118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_R0026 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_R0026  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  232  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.255139  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0026  5S ribosomal RNA  99.15 
 
 		 128 bp  224  4e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0014  5S ribosomal RNA  93.55 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0019  5S ribosomal RNA  93.55 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0027  5S ribosomal RNA  93.55 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0032  5S ribosomal RNA  93.55 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.998311  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0016  5S ribosomal RNA  83.93 
 
 		 116 bp  79.8  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000764484  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0048  5S ribosomal RNA  83.93 
 
 		 116 bp  79.8  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0023  5S ribosomal RNA  92.16 
 
 		 116 bp  69.9  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.881601  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0042  5S ribosomal RNA  92.16 
 
 		 116 bp  69.9  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.1617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0047  5S ribosomal RNA  92.16 
 
 		 116 bp  69.9  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0065  5S ribosomal RNA  92.16 
 
 		 116 bp  69.9  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0047  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.906492 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0013  5S ribosomal RNA  95.12 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000464896  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0024  5S ribosomal RNA  95.12 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0029  5S ribosomal RNA  95.12 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0029  5S ribosomal RNA  95.12 
 
 		 120 bp  58  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0042  5S ribosomal RNA  95.12 
 
 		 120 bp  58  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0020  5S ribosomal RNA  87.72 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12425  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0021  5S ribosomal RNA  87.72 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0041  5S ribosomal RNA  87.72 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0042  5S ribosomal RNA  87.72 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0015  5S ribosomal RNA  87.72 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0031  5S ribosomal RNA  87.72 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618538  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0047  5S ribosomal RNA  87.72 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292676  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0050  5S ribosomal RNA  87.72 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000265937  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0031  5S ribosomal RNA  87.72 
 
 		 115 bp  58  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0107699  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0058  5S ribosomal RNA  87.72 
 
 		 115 bp  58  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000489313  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0061  5S ribosomal RNA  87.72 
 
 		 115 bp  58  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0024  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 123 bp  56  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0078  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0014  5S ribosomal RNA  90.7 
 
 		 110 bp  54  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.320742  normal  0.807419 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0037  5S ribosomal RNA  90.7 
 
 		 114 bp  54  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0077  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0068  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0067  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0019  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0020  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0031  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514773  normal  0.248036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0032  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514773  normal  0.248036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0033  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0034  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0053  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0159173  normal  0.653325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0054  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0160021  normal  0.653325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0017  5S ribosomal RNA  96.67 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0024  5S ribosomal RNA  96.67 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00043678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0030  5S ribosomal RNA  96.67 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539781  decreased coverage  0.000469823 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03880  5S ribosomal RNA  96.67 
 
 		 165 bp  52  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.158034  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14270  5S ribosomal RNA  96.67 
 
 		 166 bp  52  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00060826  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0030  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 114 bp  52  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000331243  normal  0.673605 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0050  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 114 bp  52  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.973161 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0048  5S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.424673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0021  5S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.080713 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0020  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 118 bp  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.803833  normal  0.34124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0021  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.800418  normal  0.340088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0036  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0195143  hitchhiker  0.00974115 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0037  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 118 bp  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0195143  hitchhiker  0.00974115 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0013  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0014  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0041  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0042  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0057  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0058  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0061  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0062  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04520  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 164 bp  50.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.342927  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13570  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 164 bp  50.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.053497  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21630  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 164 bp  50.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0055  5S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06930  5S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 123 bp  50.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.648291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10570  5S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 123 bp  50.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.782601  normal  0.301698 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22200  5S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 123 bp  50.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.380551  normal  0.811083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37120  5S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 123 bp  50.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0034  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480679  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0043  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.240203  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_R0001  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 111 bp  46.1  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.959886  normal  0.621244 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_R0002  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 111 bp  46.1  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0907588  normal  0.790513 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_R0003  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 111 bp  46.1  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.641144 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0054  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0106788 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0018  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.295513  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0031  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0953498  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0062  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0065  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0034  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.263469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0007  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 129 bp  44.1  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14048  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 124 bp  44.1  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000166402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0017  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 116 bp  44.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0022  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 116 bp  44.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0060  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 116 bp  44.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0063  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 116 bp  44.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0032  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 116 bp  44.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00233043  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0033  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00237369  normal  0.031126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0050  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 116 bp  44.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00286866  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0051  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00290492  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0065  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 116 bp  44.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0841821  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0066  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0845472  normal  0.0450161 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07400  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 129 bp  44.1  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224286  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12360  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 129 bp  44.1  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0222476  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0029  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 116 bp  44.1  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0042  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 116 bp  44.1  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>