159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_R0014 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_R0014  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 110 bp  218  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.320742  normal  0.807419 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0054  5S ribosomal RNA  99.09 
 
 		 115 bp  210  5e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0106788 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0037  5S ribosomal RNA  98.18 
 
 		 114 bp  202  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_R0002  5S ribosomal RNA  90.09 
 
 		 111 bp  125  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0907588  normal  0.790513 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_R0001  5S ribosomal RNA  90.09 
 
 		 111 bp  125  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.959886  normal  0.621244 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_R0003  5S ribosomal RNA  90.09 
 
 		 111 bp  125  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.641144 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_R0002  5S ribosomal RNA  88.18 
 
 		 110 bp  115  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.84828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_R0001  5S ribosomal RNA  88.18 
 
 		 110 bp  115  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.119355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0015  5S ribosomal RNA  91.07 
 
 		 117 bp  71.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0047  5S ribosomal RNA  91.07 
 
 		 117 bp  71.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292676  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0031  5S ribosomal RNA  91.07 
 
 		 117 bp  71.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618538  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0050  5S ribosomal RNA  91.07 
 
 		 117 bp  71.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000265937  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0024  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 123 bp  67.9  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25510  5S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 129 bp  67.9  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0013  5S ribosomal RNA  88.71 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0014  5S ribosomal RNA  88.71 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0041  5S ribosomal RNA  88.71 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0042  5S ribosomal RNA  88.71 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0057  5S ribosomal RNA  88.71 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0058  5S ribosomal RNA  88.71 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0061  5S ribosomal RNA  88.71 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0062  5S ribosomal RNA  88.71 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07460  5S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 129 bp  67.9  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.875946 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05580  5S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 129 bp  67.9  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0024  5S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 114 bp  65.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0052  5S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 114 bp  65.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.100242  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0075  5S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 98 bp  65.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0032  5S ribosomal RNA  90.57 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00233043  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0033  5S ribosomal RNA  90.57 
 
 		 117 bp  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00237369  normal  0.031126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0050  5S ribosomal RNA  90.57 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00286866  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0051  5S ribosomal RNA  90.57 
 
 		 117 bp  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00290492  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0065  5S ribosomal RNA  90.57 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0841821  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0066  5S ribosomal RNA  90.57 
 
 		 117 bp  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0845472  normal  0.0450161 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0009  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 123 bp  61.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0261857  hitchhiker  0.000595412 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0025  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 123 bp  61.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0032  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 123 bp  61.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.581266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0032a  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 128 bp  61.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.646013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0074  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 123 bp  61.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.376676 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0081  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 123 bp  61.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0023  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311717 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0030  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0060  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0066  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.523517 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0015  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 122 bp  58  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.299656 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0030  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 122 bp  58  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0058  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 122 bp  58  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000016454 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0023  5S ribosomal RNA  85.94 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.881601  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0042  5S ribosomal RNA  85.94 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.1617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0047  5S ribosomal RNA  85.94 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0065  5S ribosomal RNA  85.94 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0048  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.424673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0021  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.080713 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14048  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 124 bp  56  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000166402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0014  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0019  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0027  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0032  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.998311  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0061  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 115 bp  54  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0026  5S ribosomal RNA  90.7 
 
 		 128 bp  54  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0026  5S ribosomal RNA  90.7 
 
 		 117 bp  54  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.255139  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0013  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000464896  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0024  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0029  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 116 bp  54  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 116 bp  54  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0031  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 115 bp  54  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0107699  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0058  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 115 bp  54  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000489313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0016  5S ribosomal RNA  89.13 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0017  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0055  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0066  5S ribosomal RNA  87.04 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.225371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0034  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480679  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0043  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.240203  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0027  5S ribosomal RNA  87.04 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0583618  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0017  5S ribosomal RNA  87.04 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.069433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0007  5S ribosomal RNA  87.04 
 
 		 122 bp  52  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0032  5S ribosomal RNA  87.04 
 
 		 122 bp  52  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0043  5S ribosomal RNA  87.04 
 
 		 122 bp  52  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0042  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247953  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0029  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0029  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 120 bp  52  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0042  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 120 bp  52  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0065  5S ribosomal RNA  87.04 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0020  5S ribosomal RNA  89.13 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12425  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0021  5S ribosomal RNA  89.13 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0041  5S ribosomal RNA  89.13 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0042  5S ribosomal RNA  89.13 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0005  5S ribosomal RNA  91.89 
 
 		 64 bp  50.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0034  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.263469 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0034  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0051  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0058  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0061  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0048  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 118 bp  50.1  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06930  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 123 bp  50.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.648291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10570  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 123 bp  50.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.782601  normal  0.301698 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22200  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 123 bp  50.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.380551  normal  0.811083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37120  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 123 bp  50.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0039  5S ribosomal RNA  88.64 
 
 		 114 bp  48.1  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0025  5S ribosomal RNA  88.64 
 
 		 113 bp  48.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>