More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_R0025 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_R0025  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0068  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0028  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0011  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0071  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0005  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0067  5S ribosomal RNA  99.14 
 
 
116 bp  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0106  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  208  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0014  5S ribosomal RNA  98.1 
 
 
116 bp  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0028  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  184  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000903183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0060  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  184  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0031  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  184  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0017  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  184  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00334647  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0063  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  184  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00852672  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0012  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  184  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0005  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  184  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.493215  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0055  5S ribosomal RNA  95.19 
 
 
116 bp  167  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0009  5S ribosomal RNA  95.83 
 
 
114 bp  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0030  5S ribosomal RNA  95.83 
 
 
114 bp  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0016  5S ribosomal RNA  98.41 
 
 
115 bp  117  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  96.83 
 
 
116 bp  109  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  96.83 
 
 
116 bp  109  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0047  5S ribosomal RNA  93.06 
 
 
117 bp  103  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292676  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0015  5S ribosomal RNA  93.06 
 
 
117 bp  103  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0031  5S ribosomal RNA  93.06 
 
 
117 bp  103  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618538  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0050  5S ribosomal RNA  93.06 
 
 
117 bp  103  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000265937  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0021  5S ribosomal RNA  91.14 
 
 
117 bp  101  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0041  5S ribosomal RNA  91.14 
 
 
116 bp  101  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0020  5S ribosomal RNA  91.14 
 
 
116 bp  101  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12425  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0004  5S ribosomal RNA  95.24 
 
 
116 bp  101  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0042  5S ribosomal RNA  91.14 
 
 
117 bp  101  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0028  5S ribosomal RNA  95.24 
 
 
116 bp  101  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.348714  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0092  5S ribosomal RNA  95.08 
 
 
115 bp  97.6  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000371886  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0073  5S ribosomal RNA  95.08 
 
 
115 bp  97.6  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000636954  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0070  5S ribosomal RNA  95.08 
 
 
115 bp  97.6  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0140  5S ribosomal RNA  95.08 
 
 
115 bp  97.6  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0067  5S ribosomal RNA  95.08 
 
 
115 bp  97.6  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0064  5S ribosomal RNA  95.08 
 
 
115 bp  97.6  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0005  5S ribosomal RNA  95.08 
 
 
115 bp  97.6  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0012  5S ribosomal RNA  95.08 
 
 
115 bp  97.6  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0017  5S ribosomal RNA  95.08 
 
 
115 bp  97.6  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000279658  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0029  5S ribosomal RNA  95.08 
 
 
115 bp  97.6  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.350698  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0032  5S ribosomal RNA  95.08 
 
 
115 bp  97.6  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000010425  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0056  5S ribosomal RNA  95.08 
 
 
115 bp  97.6  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0061  5S ribosomal RNA  95.08 
 
 
115 bp  97.6  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5743  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
116 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5746  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
116 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5752  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
116 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5755  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
116 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5761  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
116 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5764  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
116 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5770  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
111 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000576243  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5773  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
119 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000449498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-1  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
119 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-10  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
119 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000146718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-4  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
119 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000434423  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-5  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
119 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-6  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
119 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-7  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
119 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-9  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
119 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000019949  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_r02  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
119 bp  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_1  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
118 bp  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_10  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
118 bp  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_11  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
114 bp  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.069713  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_12  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
114 bp  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_13  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
114 bp  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_2  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
118 bp  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_1  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
118 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_10  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
118 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_11  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
114 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000275902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_12  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
114 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000843494  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_13  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
116 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000161586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_2  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
118 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_3  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
118 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_4  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
114 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000269738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_6  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
118 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_7  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
118 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_8  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
118 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_9  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
118 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SA  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
116 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.409997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SB  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
116 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SC  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
116 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0798031  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SD  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
116 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000175937  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SE  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
116 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.711544  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SF  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
116 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.932076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SG  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
116 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SH  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
116 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SI  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
116 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000960299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SJ  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
116 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000154571  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SK  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
116 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000354497  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0107  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
116 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000335281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0005  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
116 bp  91.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0056  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
116 bp  91.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000667986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0032  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
116 bp  91.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0299918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0064  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
116 bp  91.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0070  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
116 bp  91.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0067  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
116 bp  91.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0012  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
116 bp  91.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0017  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
116 bp  91.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00169127  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0029  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 
116 bp  91.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0545703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>