109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_R0053 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_R0053  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 121 bp  240  6.999999999999999e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0060  5S ribosomal RNA  98.02 
 
 		 118 bp  184  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0018  5S ribosomal RNA  98.02 
 
 		 118 bp  184  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0035  5S ribosomal RNA  98.02 
 
 		 118 bp  184  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0024  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 122 bp  139  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0025  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 118 bp  139  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_R0057  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 121 bp  113  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_R0058  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 122 bp  113  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0013  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 121 bp  113  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0014  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 122 bp  113  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0038  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 122 bp  113  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0039  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 121 bp  113  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_R0056  5S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 120 bp  99.6  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_R0061  5S ribosomal RNA  85.47 
 
 		 118 bp  97.6  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0004  5S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 118 bp  89.7  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.357792  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0028  5S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 118 bp  89.7  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.678943  hitchhiker  0.00874775 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_R0057  5S ribosomal RNA  84.82 
 
 		 118 bp  87.7  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_R0055  5S ribosomal RNA  84.82 
 
 		 118 bp  87.7  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.705765  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0023  5S ribosomal RNA  84.82 
 
 		 118 bp  87.7  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0004  5S ribosomal RNA  84.82 
 
 		 118 bp  87.7  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.140775  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0014  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0106  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0005  5S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0011  5S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0025  5S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0028  5S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0067  5S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0068  5S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0071  5S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0003  5S ribosomal RNA  92.68 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0189262  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0011  5S ribosomal RNA  92.68 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0029  5S ribosomal RNA  92.68 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.759375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0032  5S ribosomal RNA  92.68 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.113834  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0051  5S ribosomal RNA  92.68 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0058  5S ribosomal RNA  92.68 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0779086  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0016  5S ribosomal RNA  89.58 
 
 		 115 bp  56  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0043  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.304759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0037  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0025  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.102792  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0036  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.484974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0050  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00973992  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0060  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136348  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0055  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 115 bp  54  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0551184  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0009  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 114 bp  54  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0030  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 114 bp  54  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0009  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0647002  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0025  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0315832  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0007  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 115 bp  54  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.146572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0017  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.711795  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0047  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0798933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0019  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 132 bp  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0044  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 132 bp  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0015  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0022  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0032  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0037  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.047404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0070  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.260067  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0005  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.493215  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0012  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0017  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00334647  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0028  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000903183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0031  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0055  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0060  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0063  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00852672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0022  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0054  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0059  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0069  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0010  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.629957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0021  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000104076  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0065  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133126  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0070  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.45639  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0078  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000574865  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0014  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0019  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0027  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0032  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.998311  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0007  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0034  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0053  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0015  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0034  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0028  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349072  normal  0.465513 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0039  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0016  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0035  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0016  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0035  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0008  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 120 bp  44.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044416 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0066  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 120 bp  44.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0001  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 120 bp  44.1  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.881083  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0015  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 120 bp  44.1  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0061  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 120 bp  44.1  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657858  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0003  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0014  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0027  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0065  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>