75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_R0002 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_R0001  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 110 bp  218  2e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.119355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_R0002  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 110 bp  218  2e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.84828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_R0003  5S ribosomal RNA  91.89 
 
 		 111 bp  141  3.9999999999999997e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.641144 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_R0002  5S ribosomal RNA  91.89 
 
 		 111 bp  141  3.9999999999999997e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0907588  normal  0.790513 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_R0001  5S ribosomal RNA  91.89 
 
 		 111 bp  141  3.9999999999999997e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.959886  normal  0.621244 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0037  5S ribosomal RNA  88.18 
 
 		 114 bp  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0014  5S ribosomal RNA  88.18 
 
 		 110 bp  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.320742  normal  0.807419 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0054  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 115 bp  107  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0106788 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0081  5S ribosomal RNA  93.48 
 
 		 123 bp  67.9  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0023  5S ribosomal RNA  93.48 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311717 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0030  5S ribosomal RNA  93.48 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0060  5S ribosomal RNA  93.48 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0066  5S ribosomal RNA  93.48 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.523517 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0074  5S ribosomal RNA  93.48 
 
 		 123 bp  67.9  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.376676 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0032a  5S ribosomal RNA  93.48 
 
 		 128 bp  67.9  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.646013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0032  5S ribosomal RNA  93.48 
 
 		 123 bp  67.9  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.581266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0025  5S ribosomal RNA  93.48 
 
 		 123 bp  67.9  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0009  5S ribosomal RNA  93.48 
 
 		 123 bp  67.9  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0261857  hitchhiker  0.000595412 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0075  5S ribosomal RNA  93.48 
 
 		 98 bp  67.9  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0052  5S ribosomal RNA  93.48 
 
 		 114 bp  67.9  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.100242  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0024  5S ribosomal RNA  93.48 
 
 		 114 bp  67.9  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0044  5S ribosomal RNA  86.15 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.834046 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0005  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 64 bp  58  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0043  5S ribosomal RNA  86.15 
 
 		 115 bp  58  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.834046 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4357  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 115 bp  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0031  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 115 bp  48.1  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0107699  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0058  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 115 bp  48.1  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000489313  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0024  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 123 bp  48.1  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4293  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 115 bp  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_r01  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 118 bp  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0007  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.156774  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0029  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0932548  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0006  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 118 bp  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.545008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0061  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 115 bp  48.1  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0061  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 118 bp  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0054  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 118 bp  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0067  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 118 bp  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.271242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0065  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0841821  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0050  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00286866  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0066  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0845472  normal  0.0450161 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05580  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 129 bp  46.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07460  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 129 bp  46.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.875946 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25510  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 129 bp  46.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0016  5S ribosomal RNA  86.27 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0051  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00290492  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0033  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00237369  normal  0.031126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0032  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00233043  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0013  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000464896  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0015  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0031  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618538  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0047  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292676  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0050  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000265937  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0024  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0029  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0017  5S ribosomal RNA  96.15 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0075  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000486693  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0055  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R30  5S ribosomal RNA  96.15 
 
 		 104 bp  44.1  0.007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0029  5S ribosomal RNA  96.15 
 
 		 120 bp  44.1  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0042  5S ribosomal RNA  96.15 
 
 		 120 bp  44.1  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0011  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0012  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0036  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0037  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0054  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0072  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0020  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12425  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0021  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0041  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0042  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0024  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 122 bp  44.1  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0025  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 118 bp  44.1  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0015  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>