More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_R0031 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_R0061  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  228  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0031  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  228  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0107699  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0058  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  228  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000489313  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0027  5S ribosomal RNA  93.24 
 
 		 116 bp  107  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.360256  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0013  5S ribosomal RNA  93.24 
 
 		 116 bp  107  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0618011  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0047  5S ribosomal RNA  94.03 
 
 		 117 bp  101  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292676  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0015  5S ribosomal RNA  94.03 
 
 		 117 bp  101  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0050  5S ribosomal RNA  94.03 
 
 		 117 bp  101  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000265937  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0031  5S ribosomal RNA  94.03 
 
 		 117 bp  101  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618538  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0021  5S ribosomal RNA  91.03 
 
 		 116 bp  99.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.080713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0017  5S ribosomal RNA  88.78 
 
 		 116 bp  99.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0024  5S ribosomal RNA  88.78 
 
 		 116 bp  99.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00043678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0030  5S ribosomal RNA  88.78 
 
 		 117 bp  99.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539781  decreased coverage  0.000469823 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0016  5S ribosomal RNA  92.75 
 
 		 115 bp  97.6  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0055  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 117 bp  97.6  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0034  5S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 117 bp  97.6  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.263469 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  89.74 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  89.74 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0029  5S ribosomal RNA  90.54 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0042  5S ribosomal RNA  90.54 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247953  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0068  5S ribosomal RNA  85.84 
 
 		 116 bp  89.7  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0003  5S ribosomal RNA  85.84 
 
 		 116 bp  89.7  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.73811e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0042  5S ribosomal RNA  85.84 
 
 		 116 bp  89.7  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.488998  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0041  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 116 bp  87.7  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0065  5S ribosomal RNA  86.11 
 
 		 116 bp  87.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0841821  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0020  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 116 bp  87.7  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12425  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0032  5S ribosomal RNA  86.11 
 
 		 116 bp  87.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00233043  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0021  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 117 bp  87.7  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0033  5S ribosomal RNA  86.11 
 
 		 117 bp  87.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00237369  normal  0.031126 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0042  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 117 bp  87.7  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0050  5S ribosomal RNA  86.11 
 
 		 116 bp  87.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00286866  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0024  5S ribosomal RNA  93.65 
 
 		 117 bp  85.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0007  5S ribosomal RNA  91.04 
 
 		 129 bp  85.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0033  5S ribosomal RNA  91.04 
 
 		 129 bp  85.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341902  normal  0.519563 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0041  5S ribosomal RNA  91.04 
 
 		 129 bp  85.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.114691 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0048  5S ribosomal RNA  90.14 
 
 		 116 bp  85.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.424673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12360  5S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 129 bp  83.8  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0222476  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0077  5S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 116 bp  83.8  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07400  5S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 129 bp  83.8  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224286  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0067  5S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 116 bp  83.8  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0032  5S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 117 bp  83.8  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514773  normal  0.248036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0033  5S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 116 bp  83.8  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0053  5S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 116 bp  83.8  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0159173  normal  0.653325 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0034  5S ribosomal RNA  89.19 
 
 		 117 bp  83.8  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480679  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0043  5S ribosomal RNA  89.19 
 
 		 117 bp  83.8  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.240203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0014  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  83.8  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0019  5S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 117 bp  83.8  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0051  5S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 117 bp  83.8  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00290492  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0066  5S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 117 bp  83.8  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0845472  normal  0.0450161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0020  5S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 116 bp  83.8  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0106  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  83.8  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0031  5S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 116 bp  83.8  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514773  normal  0.248036 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0029  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 120 bp  83.8  0.000000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0042  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 120 bp  83.8  0.000000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0013  5S ribosomal RNA  89.61 
 
 		 117 bp  81.8  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000464896  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0024  5S ribosomal RNA  89.61 
 
 		 117 bp  81.8  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0029  5S ribosomal RNA  89.61 
 
 		 117 bp  81.8  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0005  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  79.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0011  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  79.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0028  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  79.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0025  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  79.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0068  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  79.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0071  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  79.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0067  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  79.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0034  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 117 bp  77.8  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0054  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 117 bp  77.8  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0160021  normal  0.653325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0078  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 117 bp  77.8  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0017  5S ribosomal RNA  88.73 
 
 		 116 bp  77.8  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.069433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0068  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 117 bp  77.8  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0007  5S ribosomal RNA  89.55 
 
 		 122 bp  77.8  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0032  5S ribosomal RNA  89.55 
 
 		 122 bp  77.8  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0043  5S ribosomal RNA  89.55 
 
 		 122 bp  77.8  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0027  5S ribosomal RNA  88.73 
 
 		 116 bp  77.8  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0583618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0042  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 116 bp  75.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0061  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 116 bp  75.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0062  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 117 bp  75.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0014  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 116 bp  75.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0058  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 117 bp  75.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0057  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 116 bp  75.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0034  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 116 bp  75.8  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0051  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 116 bp  75.8  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0058  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 116 bp  75.8  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0061  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 116 bp  75.8  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0013  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 117 bp  75.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0041  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 117 bp  75.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0009  5S ribosomal RNA  87.01 
 
 		 114 bp  73.8  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0030  5S ribosomal RNA  87.01 
 
 		 114 bp  73.8  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0012  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 114 bp  71.9  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0014  5S ribosomal RNA  95.45 
 
 		 109 bp  71.9  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0017  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 114 bp  71.9  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0018  5S ribosomal RNA  95.45 
 
 		 109 bp  71.9  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0028  5S ribosomal RNA  95.45 
 
 		 109 bp  71.9  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0039  5S ribosomal RNA  91.07 
 
 		 121 bp  71.9  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0015  5S ribosomal RNA  88.06 
 
 		 115 bp  69.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0075  5S ribosomal RNA  88.06 
 
 		 115 bp  69.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000486693  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0072  5S ribosomal RNA  88.06 
 
 		 115 bp  69.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25510  5S ribosomal RNA  87.14 
 
 		 129 bp  67.9  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07460  5S ribosomal RNA  87.14 
 
 		 129 bp  67.9  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.875946 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0023  5S ribosomal RNA  95.24 
 
 		 108 bp  67.9  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0026  5S ribosomal RNA  95.24 
 
 		 108 bp  67.9  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>