More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_R0057 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_R0057  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  232  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0038  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  232  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000916251  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0069  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  232  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0060  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  232  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000527991  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0027  5S ribosomal RNA  86.09 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000434608  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0086  5S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 116 bp  93.7  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0015  5S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 116 bp  93.7  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0168638  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0039  5S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 116 bp  93.7  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.213225  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0021  5S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 116 bp  93.7  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.259042  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0081  5S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 116 bp  93.7  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000871424  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0010  5S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 116 bp  93.7  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00985283  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0057  5S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 116 bp  93.7  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0053  5S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 116 bp  89.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0007  5S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 116 bp  89.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0034  5S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 116 bp  89.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0017  5S ribosomal RNA  89.06 
 
 		 117 bp  71.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.711795  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0047  5S ribosomal RNA  89.06 
 
 		 117 bp  71.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0798933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0060  5S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136348  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0019  5S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 132 bp  67.9  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0044  5S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 132 bp  67.9  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0050  5S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00973992  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0036  5S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.484974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0025  5S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.102792  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0017  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00334647  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0055  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0012  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0005  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.493215  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0060  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0031  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0028  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000903183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0063  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00852672  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0015  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 117 bp  63.9  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0048  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 		 118 bp  61.9  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0059  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 115 bp  60  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0014  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0047  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292676  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0037  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.047404  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0016  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0071  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0067  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0009  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0647002  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0016  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0053  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 119 bp  60  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.545293  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0020  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12425  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0022  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 115 bp  60  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0050  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000265937  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0025  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0106  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0035  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0025  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0315832  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0048  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 119 bp  60  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000922958  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0035  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0070  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.260067  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0032  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0042  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0021  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0068  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0011  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0031  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618538  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0015  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0028  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0017  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0005  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0016  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 115 bp  60  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0015  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0034  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0043  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.304759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0022  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0031  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 119 bp  60  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00046496  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0069  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 115 bp  60  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0041  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0054  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 115 bp  60  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0009  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 119 bp  60  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0039  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0028  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349072  normal  0.465513 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_R0061  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 118 bp  58  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0004  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 122 bp  58  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0005  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 122 bp  58  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0024  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 122 bp  58  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0064  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 122 bp  58  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0065  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 122 bp  58  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0069  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 122 bp  58  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0030  5S ribosomal RNA  85.94 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.476449  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0042  5S ribosomal RNA  85.94 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0006  5S ribosomal RNA  85.94 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.449414  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0054  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 109 bp  56  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0738304  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5749  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 111 bp  54  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000534541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5770  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 111 bp  54  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000576243  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5773  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 119 bp  54  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000449498  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_1  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 118 bp  54  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_10  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 118 bp  54  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_11  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 114 bp  54  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.069713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SC  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0798031  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SD  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000175937  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SF  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.932076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SG  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SH  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SI  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000960299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>