More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_R0013 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_R0008  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  232  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.488687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0013  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  232  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.607574 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0029  5S ribosomal RNA  91.45 
 
 		 117 bp  153  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0932548  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0007  5S ribosomal RNA  91.45 
 
 		 117 bp  153  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.156774  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0039  5S ribosomal RNA  95.45 
 
 		 115 bp  107  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc5SA  5S ribosomal RNA  92.65 
 
 		 117 bp  95.6  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc5SB  5S ribosomal RNA  92.65 
 
 		 117 bp  95.6  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.729876  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0011  5S ribosomal RNA  91.3 
 
 		 115 bp  89.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0014  5S ribosomal RNA  94.55 
 
 		 115 bp  85.7  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.873356  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0026  5S ribosomal RNA  94.55 
 
 		 115 bp  85.7  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0007  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 114 bp  67.9  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00219563  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0013  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 113 bp  67.9  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.118637  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna55  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0884571  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0012  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.702393  hitchhiker  0.00125226 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0013  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 114 bp  67.9  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.149045  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0081  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.258574 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0011  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.712208  hitchhiker  0.00122523 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna48  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0243319  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0086  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919882  normal  0.263092 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0006  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000380355  hitchhiker  0.00390757 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0007  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 113 bp  67.9  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.951123  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0022  5S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 114 bp  61.9  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0022  5S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0061  5S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0005  5S ribosomal RNA  84.81 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39866  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0015  5S ribosomal RNA  84.81 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.651632  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0059  5S ribosomal RNA  84.81 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0075  5S ribosomal RNA  84.81 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0083  5S ribosomal RNA  84.81 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0017  5S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0010  5S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 114 bp  61.9  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.780985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_rRNA5S2  5S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 123 bp  61.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_rRNA5S1  5S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 123 bp  61.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.25658  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5SA  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 120 bp  60  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000806285  hitchhiker  0.0000506665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0010  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277848  hitchhiker  0.00608512 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5SC  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 120 bp  60  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.176964  normal  0.036827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5SD  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 120 bp  60  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.948307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5SE  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 120 bp  60  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.110384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5SF  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 120 bp  60  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5SG  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 120 bp  60  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0104194 
 
 
-
 
NC_002947  PP_r01  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 120 bp  60  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.732599  hitchhiker  0.0000520516 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0052  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.801763 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA17  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 115 bp  60  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0237431 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA48  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 115 bp  60  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.929438  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA70  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 115 bp  60  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA79  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 115 bp  60  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0223502 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA8  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 115 bp  60  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0018  5S ribosomal RNA  84.15 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0049  5S ribosomal RNA  84.15 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0059  5S ribosomal RNA  84.15 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.160343  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0074  5S ribosomal RNA  84.15 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0082  5S ribosomal RNA  84.15 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0085  5S ribosomal RNA  84.15 
 
 		 113 bp  60  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0076  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0020  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.169844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0089  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 127 bp  60  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.057146  normal  0.0190343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0060  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 127 bp  60  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0087  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.102281  normal  0.68402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0100  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000633708  normal  0.0514054 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0003  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.317777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0017  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.23056  normal  0.0168107 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0013  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0722167  normal  0.0228217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0035  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.669342  normal  0.436054 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0095  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356068  normal  0.334763 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0050  5S ribosomal RNA  89.58 
 
 		 118 bp  56  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409791  normal  0.069231 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1911  5S RNA  83.54 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00279415  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0017  5S ribosomal RNA  90.7 
 
 		 115 bp  54  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0183737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0017  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 109 bp  54  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0279  5S ribosomal RNA  83.54 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446741  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0035  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 109 bp  54  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  Wp5SC  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 111 bp  52  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.709549  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r03  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 120 bp  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r06  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 120 bp  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r09  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 120 bp  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0013  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 121 bp  52  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84229  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0111  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 121 bp  52  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA78  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R90  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000508356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0029  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0023  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0025  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0128  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 121 bp  52  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0135  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0138  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0015  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00630184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0041  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.190843 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0121  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 120 bp  52  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.667113  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0127  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0027  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 120 bp  52  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.979721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0014  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0069  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.733499  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0024  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0127  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0004  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.221471 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0044  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 120 bp  52  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0010  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0003  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0017  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0140  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.626199  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0134  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0134181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>