131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_R0014 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_R0014  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  232  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0003  5S ribosomal RNA  99.15 
 
 		 117 bp  224  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0065  5S ribosomal RNA  99.15 
 
 		 117 bp  224  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0070  5S ribosomal RNA  99.15 
 
 		 117 bp  224  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0088  5S ribosomal RNA  99.15 
 
 		 117 bp  224  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.875375  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0085  5S ribosomal RNA  98.29 
 
 		 117 bp  216  9e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.102476  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0091  5S ribosomal RNA  98.29 
 
 		 117 bp  216  9e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127685  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0027  5S ribosomal RNA  97.44 
 
 		 117 bp  208  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0007  5S ribosomal RNA  84.85 
 
 		 116 bp  77.8  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0034  5S ribosomal RNA  84.85 
 
 		 116 bp  77.8  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0053  5S ribosomal RNA  84.85 
 
 		 116 bp  77.8  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0005  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0016  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0011  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3003  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 127 bp  61.9  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3006  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 127 bp  61.9  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3009  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 127 bp  61.9  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3012  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 127 bp  61.9  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3015  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 127 bp  61.9  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3019  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 127 bp  61.9  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r06  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 127 bp  61.9  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r12  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 127 bp  61.9  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r15  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 127 bp  61.9  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r18  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 127 bp  61.9  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.796215  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r21  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 127 bp  61.9  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r24  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 127 bp  61.9  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r27  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 122 bp  61.9  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r28  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 127 bp  61.9  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0014  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0028  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0025  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0106  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0071  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0068  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0067  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0043  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.304759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0017  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.711795  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0047  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0798933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0015  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0005  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.493215  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0012  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0017  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00334647  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0028  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000903183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0031  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0055  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0060  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0063  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00852672  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0009  5S ribosomal RNA  96.77 
 
 		 119 bp  54  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0031  5S ribosomal RNA  96.77 
 
 		 119 bp  54  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00046496  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0048  5S ribosomal RNA  96.77 
 
 		 119 bp  54  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000922958  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0053  5S ribosomal RNA  96.77 
 
 		 119 bp  54  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.545293  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0020  5S ribosomal RNA  96.67 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12425  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0021  5S ribosomal RNA  96.67 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0041  5S ribosomal RNA  96.67 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0042  5S ribosomal RNA  96.67 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0015  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0034  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0039  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 121 bp  50.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0038  5S ribosomal RNA  91.89 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000916251  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0057  5S ribosomal RNA  91.89 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0060  5S ribosomal RNA  91.89 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000527991  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0069  5S ribosomal RNA  91.89 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107578  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0028  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349072  normal  0.465513 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0039  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0038  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 122 bp  50.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0016  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0035  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0016  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0035  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_R0057  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 121 bp  50.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_R0058  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 122 bp  50.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0013  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 121 bp  50.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0014  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 122 bp  50.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0012  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 114 bp  48.1  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0017  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 114 bp  48.1  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0025  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.102792  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0036  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.484974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0050  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00973992  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0060  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136348  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0019  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 132 bp  48.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0044  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 132 bp  48.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0009  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 114 bp  48.1  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0030  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 114 bp  48.1  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0009  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0647002  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0025  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0315832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0022  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0032  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0037  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.047404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0070  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.260067  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0022  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  48.1  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0054  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  48.1  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0059  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  48.1  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0069  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  48.1  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0029  5S ribosomal RNA  93.55 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.759375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0058  5S ribosomal RNA  93.55 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0779086  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0051  5S ribosomal RNA  93.55 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  93.55 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  93.55 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0037  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0032  5S ribosomal RNA  93.55 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.113834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>