298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_rna48 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_rna55  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0884571  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna48  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0243319  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0012  5S ribosomal RNA  96.46 
 
 		 115 bp  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.702393  hitchhiker  0.00125226 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0011  5S ribosomal RNA  96.46 
 
 		 115 bp  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.712208  hitchhiker  0.00122523 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0081  5S ribosomal RNA  96.46 
 
 		 115 bp  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.258574 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0086  5S ribosomal RNA  96.46 
 
 		 115 bp  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919882  normal  0.263092 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0006  5S ribosomal RNA  96.46 
 
 		 115 bp  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000380355  hitchhiker  0.00390757 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0013  5S ribosomal RNA  93.81 
 
 		 114 bp  161  5e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.149045  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0013  5S ribosomal RNA  93.81 
 
 		 113 bp  161  5e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.118637  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0007  5S ribosomal RNA  93.81 
 
 		 114 bp  161  5e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00219563  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0007  5S ribosomal RNA  93.81 
 
 		 113 bp  161  5e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.951123  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0045  5S ribosomal RNA  92.96 
 
 		 118 bp  101  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.367607  normal  0.064154 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0152  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 115 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.266818 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0140  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 115 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.626199  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0024  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 115 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0017  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0127  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 115 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0013  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 115 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0102843 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0026  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 115 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0619749 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0147  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 115 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0078  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 113 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0594811  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0127  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0138  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0135  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0012  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 115 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0075039 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0004  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 115 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.13622  unclonable  0.0000114116 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0010  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0069  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 115 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.733499  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0012  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 115 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0030  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 115 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000472199 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0119  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 115 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0042  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 115 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.190599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0029  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 115 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0032  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 115 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134368 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0013  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 121 bp  95.6  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84229  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0015  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 120 bp  95.6  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.832778  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0007  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 121 bp  95.6  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0064  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 121 bp  95.6  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.648247  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0121  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 120 bp  95.6  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.667113  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0111  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 121 bp  95.6  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0020  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 115 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0128  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 121 bp  95.6  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0006  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 115 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0003  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 115 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0028  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 115 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458962 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0003  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 115 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000245604 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0006  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 115 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000035078 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0009  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 115 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0900632  hitchhiker  0.000000917011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0016  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 115 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000743511 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0019  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 115 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0404714  hitchhiker  0.0000248645 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0021  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 115 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.973202  normal  0.0141597 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0035  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 115 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0035  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0090  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 115 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0003  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0023  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0138  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 115 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.571697 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0025  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0003  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 121 bp  95.6  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.685817  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0029  5S ribosomal RNA  88.54 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0020  5S ribosomal RNA  87.37 
 
 		 115 bp  93.7  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.8682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0055  5S ribosomal RNA  87.37 
 
 		 115 bp  93.7  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.533028  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0017a  5S ribosomal RNA  91.55 
 
 		 120 bp  93.7  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0010  5S ribosomal RNA  87.37 
 
 		 115 bp  93.7  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0011  5S ribosomal RNA  93.55 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0134  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 115 bp  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0134181  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0014  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 115 bp  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0115  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 115 bp  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0023  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 120 bp  87.7  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0010  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 115 bp  87.7  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593953  hitchhiker  0.000000939514 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0038  5S ribosomal RNA  90.14 
 
 		 119 bp  85.7  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0039  5S ribosomal RNA  90.14 
 
 		 117 bp  85.7  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0048  5S ribosomal RNA  90.14 
 
 		 119 bp  85.7  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147764  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0054  5S ribosomal RNA  90.14 
 
 		 119 bp  85.7  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0344  5S ribosomal RNA  90.14 
 
 		 119 bp  85.7  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0350  5S ribosomal RNA  90.14 
 
 		 119 bp  85.7  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0561  5S ribosomal RNA  90.14 
 
 		 119 bp  85.7  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0567  5S ribosomal RNA  90.14 
 
 		 119 bp  85.7  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1612  5S ribosomal RNA  90.14 
 
 		 119 bp  85.7  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3902  5S ribosomal RNA  90.14 
 
 		 119 bp  85.7  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r009  5S ribosomal RNA  87.64 
 
 		 120 bp  81.8  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r013  5S ribosomal RNA  87.64 
 
 		 120 bp  81.8  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r016  5S ribosomal RNA  87.64 
 
 		 120 bp  81.8  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r019  5S ribosomal RNA  87.64 
 
 		 120 bp  81.8  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r022  5S ribosomal RNA  87.64 
 
 		 120 bp  81.8  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r025  5S ribosomal RNA  87.64 
 
 		 120 bp  81.8  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0018  5S ribosomal RNA  87.64 
 
 		 116 bp  81.8  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000474552 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0075  5S ribosomal RNA  87.64 
 
 		 116 bp  81.8  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0130  5S ribosomal RNA  87.64 
 
 		 116 bp  81.8  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0134  5S ribosomal RNA  87.64 
 
 		 116 bp  81.8  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00025818  hitchhiker  0.00693749 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0138  5S ribosomal RNA  87.64 
 
 		 116 bp  81.8  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0141  5S ribosomal RNA  87.64 
 
 		 116 bp  81.8  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0395  hypothetical protein  87.64 
 
 		 129 bp  81.8  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000730757  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0003  5S ribosomal RNA  87.64 
 
 		 116 bp  81.8  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377147  hitchhiker  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0011  5S ribosomal RNA  87.64 
 
 		 116 bp  81.8  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00932419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0018  5S ribosomal RNA  87.64 
 
 		 116 bp  81.8  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.374169 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0024  5S ribosomal RNA  87.64 
 
 		 116 bp  81.8  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000358593  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0028  5S ribosomal RNA  87.64 
 
 		 116 bp  81.8  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0075  5S ribosomal RNA  87.64 
 
 		 116 bp  81.8  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.110925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0121  5S ribosomal RNA  87.64 
 
 		 116 bp  81.8  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>