More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_R0043 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_R0034  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  232  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480679  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0043  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  232  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.240203  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0048  5S ribosomal RNA  92.04 
 
 		 116 bp  153  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.424673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0021  5S ribosomal RNA  91.74 
 
 		 116 bp  145  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.080713 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0017  5S ribosomal RNA  90.43 
 
 		 116 bp  141  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.069433 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0027  5S ribosomal RNA  90.43 
 
 		 116 bp  141  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0583618  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0055  5S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 117 bp  135  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0041  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 117 bp  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0062  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 117 bp  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0057  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 116 bp  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0042  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 116 bp  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0014  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 116 bp  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0061  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 116 bp  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0058  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 117 bp  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0013  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 117 bp  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0076  5S ribosomal RNA  90.82 
 
 		 117 bp  123  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0077  5S ribosomal RNA  90.82 
 
 		 117 bp  123  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0034  5S ribosomal RNA  90.82 
 
 		 117 bp  123  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.457596 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0055  5S ribosomal RNA  90.82 
 
 		 117 bp  123  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.579519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0021  5S ribosomal RNA  90.82 
 
 		 117 bp  123  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.631402 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0022  5S ribosomal RNA  90.82 
 
 		 117 bp  123  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.631402 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0054  5S ribosomal RNA  90.82 
 
 		 117 bp  123  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.577391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0035  5S ribosomal RNA  90.82 
 
 		 117 bp  123  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.457596 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0068  5S ribosomal RNA  90.82 
 
 		 117 bp  123  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.106732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0067  5S ribosomal RNA  90.82 
 
 		 117 bp  123  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.107142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0034  5S ribosomal RNA  88.03 
 
 		 117 bp  121  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.263469 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0027  5S ribosomal RNA  87.83 
 
 		 116 bp  117  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.360256  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0013  5S ribosomal RNA  87.83 
 
 		 116 bp  117  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0618011  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0007  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 122 bp  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0032  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 122 bp  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0043  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 122 bp  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14270  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 166 bp  113  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00060826  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03880  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 165 bp  113  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.158034  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0031  5S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 116 bp  111  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514773  normal  0.248036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0077  5S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 116 bp  111  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0053  5S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 116 bp  111  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0159173  normal  0.653325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0067  5S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 116 bp  111  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0019  5S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 117 bp  111  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0020  5S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 116 bp  111  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0033  5S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 116 bp  111  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0032  5S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 117 bp  111  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514773  normal  0.248036 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0006  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.449414  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0060  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0029  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000935796 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0022  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0063  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0017  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0030  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.476449  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0042  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06930  5S ribosomal RNA  86.32 
 
 		 123 bp  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.648291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10570  5S ribosomal RNA  86.32 
 
 		 123 bp  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.782601  normal  0.301698 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22200  5S ribosomal RNA  86.32 
 
 		 123 bp  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.380551  normal  0.811083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37120  5S ribosomal RNA  86.32 
 
 		 123 bp  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0018  5S ribosomal RNA  86.21 
 
 		 117 bp  103  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.295513  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0023  5S ribosomal RNA  86.21 
 
 		 117 bp  103  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0031  5S ribosomal RNA  86.21 
 
 		 117 bp  103  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0953498  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0062  5S ribosomal RNA  86.21 
 
 		 117 bp  103  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0065  5S ribosomal RNA  86.21 
 
 		 117 bp  103  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0065  5S ribosomal RNA  89.77 
 
 		 116 bp  103  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0066  5S ribosomal RNA  89.77 
 
 		 117 bp  103  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.225371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0044  5S ribosomal RNA  87.88 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000702474  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0047  5S ribosomal RNA  87.88 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0124102  hitchhiker  0.00149945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0007  5S ribosomal RNA  86.09 
 
 		 129 bp  101  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0033  5S ribosomal RNA  86.09 
 
 		 129 bp  101  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341902  normal  0.519563 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0041  5S ribosomal RNA  86.09 
 
 		 129 bp  101  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.114691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0034  5S ribosomal RNA  86.67 
 
 		 117 bp  97.6  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0031  5S ribosomal RNA  87.63 
 
 		 117 bp  97.6  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618538  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0015  5S ribosomal RNA  87.63 
 
 		 117 bp  97.6  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0050  5S ribosomal RNA  87.63 
 
 		 117 bp  97.6  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000265937  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0047  5S ribosomal RNA  87.63 
 
 		 117 bp  97.6  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292676  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0042  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247953  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0038  5S ribosomal RNA  86.54 
 
 		 117 bp  95.6  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0784313  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0046  5S ribosomal RNA  86.54 
 
 		 117 bp  95.6  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0029  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0068  5S ribosomal RNA  86.41 
 
 		 117 bp  93.7  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0007  5S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 116 bp  93.7  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0048  5S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 116 bp  93.7  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.48355  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0037  5S ribosomal RNA  86.09 
 
 		 118 bp  93.7  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0195143  hitchhiker  0.00974115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0078  5S ribosomal RNA  86.41 
 
 		 117 bp  93.7  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0020  5S ribosomal RNA  86.09 
 
 		 118 bp  93.7  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.803833  normal  0.34124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0054  5S ribosomal RNA  86.41 
 
 		 117 bp  93.7  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0160021  normal  0.653325 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0029  5S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 116 bp  93.7  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0036  5S ribosomal RNA  85.84 
 
 		 117 bp  89.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0195143  hitchhiker  0.00974115 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07400  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 129 bp  89.7  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224286  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12360  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 129 bp  89.7  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0222476  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0021  5S ribosomal RNA  85.84 
 
 		 117 bp  89.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.800418  normal  0.340088 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14048  5S ribosomal RNA  88.75 
 
 		 124 bp  87.7  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000166402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0022  5S ribosomal RNA  89.87 
 
 		 114 bp  85.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0790394  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0039  5S ribosomal RNA  89.87 
 
 		 114 bp  85.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0019  5S ribosomal RNA  89.87 
 
 		 114 bp  85.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507322  normal  0.482048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0036  5S ribosomal RNA  89.87 
 
 		 114 bp  85.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0862366  normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0106  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  83.8  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0058  5S ribosomal RNA  89.19 
 
 		 115 bp  83.8  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000489313  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0061  5S ribosomal RNA  89.19 
 
 		 115 bp  83.8  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0031  5S ribosomal RNA  89.19 
 
 		 115 bp  83.8  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0107699  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0025  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 113 bp  83.8  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0040  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 113 bp  83.8  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0277328  normal  0.0318145 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0014  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  83.8  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0019  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 114 bp  83.8  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329841  normal  0.0964141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0036  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 114 bp  83.8  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.481647  hitchhiker  0.00452682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>