155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_r06 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_r06  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 127 bp  252  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r12  5S ribosomal RNA  99.21 
 
 		 127 bp  244  5e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3003  5S ribosomal RNA  99.21 
 
 		 127 bp  242  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r18  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 127 bp  240  6.999999999999999e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.796215  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r21  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 127 bp  240  6.999999999999999e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3009  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 127 bp  238  3e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3012  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 127 bp  238  3e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r24  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 127 bp  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3006  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 127 bp  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3015  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 127 bp  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3019  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 127 bp  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r15  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 127 bp  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r28  5S ribosomal RNA  99.15 
 
 		 127 bp  226  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r03  5S ribosomal RNA  93.28 
 
 		 128 bp  165  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r09  5S ribosomal RNA  93.28 
 
 		 128 bp  165  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3000  5S ribosomal RNA  93.22 
 
 		 128 bp  163  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r27  5S ribosomal RNA  94.68 
 
 		 122 bp  147  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06930  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 123 bp  79.8  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.648291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10570  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 123 bp  79.8  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.782601  normal  0.301698 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37120  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 123 bp  79.8  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22200  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 123 bp  79.8  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.380551  normal  0.811083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0019  5S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 132 bp  71.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0044  5S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 132 bp  71.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0050  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 117 bp  71.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000265937  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0031  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 117 bp  71.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618538  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0015  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 117 bp  71.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0047  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 117 bp  71.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292676  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0020  5S ribosomal RNA  97.44 
 
 		 118 bp  69.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.803833  normal  0.34124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0021  5S ribosomal RNA  97.44 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.800418  normal  0.340088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0036  5S ribosomal RNA  97.44 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0195143  hitchhiker  0.00974115 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0037  5S ribosomal RNA  97.44 
 
 		 118 bp  69.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0195143  hitchhiker  0.00974115 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0034  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0051  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0058  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0061  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0027  5S ribosomal RNA  83.7 
 
 		 117 bp  63.9  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0022  5S ribosomal RNA  84.09 
 
 		 117 bp  63.9  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0032  5S ribosomal RNA  84.09 
 
 		 117 bp  63.9  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0037  5S ribosomal RNA  84.09 
 
 		 117 bp  63.9  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.047404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0070  5S ribosomal RNA  84.09 
 
 		 117 bp  63.9  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.260067  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0069  5S ribosomal RNA  84.09 
 
 		 115 bp  63.9  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0059  5S ribosomal RNA  84.09 
 
 		 115 bp  63.9  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0022  5S ribosomal RNA  84.09 
 
 		 115 bp  63.9  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0054  5S ribosomal RNA  84.09 
 
 		 115 bp  63.9  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0038  5S ribosomal RNA  94.87 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0784313  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0046  5S ribosomal RNA  94.87 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0003  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0014  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0065  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0070  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0088  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.875375  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0017  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0077  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0042  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0041  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0021  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0020  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12425  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0032  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514773  normal  0.248036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0067  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0015  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0020  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0019  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0034  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0033  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0031  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514773  normal  0.248036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0053  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0159173  normal  0.653325 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0015  5S ribosomal RNA  82.76 
 
 		 117 bp  54  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0034  5S ribosomal RNA  82.76 
 
 		 117 bp  54  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0054  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 109 bp  54  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0738304  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0043  5S ribosomal RNA  89.36 
 
 		 117 bp  54  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.304759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0034  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 117 bp  54  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.263469 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0028  5S ribosomal RNA  82.76 
 
 		 116 bp  54  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349072  normal  0.465513 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0039  5S ribosomal RNA  82.76 
 
 		 116 bp  54  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0085  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 117 bp  54  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.102476  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0091  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 117 bp  54  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127685  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0016  5S ribosomal RNA  82.76 
 
 		 116 bp  54  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0035  5S ribosomal RNA  82.76 
 
 		 116 bp  54  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0016  5S ribosomal RNA  82.76 
 
 		 116 bp  54  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0035  5S ribosomal RNA  82.76 
 
 		 116 bp  54  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0048  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 118 bp  52  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0007  5S ribosomal RNA  96.67 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0034  5S ribosomal RNA  96.67 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0053  5S ribosomal RNA  96.67 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0078  5S ribosomal RNA  91.89 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0068  5S ribosomal RNA  91.89 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0038  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000916251  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0057  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0060  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000527991  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0069  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0054  5S ribosomal RNA  91.89 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0160021  normal  0.653325 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0009  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 119 bp  50.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0031  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 119 bp  50.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00046496  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0048  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 119 bp  50.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000922958  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0053  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 119 bp  50.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.545293  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0016  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 		 115 bp  48.1  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0004  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  48.1  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0024  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  48.1  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0069  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  48.1  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0016  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.384299  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>