106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_R0014 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_R0014  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  230  6e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0019  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  230  6e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0027  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  230  6e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0032  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  230  6e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.998311  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0026  5S ribosomal RNA  93.55 
 
 		 128 bp  91.7  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0026  5S ribosomal RNA  93.55 
 
 		 117 bp  91.7  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.255139  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0023  5S ribosomal RNA  90.38 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.881601  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0042  5S ribosomal RNA  90.38 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.1617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0047  5S ribosomal RNA  90.38 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0065  5S ribosomal RNA  90.38 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_R0001  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 111 bp  63.9  0.000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.959886  normal  0.621244 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_R0002  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 111 bp  63.9  0.000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0907588  normal  0.790513 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_R0003  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 111 bp  63.9  0.000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.641144 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0034  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480679  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0043  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.240203  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0014  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 110 bp  56  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.320742  normal  0.807419 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0037  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 114 bp  56  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0037  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0017  5S ribosomal RNA  96.67 
 
 		 109 bp  52  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0035  5S ribosomal RNA  96.67 
 
 		 109 bp  52  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0016  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 115 bp  48.1  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0008  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.488687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0013  23S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.607574 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0006  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 122 bp  48.1  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0039  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 122 bp  48.1  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320086  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_r3  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 122 bp  48.1  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0359227  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0024  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 123 bp  48.1  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0040  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 118 bp  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.498325 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0052  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 118 bp  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.678773 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0059  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 118 bp  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.556959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_R0067  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 118 bp  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.874894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0016  5S ribosomal RNA  88.64 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000764484  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0048  5S ribosomal RNA  88.64 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0060  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 118 bp  48.1  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0053  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 121 bp  48.1  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0020  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12425  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0021  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0041  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0042  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0035  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 118 bp  48.1  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0018  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 118 bp  48.1  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0054  5S ribosomal RNA  88.64 
 
 		 115 bp  48.1  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0106788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0015  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0031  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618538  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0047  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292676  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0050  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000265937  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0050  5S ribosomal RNA  93.55 
 
 		 118 bp  46.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409791  normal  0.069231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0022  5S ribosomal RNA  86.27 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0032  5S ribosomal RNA  86.27 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0037  5S ribosomal RNA  86.27 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.047404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0070  5S ribosomal RNA  86.27 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.260067  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0022  5S ribosomal RNA  86.27 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0054  5S ribosomal RNA  86.27 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0059  5S ribosomal RNA  86.27 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0069  5S ribosomal RNA  86.27 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc5SA  5S ribosomal RNA  96.15 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc5SB  5S ribosomal RNA  96.15 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.729876  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0017  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 115 bp  44.1  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0183737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0051  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 115 bp  44.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.205109 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0022  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 115 bp  44.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0061  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 115 bp  44.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0008  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 120 bp  44.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044416 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0066  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 120 bp  44.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0017  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 115 bp  44.1  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0022  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 114 bp  44.1  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0790394  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0039  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 114 bp  44.1  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0017  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.711795  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0047  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0798933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0019  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 114 bp  44.1  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507322  normal  0.482048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0036  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 114 bp  44.1  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0862366  normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0025  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 113 bp  44.1  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0040  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 113 bp  44.1  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0277328  normal  0.0318145 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0015  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 122 bp  44.1  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.299656 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0030  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 122 bp  44.1  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0058  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 122 bp  44.1  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000016454 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0019  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 114 bp  44.1  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329841  normal  0.0964141 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0025  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 112 bp  44.1  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.109821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0038  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 112 bp  44.1  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_rRNA5S1  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 123 bp  44.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.25658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_rRNA5S2  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 123 bp  44.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0010  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 114 bp  44.1  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.780985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0022  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 114 bp  44.1  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0045  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 114 bp  44.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.490117  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0061  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 114 bp  44.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0039  5S ribosomal RNA  96.15 
 
 		 115 bp  44.1  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0013  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0014  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 116 bp  44.1  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0042  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 116 bp  44.1  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0057  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 116 bp  44.1  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0061  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 116 bp  44.1  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0062  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0021  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.631402 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0022  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.631402 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0034  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.457596 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0035  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.457596 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0054  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.577391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0055  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.579519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0065  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  44.1  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0066  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.225371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0067  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.107142  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>