34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_R0056 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013923  Nmag_R0056  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 120 bp  238  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_R0057  5S ribosomal RNA  90.27 
 
 		 118 bp  137  7.000000000000001e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_R0055  5S ribosomal RNA  90.27 
 
 		 118 bp  137  7.000000000000001e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.705765  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0023  5S ribosomal RNA  90.27 
 
 		 118 bp  137  7.000000000000001e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0004  5S ribosomal RNA  90.27 
 
 		 118 bp  137  7.000000000000001e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.140775  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0018  5S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 118 bp  105  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0035  5S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 118 bp  105  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0060  5S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 118 bp  105  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0028  5S ribosomal RNA  92 
 
 		 118 bp  101  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.678943  hitchhiker  0.00874775 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0004  5S ribosomal RNA  92 
 
 		 118 bp  101  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.357792  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_R0061  5S ribosomal RNA  92 
 
 		 118 bp  101  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0053  5S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 121 bp  99.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0024  5S ribosomal RNA  87.78 
 
 		 122 bp  91.7  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0025  5S ribosomal RNA  87.78 
 
 		 118 bp  91.7  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0028  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.348714  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0004  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0007  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0034  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0053  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0070  5S ribosomal RNA  89.74 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.45639  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_R0057  5S ribosomal RNA  81.11 
 
 		 121 bp  44.1  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0039  5S ribosomal RNA  81.11 
 
 		 121 bp  44.1  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0038  5S ribosomal RNA  81.11 
 
 		 122 bp  44.1  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0014  5S ribosomal RNA  81.11 
 
 		 122 bp  44.1  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0013  5S ribosomal RNA  81.11 
 
 		 121 bp  44.1  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_R0058  5S ribosomal RNA  81.11 
 
 		 122 bp  44.1  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0004  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 122 bp  44.1  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0069  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 122 bp  44.1  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0065  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 122 bp  44.1  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0064  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 122 bp  44.1  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0024  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 122 bp  44.1  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0005  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 122 bp  44.1  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>