264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_R0021 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_R0039  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.213225  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0086  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0021  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.259042  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0015  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0168638  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0081  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000871424  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0057  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0010  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00985283  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0027  5S ribosomal RNA  98.28 
 
 
116 bp  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000434608  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0069  5S ribosomal RNA  85.22 
 
 
117 bp  93.7  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0060  5S ribosomal RNA  85.22 
 
 
117 bp  93.7  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000527991  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0057  5S ribosomal RNA  85.22 
 
 
117 bp  93.7  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0038  5S ribosomal RNA  85.22 
 
 
117 bp  93.7  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000916251  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-10  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 
119 bp  67.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000146718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-11  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 
109 bp  67.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000314078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_12  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 
114 bp  67.9  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_13  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 
114 bp  67.9  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656014  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SJ  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 
116 bp  67.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000154571  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SK  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 
116 bp  67.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000354497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5004  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 
116 bp  67.9  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0017  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 
116 bp  67.9  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00169127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0777  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 
116 bp  67.9  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.63754e-29 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0048  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 
118 bp  67.9  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0012  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 
114 bp  67.9  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0017  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 
114 bp  67.9  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5632  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 
116 bp  67.9  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0547962  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0140  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
115 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589678  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5740  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5746  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5749  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
111 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000534541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5752  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5755  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5758  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5761  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5764  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5767  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
111 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000116151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5770  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
111 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000576243  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5773  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
119 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000449498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-1  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
119 bp  61.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-2  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
119 bp  61.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-4  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
119 bp  61.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000434423  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-5  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
119 bp  61.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-6  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
119 bp  61.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-7  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
119 bp  61.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-8  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
119 bp  61.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-9  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
119 bp  61.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000019949  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_r02  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
119 bp  61.9  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_1  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
118 bp  61.9  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_10  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
118 bp  61.9  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_11  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
114 bp  61.9  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.069713  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_2  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
118 bp  61.9  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_5  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
114 bp  61.9  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_6  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
118 bp  61.9  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_7  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
118 bp  61.9  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_8  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
118 bp  61.9  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0073  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
115 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000636954  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0070  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
115 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_1  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
118 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_10  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
118 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_11  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
114 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000275902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_12  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
114 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000843494  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_13  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000161586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_2  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
118 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_3  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
118 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_4  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
114 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000269738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_5  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
118 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_6  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
118 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_7  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
118 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_8  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
118 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_9  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
118 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SA  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.409997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SB  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SC  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0798031  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SD  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000175937  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SE  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.711544  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SF  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.932076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SG  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SH  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SI  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000960299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0073  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0070  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0107  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000335281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0012  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0032  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0299918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0029  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0545703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0064  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0012  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
115 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0005  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
115 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0144  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000122827  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0056  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
115 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0032  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
115 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000010425  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0029  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
115 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.350698  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0061  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
115 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0017  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
115 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000279658  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0036  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0067  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
115 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0076  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223344  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0005  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0096  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000182454  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0064  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
115 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0094  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000653707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>