246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_R0054 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_R0054  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  228  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0106788 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0014  5S ribosomal RNA  99.09 
 
 		 110 bp  210  6e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.320742  normal  0.807419 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0037  5S ribosomal RNA  97.32 
 
 		 114 bp  198  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_R0003  5S ribosomal RNA  89.19 
 
 		 111 bp  117  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.641144 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_R0002  5S ribosomal RNA  89.19 
 
 		 111 bp  117  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0907588  normal  0.790513 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_R0001  5S ribosomal RNA  89.19 
 
 		 111 bp  117  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.959886  normal  0.621244 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_R0002  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 110 bp  107  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.84828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_R0001  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 110 bp  107  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.119355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07460  5S ribosomal RNA  92.59 
 
 		 129 bp  75.8  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.875946 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05580  5S ribosomal RNA  92.59 
 
 		 129 bp  75.8  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25510  5S ribosomal RNA  92.59 
 
 		 129 bp  75.8  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0050  5S ribosomal RNA  92.45 
 
 		 116 bp  73.8  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00286866  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0024  5S ribosomal RNA  90.77 
 
 		 114 bp  73.8  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0052  5S ribosomal RNA  90.77 
 
 		 114 bp  73.8  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.100242  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0075  5S ribosomal RNA  90.77 
 
 		 98 bp  73.8  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0066  5S ribosomal RNA  92.45 
 
 		 117 bp  73.8  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0845472  normal  0.0450161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0065  5S ribosomal RNA  92.45 
 
 		 116 bp  73.8  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0841821  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0032  5S ribosomal RNA  92.45 
 
 		 116 bp  73.8  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00233043  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0051  5S ribosomal RNA  92.45 
 
 		 117 bp  73.8  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00290492  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0033  5S ribosomal RNA  92.45 
 
 		 117 bp  73.8  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00237369  normal  0.031126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0047  5S ribosomal RNA  91.07 
 
 		 117 bp  71.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292676  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0050  5S ribosomal RNA  91.07 
 
 		 117 bp  71.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000265937  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0015  5S ribosomal RNA  91.07 
 
 		 117 bp  71.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0031  5S ribosomal RNA  91.07 
 
 		 117 bp  71.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618538  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0009  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 123 bp  69.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0261857  hitchhiker  0.000595412 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0025  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 123 bp  69.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0032  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 123 bp  69.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.581266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0032a  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 128 bp  69.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.646013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0074  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 123 bp  69.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.376676 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0081  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 123 bp  69.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0066  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 115 bp  69.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.523517 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0060  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 115 bp  69.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0023  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 115 bp  69.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311717 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0030  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 115 bp  69.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0057  5S ribosomal RNA  88.71 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0013  5S ribosomal RNA  88.71 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0061  5S ribosomal RNA  88.71 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0058  5S ribosomal RNA  88.71 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0042  5S ribosomal RNA  88.71 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0041  5S ribosomal RNA  88.71 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0014  5S ribosomal RNA  88.71 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0062  5S ribosomal RNA  88.71 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0021  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.080713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0048  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.424673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14048  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 124 bp  63.9  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000166402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0055  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0065  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0066  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.225371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0024  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 123 bp  60  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0027  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0583618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0034  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480679  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0043  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.240203  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0017  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.069433 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0029  5S ribosomal RNA  92.86 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0007  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 122 bp  60  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0032  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 122 bp  60  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0043  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 122 bp  60  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0042  5S ribosomal RNA  92.86 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247953  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0005  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 64 bp  58  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06930  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 123 bp  58  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.648291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0034  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.263469 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0034  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0051  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0058  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0061  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22200  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 123 bp  58  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.380551  normal  0.811083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37120  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 123 bp  58  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10570  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 123 bp  58  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.782601  normal  0.301698 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0023  5S ribosomal RNA  85.94 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.881601  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0042  5S ribosomal RNA  85.94 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.1617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0047  5S ribosomal RNA  85.94 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0065  5S ribosomal RNA  85.94 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0022  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 114 bp  56  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0790394  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0039  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 114 bp  56  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0019  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 114 bp  56  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507322  normal  0.482048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0036  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 114 bp  56  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0862366  normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0025  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 113 bp  56  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0040  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 113 bp  56  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0277328  normal  0.0318145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0030  5S ribosomal RNA  96.88 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.476449  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0019  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 114 bp  56  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329841  normal  0.0964141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0036  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 114 bp  56  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.481647  hitchhiker  0.00452682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0042  5S ribosomal RNA  96.88 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0006  5S ribosomal RNA  96.88 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.449414  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0027  5S ribosomal RNA  89.36 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.360256  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0021  5S ribosomal RNA  85.07 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.800418  normal  0.340088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0037  5S ribosomal RNA  85.07 
 
 		 118 bp  54  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0195143  hitchhiker  0.00974115 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0036  5S ribosomal RNA  85.07 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0195143  hitchhiker  0.00974115 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0044  5S ribosomal RNA  96.77 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000702474  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0043  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 115 bp  54  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.834046 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0044  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.834046 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0013  5S ribosomal RNA  89.36 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0618011  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0020  5S ribosomal RNA  85.07 
 
 		 118 bp  54  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.803833  normal  0.34124 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0047  5S ribosomal RNA  96.77 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0124102  hitchhiker  0.00149945 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0021  5S ribosomal RNA  87.04 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.631402 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0022  5S ribosomal RNA  87.04 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.631402 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0062  5S ribosomal RNA  96.67 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0065  5S ribosomal RNA  96.67 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0033  5S ribosomal RNA  89.13 
 
 		 129 bp  52  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341902  normal  0.519563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>