More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_R0044 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_R0044  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 132 bp  262  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0019  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 132 bp  260  8e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0050  5S ribosomal RNA  95.73 
 
 		 117 bp  192  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00973992  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0060  5S ribosomal RNA  95.73 
 
 		 117 bp  192  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0036  5S ribosomal RNA  95.73 
 
 		 117 bp  192  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.484974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0025  5S ribosomal RNA  95.73 
 
 		 117 bp  192  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.102792  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0054  5S ribosomal RNA  95.58 
 
 		 115 bp  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0037  5S ribosomal RNA  95.58 
 
 		 117 bp  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.047404  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0059  5S ribosomal RNA  95.58 
 
 		 115 bp  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0022  5S ribosomal RNA  95.58 
 
 		 115 bp  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0070  5S ribosomal RNA  95.58 
 
 		 117 bp  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.260067  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0032  5S ribosomal RNA  95.58 
 
 		 117 bp  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0069  5S ribosomal RNA  95.58 
 
 		 115 bp  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0022  5S ribosomal RNA  95.58 
 
 		 117 bp  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0009  5S ribosomal RNA  94.55 
 
 		 117 bp  170  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0647002  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0025  5S ribosomal RNA  94.55 
 
 		 117 bp  170  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0315832  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs5SA  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 112 bp  167  9e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs5SB  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 112 bp  167  9e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.271264  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0028  5S ribosomal RNA  88.39 
 
 		 116 bp  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349072  normal  0.465513 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0039  5S ribosomal RNA  88.39 
 
 		 116 bp  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0016  5S ribosomal RNA  90.53 
 
 		 116 bp  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0035  5S ribosomal RNA  90.53 
 
 		 116 bp  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0035  5S ribosomal RNA  90.53 
 
 		 116 bp  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0015  5S ribosomal RNA  90.53 
 
 		 117 bp  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0034  5S ribosomal RNA  90.53 
 
 		 117 bp  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0016  5S ribosomal RNA  90.53 
 
 		 116 bp  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0043  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 117 bp  107  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.304759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0005  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 117 bp  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.52738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0016  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 117 bp  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.384299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0015  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 117 bp  99.6  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10570  5S ribosomal RNA  88.64 
 
 		 123 bp  95.6  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.782601  normal  0.301698 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22200  5S ribosomal RNA  88.64 
 
 		 123 bp  95.6  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.380551  normal  0.811083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06930  5S ribosomal RNA  88.64 
 
 		 123 bp  95.6  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.648291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37120  5S ribosomal RNA  88.64 
 
 		 123 bp  95.6  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0017  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 117 bp  89.7  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.711795  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0047  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 117 bp  89.7  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0798933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0034  5S ribosomal RNA  92.98 
 
 		 117 bp  81.8  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480679  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0043  5S ribosomal RNA  92.98 
 
 		 117 bp  81.8  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.240203  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0030  5S ribosomal RNA  92.86 
 
 		 114 bp  79.8  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0009  5S ribosomal RNA  92.86 
 
 		 114 bp  79.8  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0050  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 117 bp  77.8  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000265937  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0047  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 117 bp  77.8  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292676  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0031  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 117 bp  77.8  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618538  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0048  5S ribosomal RNA  85.26 
 
 		 111 bp  77.8  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.130794  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0053  5S ribosomal RNA  85.26 
 
 		 111 bp  77.8  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0282002  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0015  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 117 bp  77.8  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r27  5S ribosomal RNA  86.05 
 
 		 122 bp  75.8  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  91.23 
 
 		 116 bp  73.8  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0048  5S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 116 bp  73.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.424673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  91.23 
 
 		 116 bp  73.8  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0067  5S ribosomal RNA  86.84 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0020  5S ribosomal RNA  86.84 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0028  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0071  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0067  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0032  5S ribosomal RNA  86.84 
 
 		 117 bp  71.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514773  normal  0.248036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0019  5S ribosomal RNA  86.84 
 
 		 117 bp  71.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0077  5S ribosomal RNA  86.84 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0021  5S ribosomal RNA  86.25 
 
 		 117 bp  71.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.800418  normal  0.340088 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0011  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0005  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0025  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0106  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0068  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0031  5S ribosomal RNA  86.84 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514773  normal  0.248036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0053  5S ribosomal RNA  86.84 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0159173  normal  0.653325 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0017  5S ribosomal RNA  86.25 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0033  5S ribosomal RNA  86.84 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0034  5S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 117 bp  71.9  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.263469 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0037  5S ribosomal RNA  86.25 
 
 		 118 bp  71.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0195143  hitchhiker  0.00974115 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0020  5S ribosomal RNA  86.25 
 
 		 118 bp  71.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.803833  normal  0.34124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0036  5S ribosomal RNA  86.25 
 
 		 117 bp  71.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0195143  hitchhiker  0.00974115 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3003  5S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 127 bp  71.9  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3006  5S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 127 bp  71.9  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3009  5S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 127 bp  71.9  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3012  5S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 127 bp  71.9  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3015  5S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 127 bp  71.9  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3019  5S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 127 bp  71.9  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r06  5S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 127 bp  71.9  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r12  5S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 127 bp  71.9  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r15  5S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 127 bp  71.9  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r18  5S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 127 bp  71.9  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.796215  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r21  5S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 127 bp  71.9  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r24  5S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 127 bp  71.9  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r28  5S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 127 bp  71.9  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0014  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0053  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  69.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0034  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  69.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0016  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 115 bp  69.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0007  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  69.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0005  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 115 bp  69.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00187724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0036  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 115 bp  69.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0040  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 115 bp  69.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.852672  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5767  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 111 bp  67.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000116151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_10  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 118 bp  67.9  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_11  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 114 bp  67.9  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.069713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SC  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0798031  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SF  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.932076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SG  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SH  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>