165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_R0024 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_R0024  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 123 bp  244  3.9999999999999997e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0048  5S ribosomal RNA  92.59 
 
 		 116 bp  75.8  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.424673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0034  5S ribosomal RNA  92.59 
 
 		 116 bp  75.8  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0051  5S ribosomal RNA  92.59 
 
 		 116 bp  75.8  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0058  5S ribosomal RNA  92.59 
 
 		 116 bp  75.8  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0061  5S ribosomal RNA  92.59 
 
 		 116 bp  75.8  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0039  5S ribosomal RNA  84.26 
 
 		 121 bp  71.9  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0015  5S ribosomal RNA  93.62 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0050  5S ribosomal RNA  93.62 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000265937  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0047  5S ribosomal RNA  93.62 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292676  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0031  5S ribosomal RNA  93.62 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618538  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0014  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 110 bp  67.9  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.320742  normal  0.807419 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0021  5S ribosomal RNA  92 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.080713 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0037  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 114 bp  67.9  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0055  5S ribosomal RNA  92 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0032  5S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00233043  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0033  5S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00237369  normal  0.031126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0050  5S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00286866  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0051  5S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00290492  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0065  5S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0841821  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0066  5S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0845472  normal  0.0450161 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05580  5S ribosomal RNA  90.57 
 
 		 129 bp  65.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07460  5S ribosomal RNA  90.57 
 
 		 129 bp  65.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.875946 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25510  5S ribosomal RNA  90.57 
 
 		 129 bp  65.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0013  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 117 bp  63.9  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000464896  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0024  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 117 bp  63.9  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0029  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 117 bp  63.9  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0061  5S ribosomal RNA  90.2 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0027  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0583618  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0017  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.069433 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0031  5S ribosomal RNA  90.2 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0107699  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22200  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 123 bp  61.9  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.380551  normal  0.811083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10570  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 123 bp  61.9  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.782601  normal  0.301698 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0043  5S ribosomal RNA  94.87 
 
 		 122 bp  61.9  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0007  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 122 bp  61.9  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0032  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 122 bp  61.9  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0043  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 122 bp  61.9  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0029  5S ribosomal RNA  90.2 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0029  5S ribosomal RNA  95.35 
 
 		 120 bp  61.9  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0042  5S ribosomal RNA  95.35 
 
 		 120 bp  61.9  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0058  5S ribosomal RNA  90.2 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000489313  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37120  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 123 bp  61.9  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06930  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 123 bp  61.9  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.648291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0042  5S ribosomal RNA  90.2 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247953  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0024  5S ribosomal RNA  88.14 
 
 		 122 bp  61.9  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0025  5S ribosomal RNA  88.14 
 
 		 118 bp  61.9  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_R0001  5S ribosomal RNA  94.87 
 
 		 111 bp  61.9  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.959886  normal  0.621244 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_R0002  5S ribosomal RNA  94.87 
 
 		 111 bp  61.9  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0907588  normal  0.790513 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_R0003  5S ribosomal RNA  94.87 
 
 		 111 bp  61.9  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.641144 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0016  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 115 bp  60  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0054  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 115 bp  60  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0106788 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0013  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0014  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0041  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0042  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0057  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0058  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0061  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0062  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0068  5S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.106732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0067  5S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.107142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0038  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0784313  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0046  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0018  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.295513  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0023  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0031  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0953498  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0062  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0065  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0034  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480679  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0043  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.240203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0019  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0020  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0077  5S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0066  5S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.225371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0065  5S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0026  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 128 bp  56  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0076  5S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0055  5S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.579519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0053  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0159173  normal  0.653325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0034  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0026  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.255139  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0054  5S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.577391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0017  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0022  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0029  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000935796 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0060  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0063  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0078  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0077  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0068  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0054  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0160021  normal  0.653325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0067  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0031  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514773  normal  0.248036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0033  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0032  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514773  normal  0.248036 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0021  5S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.631402 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0022  5S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.631402 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0034  5S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.457596 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>