36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_R0054 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_R0054  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 109 bp  216  9e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0738304  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0048  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 118 bp  56  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0069  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0060  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000527991  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0057  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0038  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000916251  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3006  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 127 bp  54  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r28  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 127 bp  54  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r27  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 122 bp  54  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r24  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 127 bp  54  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r18  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 127 bp  54  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.796215  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r15  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 127 bp  54  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r12  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 127 bp  54  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r21  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 127 bp  54  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3003  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 127 bp  54  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r06  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 127 bp  54  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3019  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 127 bp  54  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3015  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 127 bp  54  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3012  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 127 bp  54  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3009  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 127 bp  54  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0017  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0042  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0041  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0021  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0020  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12425  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0053  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0034  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0007  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0053  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 119 bp  48.1  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.545293  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0048  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 119 bp  48.1  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000922958  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0031  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 119 bp  48.1  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00046496  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0009  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 119 bp  48.1  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0017  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 		 114 bp  48.1  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0012  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 		 114 bp  48.1  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>