122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_R0029 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_R0029  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 120 bp  238  3e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0042  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 120 bp  238  3e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0031  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 115 bp  83.8  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0107699  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0058  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 115 bp  83.8  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000489313  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0061  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 115 bp  83.8  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0017  5S ribosomal RNA  91.04 
 
 		 116 bp  77.8  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0024  5S ribosomal RNA  91.04 
 
 		 116 bp  77.8  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00043678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0030  5S ribosomal RNA  91.04 
 
 		 117 bp  77.8  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539781  decreased coverage  0.000469823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0033  5S ribosomal RNA  91.04 
 
 		 116 bp  77.8  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0053  5S ribosomal RNA  91.04 
 
 		 116 bp  77.8  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0159173  normal  0.653325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0054  5S ribosomal RNA  91.04 
 
 		 117 bp  77.8  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0160021  normal  0.653325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0034  5S ribosomal RNA  91.04 
 
 		 117 bp  77.8  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0032  5S ribosomal RNA  91.04 
 
 		 117 bp  77.8  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514773  normal  0.248036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0077  5S ribosomal RNA  91.04 
 
 		 116 bp  77.8  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0068  5S ribosomal RNA  91.04 
 
 		 117 bp  77.8  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0067  5S ribosomal RNA  91.04 
 
 		 116 bp  77.8  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0031  5S ribosomal RNA  91.04 
 
 		 116 bp  77.8  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514773  normal  0.248036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0078  5S ribosomal RNA  91.04 
 
 		 117 bp  77.8  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0020  5S ribosomal RNA  91.04 
 
 		 116 bp  77.8  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0019  5S ribosomal RNA  91.04 
 
 		 117 bp  77.8  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0034  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 117 bp  75.8  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.263469 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0027  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 116 bp  75.8  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0583618  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0017  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 116 bp  75.8  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.069433 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0013  5S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 117 bp  75.8  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000464896  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0024  5S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 117 bp  75.8  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0029  5S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 117 bp  75.8  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07400  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 129 bp  75.8  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224286  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12360  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 129 bp  75.8  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0222476  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0015  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0031  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618538  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0047  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292676  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0050  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000265937  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0034  5S ribosomal RNA  88.57 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480679  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0043  5S ribosomal RNA  88.57 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.240203  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06930  5S ribosomal RNA  88.57 
 
 		 123 bp  67.9  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.648291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10570  5S ribosomal RNA  88.57 
 
 		 123 bp  67.9  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.782601  normal  0.301698 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22200  5S ribosomal RNA  88.57 
 
 		 123 bp  67.9  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.380551  normal  0.811083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37120  5S ribosomal RNA  88.57 
 
 		 123 bp  67.9  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0016  5S ribosomal RNA  87.32 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0038  5S ribosomal RNA  88.06 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0784313  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0046  5S ribosomal RNA  88.06 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0007  5S ribosomal RNA  86.49 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0034  5S ribosomal RNA  86.49 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0053  5S ribosomal RNA  86.49 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0024  5S ribosomal RNA  95.35 
 
 		 123 bp  61.9  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0013  5S ribosomal RNA  87.14 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0618011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0027  5S ribosomal RNA  87.14 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.360256  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0026  5S ribosomal RNA  95.12 
 
 		 128 bp  58  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0026  5S ribosomal RNA  95.12 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.255139  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0020  5S ribosomal RNA  88.52 
 
 		 118 bp  58  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.803833  normal  0.34124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0021  5S ribosomal RNA  88.52 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.800418  normal  0.340088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0036  5S ribosomal RNA  88.52 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0195143  hitchhiker  0.00974115 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0037  5S ribosomal RNA  88.52 
 
 		 118 bp  58  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0195143  hitchhiker  0.00974115 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0055  5S ribosomal RNA  85.92 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0007  5S ribosomal RNA  87.3 
 
 		 129 bp  54  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0033  5S ribosomal RNA  87.3 
 
 		 129 bp  54  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341902  normal  0.519563 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0041  5S ribosomal RNA  87.3 
 
 		 129 bp  54  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.114691 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0015  5S ribosomal RNA  87.3 
 
 		 115 bp  54  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0072  5S ribosomal RNA  87.3 
 
 		 115 bp  54  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0075  5S ribosomal RNA  87.3 
 
 		 115 bp  54  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000486693  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0048  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.424673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0021  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.080713 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0014  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 110 bp  52  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.320742  normal  0.807419 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0037  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 114 bp  52  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0029  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0042  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247953  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0009  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 123 bp  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0261857  hitchhiker  0.000595412 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0025  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 123 bp  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0032  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 123 bp  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.581266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0032a  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 128 bp  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.646013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0074  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 123 bp  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.376676 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0081  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 123 bp  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0039  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 121 bp  50.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0009  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0647002  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0025  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0315832  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0023  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 115 bp  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311717 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0030  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 115 bp  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0060  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 115 bp  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0066  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 115 bp  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.523517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0013  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0014  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0041  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0042  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0057  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0058  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0061  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0062  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0015  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  48.1  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.299656 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0030  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  48.1  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0058  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  48.1  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000016454 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0007  5S ribosomal RNA  88.64 
 
 		 122 bp  48.1  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0032  5S ribosomal RNA  88.64 
 
 		 122 bp  48.1  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0043  5S ribosomal RNA  88.64 
 
 		 122 bp  48.1  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0014  5S ribosomal RNA  85.94 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0106  5S ribosomal RNA  85.94 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0007  5S ribosomal RNA  85.29 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0029  5S ribosomal RNA  85.29 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0048  5S ribosomal RNA  85.29 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.48355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>