More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_R0009 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_R0030  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 114 bp  226  9e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0009  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 114 bp  226  9e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0025  5S ribosomal RNA  95.83 
 
 		 116 bp  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0011  5S ribosomal RNA  95.83 
 
 		 116 bp  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0068  5S ribosomal RNA  95.83 
 
 		 116 bp  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0028  5S ribosomal RNA  95.83 
 
 		 116 bp  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0016  5S ribosomal RNA  89.81 
 
 		 115 bp  119  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0012  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 114 bp  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0017  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 114 bp  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0005  5S ribosomal RNA  95.83 
 
 		 116 bp  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0067  5S ribosomal RNA  95.83 
 
 		 116 bp  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0071  5S ribosomal RNA  95.83 
 
 		 116 bp  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 116 bp  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 116 bp  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0022  5S ribosomal RNA  93.42 
 
 		 114 bp  111  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0014  5S ribosomal RNA  96.83 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0106  5S ribosomal RNA  96.83 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0016  5S ribosomal RNA  91.78 
 
 		 117 bp  97.6  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.384299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0003  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  97.6  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.73811e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0042  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  97.6  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.488998  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0005  5S ribosomal RNA  91.78 
 
 		 117 bp  97.6  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.52738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0039  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  97.6  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0028  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  97.6  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349072  normal  0.465513 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0068  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  97.6  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0017  5S ribosomal RNA  98.08 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00334647  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0060  5S ribosomal RNA  98.08 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0031  5S ribosomal RNA  98.08 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0028  5S ribosomal RNA  98.08 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000903183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0063  5S ribosomal RNA  98.08 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00852672  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0012  5S ribosomal RNA  98.08 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0055  5S ribosomal RNA  98.08 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0005  5S ribosomal RNA  98.08 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.493215  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0067  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0064  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0777  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.63754e-29 
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-10  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 119 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000146718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-11  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 109 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000314078  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5004  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_12  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 114 bp  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_13  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 114 bp  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656014  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5632  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0547962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SJ  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000154571  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SK  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000354497  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0070  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0017  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00169127  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0140  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0061  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0056  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0032  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000010425  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0005  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0012  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0017  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000279658  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0029  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.350698  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0035  5S ribosomal RNA  93.44 
 
 		 116 bp  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0050  5S ribosomal RNA  91.3 
 
 		 117 bp  89.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000265937  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0031  5S ribosomal RNA  91.3 
 
 		 117 bp  89.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618538  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0015  5S ribosomal RNA  91.3 
 
 		 117 bp  89.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0004  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 116 bp  89.7  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0035  5S ribosomal RNA  93.44 
 
 		 116 bp  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0016  5S ribosomal RNA  93.44 
 
 		 116 bp  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0016  5S ribosomal RNA  93.44 
 
 		 116 bp  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0047  5S ribosomal RNA  91.3 
 
 		 117 bp  89.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292676  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0092  5S ribosomal RNA  88.66 
 
 		 115 bp  89.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000371886  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0073  5S ribosomal RNA  88.66 
 
 		 115 bp  89.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000636954  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0015  5S ribosomal RNA  93.44 
 
 		 117 bp  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0034  5S ribosomal RNA  93.44 
 
 		 117 bp  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0025  5S ribosomal RNA  93.44 
 
 		 117 bp  89.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.102792  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0036  5S ribosomal RNA  93.44 
 
 		 117 bp  89.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.484974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0050  5S ribosomal RNA  93.44 
 
 		 117 bp  89.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00973992  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0060  5S ribosomal RNA  93.44 
 
 		 117 bp  89.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136348  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0028  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 116 bp  89.7  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.348714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0054  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 117 bp  87.7  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000257756  decreased coverage  0.000469584 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0028  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 117 bp  87.7  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0420198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0018  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 117 bp  87.7  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0020  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  87.7  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12425  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0042  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 117 bp  87.7  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0005  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 117 bp  87.7  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0041  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  87.7  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0021  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 117 bp  87.7  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0015  5S ribosomal RNA  94.55 
 
 		 117 bp  85.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5749  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 111 bp  83.8  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000534541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5752  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  83.8  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5770  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 111 bp  83.8  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000576243  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5773  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 119 bp  83.8  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000449498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-8  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 119 bp  83.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-9  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 119 bp  83.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000019949  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_1  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 118 bp  83.8  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_10  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 118 bp  83.8  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_7  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 118 bp  83.8  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_8  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 118 bp  83.8  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_9  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 118 bp  83.8  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SA  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  83.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.409997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SB  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  83.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SC  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  83.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0798031  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SD  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  83.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000175937  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SE  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  83.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.711544  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SF  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  83.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.932076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SG  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  83.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SH  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  83.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SI  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  83.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000960299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>