More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_R0050 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_R0025  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  232  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.102792  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0036  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  232  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.484974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0050  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  232  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00973992  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0060  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  232  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136348  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0025  5S ribosomal RNA  99.09 
 
 		 117 bp  210  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0315832  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0009  5S ribosomal RNA  99.09 
 
 		 117 bp  210  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0647002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0019  5S ribosomal RNA  95.73 
 
 		 132 bp  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0044  5S ribosomal RNA  95.73 
 
 		 132 bp  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs5SA  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 112 bp  190  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs5SB  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 112 bp  190  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.271264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0069  5S ribosomal RNA  91.15 
 
 		 115 bp  145  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0022  5S ribosomal RNA  91.15 
 
 		 117 bp  145  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0054  5S ribosomal RNA  91.15 
 
 		 115 bp  145  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0037  5S ribosomal RNA  91.15 
 
 		 117 bp  145  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.047404  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0022  5S ribosomal RNA  91.15 
 
 		 115 bp  145  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0070  5S ribosomal RNA  91.15 
 
 		 117 bp  145  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.260067  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0032  5S ribosomal RNA  91.15 
 
 		 117 bp  145  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0059  5S ribosomal RNA  91.15 
 
 		 115 bp  145  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0039  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 116 bp  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0028  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 116 bp  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349072  normal  0.465513 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0016  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 116 bp  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0035  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 116 bp  103  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0016  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 116 bp  103  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0035  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 116 bp  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0015  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 117 bp  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0034  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 117 bp  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0048  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 111 bp  95.6  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.130794  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0053  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 111 bp  95.6  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0282002  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0015  5S ribosomal RNA  87.78 
 
 		 117 bp  91.7  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0043  5S ribosomal RNA  87.78 
 
 		 117 bp  91.7  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.304759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06930  5S ribosomal RNA  86.14 
 
 		 123 bp  89.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.648291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22200  5S ribosomal RNA  86.14 
 
 		 123 bp  89.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.380551  normal  0.811083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37120  5S ribosomal RNA  86.14 
 
 		 123 bp  89.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0030  5S ribosomal RNA  93.44 
 
 		 114 bp  89.7  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10570  5S ribosomal RNA  86.14 
 
 		 123 bp  89.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.782601  normal  0.301698 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0009  5S ribosomal RNA  93.44 
 
 		 114 bp  89.7  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0016  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 		 117 bp  85.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.384299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0005  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 		 117 bp  85.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.52738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0005  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 115 bp  83.8  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00187724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0036  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 115 bp  83.8  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0040  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 115 bp  83.8  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.852672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0017  5S ribosomal RNA  87.65 
 
 		 117 bp  81.8  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.711795  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0047  5S ribosomal RNA  87.65 
 
 		 117 bp  81.8  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0798933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 116 bp  75.8  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 116 bp  75.8  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0028  5S ribosomal RNA  93.88 
 
 		 116 bp  73.8  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0005  5S ribosomal RNA  93.88 
 
 		 116 bp  73.8  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0071  5S ribosomal RNA  93.88 
 
 		 116 bp  73.8  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0067  5S ribosomal RNA  93.88 
 
 		 116 bp  73.8  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0011  5S ribosomal RNA  93.88 
 
 		 116 bp  73.8  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0065  5S ribosomal RNA  92.45 
 
 		 116 bp  73.8  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133126  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0010  5S ribosomal RNA  92.45 
 
 		 116 bp  73.8  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.629957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0070  5S ribosomal RNA  92.45 
 
 		 116 bp  73.8  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.45639  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0025  5S ribosomal RNA  93.88 
 
 		 116 bp  73.8  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0068  5S ribosomal RNA  93.88 
 
 		 116 bp  73.8  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0014  5S ribosomal RNA  93.88 
 
 		 116 bp  73.8  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0106  5S ribosomal RNA  93.88 
 
 		 116 bp  73.8  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0012  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 114 bp  71.9  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0017  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 114 bp  71.9  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0034  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  69.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0053  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  69.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0007  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  69.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0016  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 115 bp  69.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0069  5S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0060  5S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000527991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5632  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0547962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-10  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 119 bp  67.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000146718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-11  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 109 bp  67.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000314078  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0005  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.493215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_12  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 114 bp  67.9  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_13  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 114 bp  67.9  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656014  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0777  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.63754e-29 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0017  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00334647  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0028  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000903183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0012  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0063  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00852672  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0017  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00169127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SJ  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000154571  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SK  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000354497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5004  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0031  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0060  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0055  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0038  5S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000916251  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0057  5S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233124  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0078  5S ribosomal RNA  90.57 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000574865  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0021  5S ribosomal RNA  90.57 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000104076  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0034  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 117 bp  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480679  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0043  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 117 bp  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.240203  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0021  5S ribosomal RNA  85 
 
 		 117 bp  63.9  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.800418  normal  0.340088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0031  5S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514773  normal  0.248036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0036  5S ribosomal RNA  85 
 
 		 117 bp  63.9  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0195143  hitchhiker  0.00974115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0053  5S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0159173  normal  0.653325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0032  5S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 117 bp  63.9  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514773  normal  0.248036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0020  5S ribosomal RNA  85 
 
 		 118 bp  63.9  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.803833  normal  0.34124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0037  5S ribosomal RNA  85 
 
 		 118 bp  63.9  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0195143  hitchhiker  0.00974115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0020  5S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0033  5S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0019  5S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 117 bp  63.9  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0022  5S ribosomal RNA  88.33 
 
 		 114 bp  63.9  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>