More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_R0016 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_R0035  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0016  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0035  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0016  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0015  5S ribosomal RNA  100 
 
 
117 bp  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0034  5S ribosomal RNA  100 
 
 
117 bp  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0039  5S ribosomal RNA  99.14 
 
 
116 bp  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0028  5S ribosomal RNA  99.14 
 
 
116 bp  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349072  normal  0.465513 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0044  5S ribosomal RNA  90.53 
 
 
132 bp  117  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0019  5S ribosomal RNA  90.53 
 
 
132 bp  117  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0022  5S ribosomal RNA  90 
 
 
115 bp  107  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0070  5S ribosomal RNA  90 
 
 
117 bp  107  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.260067  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0069  5S ribosomal RNA  90 
 
 
115 bp  107  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0022  5S ribosomal RNA  90 
 
 
117 bp  107  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0054  5S ribosomal RNA  90 
 
 
115 bp  107  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0037  5S ribosomal RNA  90 
 
 
117 bp  107  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.047404  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0059  5S ribosomal RNA  90 
 
 
115 bp  107  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0032  5S ribosomal RNA  90 
 
 
117 bp  107  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0025  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 
117 bp  103  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.102792  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0036  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 
117 bp  103  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.484974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0050  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 
117 bp  103  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00973992  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0060  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 
117 bp  103  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136348  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs5SA  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 
112 bp  95.6  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs5SB  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 
112 bp  95.6  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.271264  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 
116 bp  95.6  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 
116 bp  95.6  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0005  5S ribosomal RNA  87.37 
 
 
117 bp  93.7  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.52738  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0025  5S ribosomal RNA  87.91 
 
 
117 bp  93.7  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0315832  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0016  5S ribosomal RNA  87.37 
 
 
117 bp  93.7  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.384299  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0009  5S ribosomal RNA  87.91 
 
 
117 bp  93.7  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0647002  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0015  5S ribosomal RNA  87.78 
 
 
117 bp  91.7  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0030  5S ribosomal RNA  93.44 
 
 
114 bp  89.7  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0009  5S ribosomal RNA  93.44 
 
 
114 bp  89.7  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0047  5S ribosomal RNA  87.95 
 
 
117 bp  85.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292676  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0050  5S ribosomal RNA  87.95 
 
 
117 bp  85.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000265937  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0016  5S ribosomal RNA  94.55 
 
 
115 bp  85.7  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0015  5S ribosomal RNA  87.95 
 
 
117 bp  85.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0031  5S ribosomal RNA  87.95 
 
 
117 bp  85.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618538  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0012  5S ribosomal RNA  92.98 
 
 
114 bp  81.8  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0017  5S ribosomal RNA  92.98 
 
 
114 bp  81.8  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0017  5S ribosomal RNA  87.65 
 
 
117 bp  81.8  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.711795  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0047  5S ribosomal RNA  87.65 
 
 
117 bp  81.8  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0798933  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0068  5S ribosomal RNA  94.23 
 
 
116 bp  79.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0014  5S ribosomal RNA  94.23 
 
 
116 bp  79.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0041  5S ribosomal RNA  90.62 
 
 
116 bp  79.8  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0005  5S ribosomal RNA  94.23 
 
 
116 bp  79.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0071  5S ribosomal RNA  94.23 
 
 
116 bp  79.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0042  5S ribosomal RNA  90.62 
 
 
117 bp  79.8  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0021  5S ribosomal RNA  90.62 
 
 
117 bp  79.8  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0025  5S ribosomal RNA  94.23 
 
 
116 bp  79.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0011  5S ribosomal RNA  94.23 
 
 
116 bp  79.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0067  5S ribosomal RNA  94.23 
 
 
116 bp  79.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0106  5S ribosomal RNA  94.23 
 
 
116 bp  79.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0028  5S ribosomal RNA  94.23 
 
 
116 bp  79.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0020  5S ribosomal RNA  90.62 
 
 
116 bp  79.8  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12425  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0021  5S ribosomal RNA  87.91 
 
 
116 bp  77.8  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.080713 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0035  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 
117 bp  75.8  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.457596 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0022  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 
117 bp  75.8  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.631402 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0068  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 
117 bp  75.8  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.106732  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0021  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 
117 bp  75.8  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.631402 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0054  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 
117 bp  75.8  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.577391  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0034  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 
117 bp  75.8  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.457596 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0067  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 
117 bp  75.8  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.107142  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0055  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 
117 bp  75.8  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.579519  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0077  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 
117 bp  75.8  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0076  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 
117 bp  75.8  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0045  5S ribosomal RNA  88.31 
 
 
112 bp  73.8  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475262  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0022  5S ribosomal RNA  91.23 
 
 
114 bp  73.8  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0005  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 
116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.493215  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0031  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 
116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0017  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 
116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00334647  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0063  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 
116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00852672  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0012  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 
116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0055  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 
116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0028  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 
116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000903183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0060  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 
116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0043  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 
117 bp  71.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.304759  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0066  5S ribosomal RNA  88.61 
 
 
117 bp  69.9  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.225371  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0042  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
116 bp  69.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0058  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
117 bp  69.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0061  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
116 bp  69.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0065  5S ribosomal RNA  88.61 
 
 
116 bp  69.9  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22453  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05580  5S ribosomal RNA  83.5 
 
 
129 bp  69.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0013  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
117 bp  69.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0057  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
116 bp  69.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0041  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
117 bp  69.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25510  5S ribosomal RNA  83.5 
 
 
129 bp  69.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07460  5S ribosomal RNA  83.5 
 
 
129 bp  69.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.875946 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0065  5S ribosomal RNA  86.67 
 
 
116 bp  69.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133126  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0010  5S ribosomal RNA  86.67 
 
 
116 bp  69.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.629957  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0062  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
117 bp  69.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0014  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
116 bp  69.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0005  5S ribosomal RNA  86.67 
 
 
117 bp  69.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0018  5S ribosomal RNA  86.67 
 
 
117 bp  69.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0020  5S ribosomal RNA  86.67 
 
 
117 bp  69.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0033  5S ribosomal RNA  86.67 
 
 
117 bp  69.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0049  5S ribosomal RNA  86.67 
 
 
117 bp  69.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0052  5S ribosomal RNA  86.67 
 
 
117 bp  69.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0076  5S ribosomal RNA  86.67 
 
 
117 bp  69.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0092  5S ribosomal RNA  86.67 
 
 
117 bp  69.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.214269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>