0019  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 132 bp  67.9  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0025  5S ribosomal RNA  90.57 
 
 		 117 bp  65.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0315832  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0009  5S ribosomal RNA  90.57 
 
 		 117 bp  65.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0647002  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0016  5S ribosomal RNA  90.57 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  Gs5SA  5S ribosomal RNA  88.33 
 
 		 112 bp  63.9  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs5SB  5S ribosomal RNA  88.33 
 
 		 112 bp  63.9  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.271264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0055  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0072  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 115 bp  63.9  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0015  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  63.9  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0039  5S ribosomal RNA  88.33 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0063  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00852672  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0060  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0028  5S ribosomal RNA  88.33 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349072  normal  0.465513 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0005  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.493215  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0031  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0075  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 115 bp  63.9  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000486693  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0043  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  63.9  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.304759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0028  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000903183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0017  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00334647  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0015  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 115 bp  63.9  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0012  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0094  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.109009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0032  5S ribosomal RNA  83.52 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.113834  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0003  5S ribosomal RNA  83.52 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0189262  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0058  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000857994  normal  0.747107 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0011  5S ribosomal RNA  83.52 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0007  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0282377  normal  0.69185 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0051  5S ribosomal RNA  83.52 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0051  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0082  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0029  5S ribosomal RNA  83.52 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.759375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0058  5S ribosomal RNA  83.52 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0779086  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0040  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000114332 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0035  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0048  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 111 bp  60  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.130794  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0053  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 111 bp  60  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0282002  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0037  5S ribosomal RNA  91.3 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0004  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 122 bp  60  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0005  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 122 bp  60  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0024  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 122 bp  60  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0064  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 122 bp  60  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0065  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 122 bp  60  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0069  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 122 bp  60  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5764  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5767  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 111 bp  58  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000116151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_r02  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 119 bp  58  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_1  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 118 bp  58  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_10  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 118 bp  58  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_9  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 118 bp  58  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SB  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SC  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0798031  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SD  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000175937  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SE  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.711544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>