More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_R0034 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_R0007  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  230  6e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0034  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  230  6e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0053  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  230  6e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0038  5S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 117 bp  89.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000916251  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0057  5S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 117 bp  89.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0060  5S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 117 bp  89.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000527991  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0069  5S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 117 bp  89.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107578  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  86.46 
 
 		 116 bp  87.7  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  86.46 
 
 		 116 bp  87.7  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0070  5S ribosomal RNA  84.85 
 
 		 117 bp  77.8  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0065  5S ribosomal RNA  84.85 
 
 		 117 bp  77.8  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0088  5S ribosomal RNA  84.85 
 
 		 117 bp  77.8  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.875375  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0014  5S ribosomal RNA  84.85 
 
 		 117 bp  77.8  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0003  5S ribosomal RNA  84.85 
 
 		 117 bp  77.8  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0030  5S ribosomal RNA  87.84 
 
 		 116 bp  75.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.476449  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0042  5S ribosomal RNA  87.84 
 
 		 116 bp  75.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0006  5S ribosomal RNA  87.84 
 
 		 116 bp  75.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.449414  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0028  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0091  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 117 bp  71.9  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127685  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0085  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 117 bp  71.9  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.102476  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0071  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0005  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0067  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0025  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0106  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0068  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0014  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0011  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0043  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 117 bp  71.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.304759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0027  5S ribosomal RNA  83.84 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0044  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 132 bp  69.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0025  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.102792  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0036  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.484974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0050  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00973992  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0060  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136348  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0019  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 132 bp  69.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0028  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000903183  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0008  5S ribosomal RNA  86.49 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_R0061  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 118 bp  67.9  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0060  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0031  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0055  5S ribosomal RNA  88.71 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0005  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.493215  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0017  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00334647  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0063  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00852672  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0055  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0012  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0015  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0070  5S ribosomal RNA  97.3 
 
 		 117 bp  65.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.260067  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0021  5S ribosomal RNA  88.52 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.080713 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0003  5S ribosomal RNA  88.52 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000187832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0037  5S ribosomal RNA  97.3 
 
 		 117 bp  65.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.047404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0022  5S ribosomal RNA  97.3 
 
 		 117 bp  65.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0009  5S ribosomal RNA  88.52 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0048  5S ribosomal RNA  88.52 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.424673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0069  5S ribosomal RNA  97.3 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0032  5S ribosomal RNA  97.3 
 
 		 117 bp  65.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0004  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  65.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0005  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  65.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0024  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  65.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0064  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  65.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0065  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  65.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0069  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  65.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14048  5S ribosomal RNA  88.52 
 
 		 124 bp  65.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000166402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0034  5S ribosomal RNA  88.52 
 
 		 117 bp  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480679  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0043  5S ribosomal RNA  88.52 
 
 		 117 bp  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.240203  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0022  5S ribosomal RNA  97.3 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0054  5S ribosomal RNA  97.3 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0059  5S ribosomal RNA  97.3 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0021  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 117 bp  63.9  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0057  5S ribosomal RNA  88.33 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0042  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 117 bp  63.9  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0020  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12425  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0004  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0028  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 118 bp  63.9  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.678943  hitchhiker  0.00874775 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0024  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 122 bp  63.9  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0041  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0017  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0010  5S ribosomal RNA  88.33 
 
 		 113 bp  63.9  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0016  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 115 bp  63.9  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0004  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 118 bp  63.9  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.357792  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0025  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 118 bp  63.9  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0028  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.348714  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0060  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0025  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0315832  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0042  5S ribosomal RNA  86.49 
 
 		 120 bp  61.9  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0066  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.523517 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0009  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 		 114 bp  61.9  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0030  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0029  5S ribosomal RNA  86.49 
 
 		 120 bp  61.9  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0024  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 114 bp  61.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0052  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 114 bp  61.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.100242  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0075  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 98 bp  61.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0023  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311717 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0009  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 123 bp  61.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0261857  hitchhiker  0.000595412 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0025  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 123 bp  61.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0032  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 123 bp  61.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.581266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0032a  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 128 bp  61.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.646013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0074  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 123 bp  61.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.376676 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0081  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 123 bp  61.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>