82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_R0004 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013923  Nmag_R0057  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 118 bp  234  4.0000000000000004e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_R0055  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 118 bp  234  4.0000000000000004e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.705765  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0023  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 118 bp  234  4.0000000000000004e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0004  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 118 bp  234  4.0000000000000004e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.140775  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_R0056  5S ribosomal RNA  90.27 
 
 		 120 bp  137  7.000000000000001e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0018  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 118 bp  109  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0035  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 118 bp  109  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0060  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 118 bp  109  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0053  5S ribosomal RNA  84.82 
 
 		 121 bp  87.7  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0039  5S ribosomal RNA  83.62 
 
 		 121 bp  79.8  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0038  5S ribosomal RNA  83.62 
 
 		 122 bp  79.8  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0014  5S ribosomal RNA  83.62 
 
 		 122 bp  79.8  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0013  5S ribosomal RNA  83.62 
 
 		 121 bp  79.8  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_R0058  5S ribosomal RNA  83.62 
 
 		 122 bp  79.8  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_R0057  5S ribosomal RNA  83.62 
 
 		 121 bp  79.8  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0025  5S ribosomal RNA  83.62 
 
 		 118 bp  79.8  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0024  5S ribosomal RNA  83.62 
 
 		 122 bp  79.8  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0044  5S ribosomal RNA  86.15 
 
 		 131 bp  58  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0021  5S ribosomal RNA  86.15 
 
 		 131 bp  58  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0069  5S ribosomal RNA  86.15 
 
 		 131 bp  58  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_R0061  5S ribosomal RNA  84 
 
 		 118 bp  54  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0028  5S ribosomal RNA  84 
 
 		 118 bp  54  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.678943  hitchhiker  0.00874775 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0004  5S ribosomal RNA  84 
 
 		 118 bp  54  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.357792  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0070  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.45639  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0032  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0044  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 132 bp  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0069  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 115 bp  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0059  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 115 bp  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0054  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 115 bp  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0022  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 115 bp  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0019  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 132 bp  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0022  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0037  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.047404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0070  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.260067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0014  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0050  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00973992  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0060  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136348  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0106  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0005  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0011  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0036  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.484974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0025  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0028  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0067  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0068  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0043  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.304759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0025  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.102792  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0009  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 114 bp  48.1  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0071  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0030  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 114 bp  48.1  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0009  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0647002  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0025  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0315832  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0055  5S ribosomal RNA  93.55 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0015  5S ribosomal RNA  93.55 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0037  5S ribosomal RNA  93.55 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0010  5S ribosomal RNA  89.74 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.629957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0021  5S ribosomal RNA  89.74 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000104076  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0065  5S ribosomal RNA  89.74 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133126  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0078  5S ribosomal RNA  89.74 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000574865  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0005  5S ribosomal RNA  93.55 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.493215  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0012  5S ribosomal RNA  93.55 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0017  5S ribosomal RNA  93.55 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00334647  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0028  5S ribosomal RNA  93.55 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000903183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0031  5S ribosomal RNA  93.55 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0063  5S ribosomal RNA  93.55 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00852672  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0058  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0779086  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0051  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0032  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.113834  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0029  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.759375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0011  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0003  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0189262  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0060  5S ribosomal RNA  93.55 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0065  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 116 bp  44.1  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0066  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.225371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0036  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 114 bp  44.1  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.481647  hitchhiker  0.00452682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0022  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 114 bp  44.1  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0790394  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0039  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 114 bp  44.1  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0019  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 114 bp  44.1  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329841  normal  0.0964141 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0040  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 113 bp  44.1  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0277328  normal  0.0318145 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0025  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 113 bp  44.1  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0036  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 114 bp  44.1  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0862366  normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0019  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 114 bp  44.1  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507322  normal  0.482048 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>