More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_R0015 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_R0015  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  232  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0017  5S ribosomal RNA  90.8 
 
 		 117 bp  109  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.711795  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0047  5S ribosomal RNA  90.8 
 
 		 117 bp  109  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0798933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0060  5S ribosomal RNA  96.61 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0063  5S ribosomal RNA  96.61 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00852672  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0055  5S ribosomal RNA  96.61 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0031  5S ribosomal RNA  96.61 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0028  5S ribosomal RNA  96.61 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000903183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0005  5S ribosomal RNA  96.61 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.493215  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0012  5S ribosomal RNA  96.61 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0017  5S ribosomal RNA  96.61 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00334647  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  99.6  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0044  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 132 bp  99.6  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  99.6  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0019  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 132 bp  99.6  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0039  5S ribosomal RNA  87.78 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0056  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000667986  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0067  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0028  5S ribosomal RNA  87.78 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349072  normal  0.465513 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0012  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0064  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0061  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0005  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0032  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0299918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0029  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0545703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5740  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5743  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5746  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5749  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 111 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000534541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5755  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5758  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5761  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5764  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5767  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 111 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000116151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5770  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 111 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000576243  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5773  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 119 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000449498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-1  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 119 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-10  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 119 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000146718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-11  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 109 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000314078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-2  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 119 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-3  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 119 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-4  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 119 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000434423  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-5  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 119 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-6  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 119 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-9  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 119 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000019949  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_r02  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 119 bp  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_1  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 118 bp  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_10  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 118 bp  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_11  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 114 bp  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.069713  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_12  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 114 bp  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_13  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 114 bp  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_2  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 118 bp  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_3  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 114 bp  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_4  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 118 bp  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_5  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 114 bp  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_6  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 118 bp  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_7  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 118 bp  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_8  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 118 bp  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_9  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 118 bp  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_1  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 118 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_10  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 118 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_11  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 114 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000275902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_12  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 114 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000843494  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_13  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000161586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_2  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 118 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_3  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 118 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_4  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 114 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000269738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_5  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 118 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_6  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 118 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_7  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 118 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_8  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 118 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_9  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 118 bp  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0017  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000279658  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SE  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.711544  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SF  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.932076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SG  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SH  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SI  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000960299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SJ  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000154571  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SK  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000354497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0076  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223344  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0015  5S ribosomal RNA  87.78 
 
 		 117 bp  91.7  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0034  5S ribosomal RNA  87.78 
 
 		 117 bp  91.7  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0012  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0005  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0017  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00169127  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0032  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000010425  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0056  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0029  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.350698  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0064  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0067  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0073  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0060  5S ribosomal RNA  87.78 
 
 		 117 bp  91.7  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136348  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0070  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0140  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0092  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000371886  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0073  5S ribosomal RNA  92.42 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000636954  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0025  5S ribosomal RNA  87.78 
 
 		 117 bp  91.7  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.102792  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0036  5S ribosomal RNA  87.78 
 
 		 117 bp  91.7  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.484974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0050  5S ribosomal RNA  87.78 
 
 		 117 bp  91.7  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00973992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>