More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_R0040 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  230  6e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  230  6e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0004  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  149  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0028  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  149  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.348714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0106  5S ribosomal RNA  95.83 
 
 		 116 bp  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0016  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 115 bp  119  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0014  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 116 bp  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0030  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 114 bp  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0009  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 114 bp  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0021  5S ribosomal RNA  87.72 
 
 		 116 bp  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.080713 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0048  5S ribosomal RNA  88.07 
 
 		 116 bp  113  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.48355  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0029  5S ribosomal RNA  88.07 
 
 		 116 bp  113  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0007  5S ribosomal RNA  88.07 
 
 		 116 bp  113  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0071  5S ribosomal RNA  96.83 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0028  5S ribosomal RNA  96.83 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0025  5S ribosomal RNA  96.83 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0068  5S ribosomal RNA  96.83 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0067  5S ribosomal RNA  96.83 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0011  5S ribosomal RNA  96.83 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0005  5S ribosomal RNA  96.83 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0047  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 117 bp  107  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292676  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0048  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 116 bp  107  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.424673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0050  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 117 bp  107  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000265937  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0031  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 117 bp  107  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618538  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0015  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 117 bp  107  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0034  5S ribosomal RNA  87.62 
 
 		 116 bp  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0051  5S ribosomal RNA  87.62 
 
 		 116 bp  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0058  5S ribosomal RNA  87.62 
 
 		 116 bp  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0061  5S ribosomal RNA  87.62 
 
 		 116 bp  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25510  5S ribosomal RNA  91.03 
 
 		 129 bp  99.6  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0063  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  99.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00852672  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0005  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  99.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.493215  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0028  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  99.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000903183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0012  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  99.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0060  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  99.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07460  5S ribosomal RNA  91.03 
 
 		 129 bp  99.6  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.875946 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0034  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 117 bp  99.6  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.263469 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0015  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 117 bp  99.6  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0031  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  99.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0017  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  99.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00334647  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0055  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  99.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05580  5S ribosomal RNA  91.03 
 
 		 129 bp  99.6  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0017  5S ribosomal RNA  86.24 
 
 		 116 bp  97.6  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.069433 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0027  5S ribosomal RNA  86.24 
 
 		 116 bp  97.6  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0583618  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0055  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 117 bp  97.6  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0016  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0035  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0020  5S ribosomal RNA  90.79 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12425  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0035  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0041  5S ribosomal RNA  90.79 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0016  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0042  5S ribosomal RNA  90.79 
 
 		 117 bp  95.6  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0021  5S ribosomal RNA  90.79 
 
 		 117 bp  95.6  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0015  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 117 bp  95.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0034  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 117 bp  95.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0039  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0028  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349072  normal  0.465513 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07400  5S ribosomal RNA  86.41 
 
 		 129 bp  93.7  9e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224286  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0029  5S ribosomal RNA  91.55 
 
 		 116 bp  93.7  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0042  5S ribosomal RNA  91.55 
 
 		 116 bp  93.7  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247953  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12360  5S ribosomal RNA  86.41 
 
 		 129 bp  93.7  9e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0222476  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0012  5S ribosomal RNA  92.54 
 
 		 114 bp  93.7  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0017  5S ribosomal RNA  92.54 
 
 		 114 bp  93.7  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0007  5S ribosomal RNA  86.87 
 
 		 122 bp  93.7  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0043  5S ribosomal RNA  86.87 
 
 		 122 bp  93.7  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0032  5S ribosomal RNA  86.87 
 
 		 122 bp  93.7  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0031  5S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514773  normal  0.248036 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0058  5S ribosomal RNA  89.74 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000489313  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0068  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0077  5S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0033  5S ribosomal RNA  85.85 
 
 		 117 bp  91.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00237369  normal  0.031126 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0006  5S ribosomal RNA  89.74 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.449414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0053  5S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0159173  normal  0.653325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0020  5S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0019  5S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 117 bp  91.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0067  5S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0003  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.73811e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0033  5S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0050  5S ribosomal RNA  85.85 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00286866  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0032  5S ribosomal RNA  85.85 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00233043  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0042  5S ribosomal RNA  89.74 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0061  5S ribosomal RNA  89.74 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0031  5S ribosomal RNA  89.74 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0107699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0032  5S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 117 bp  91.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514773  normal  0.248036 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0030  5S ribosomal RNA  89.74 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.476449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0042  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.488998  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0065  5S ribosomal RNA  85.85 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0841821  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0041  5S ribosomal RNA  84.82 
 
 		 117 bp  87.7  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0058  5S ribosomal RNA  84.82 
 
 		 117 bp  87.7  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0042  5S ribosomal RNA  84.82 
 
 		 116 bp  87.7  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0007  5S ribosomal RNA  86.46 
 
 		 116 bp  87.7  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0053  5S ribosomal RNA  86.46 
 
 		 116 bp  87.7  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0034  5S ribosomal RNA  86.46 
 
 		 116 bp  87.7  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0013  5S ribosomal RNA  84.82 
 
 		 117 bp  87.7  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0061  5S ribosomal RNA  84.82 
 
 		 116 bp  87.7  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0062  5S ribosomal RNA  84.82 
 
 		 117 bp  87.7  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0057  5S ribosomal RNA  84.82 
 
 		 116 bp  87.7  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0014  5S ribosomal RNA  84.82 
 
 		 116 bp  87.7  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0027  5S ribosomal RNA  86.46 
 
 		 116 bp  87.7  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.360256  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0066  5S ribosomal RNA  86.46 
 
 		 117 bp  87.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0845472  normal  0.0450161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>