127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_R0007 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_R0007  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  232  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.156774  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0029  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  232  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0932548  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0008  5S ribosomal RNA  91.45 
 
 		 117 bp  153  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.488687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0013  23S ribosomal RNA  91.45 
 
 		 117 bp  153  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.607574 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0005  5S ribosomal RNA  91.14 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39866  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0015  5S ribosomal RNA  91.14 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.651632  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0059  5S ribosomal RNA  91.14 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0075  5S ribosomal RNA  91.14 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc5SA  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 117 bp  95.6  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc5SB  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 117 bp  95.6  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.729876  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0083  5S ribosomal RNA  89.87 
 
 		 116 bp  93.7  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0039  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 115 bp  83.8  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0011  5S ribosomal RNA  89.86 
 
 		 115 bp  81.8  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0014  5S ribosomal RNA  92.73 
 
 		 115 bp  77.8  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.873356  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0026  5S ribosomal RNA  92.73 
 
 		 115 bp  77.8  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1911  5S RNA  86.08 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00279415  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0279  5S ribosomal RNA  86.08 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446741  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0009  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.10388  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0017  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0111845  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0018  5S ribosomal RNA  83.95 
 
 		 113 bp  58  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0049  5S ribosomal RNA  83.95 
 
 		 113 bp  58  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0059  5S ribosomal RNA  83.95 
 
 		 113 bp  58  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.160343  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0074  5S ribosomal RNA  83.95 
 
 		 113 bp  58  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0082  5S ribosomal RNA  83.95 
 
 		 113 bp  58  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0085  5S ribosomal RNA  83.95 
 
 		 113 bp  58  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55080  5S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 118 bp  54  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0034  5S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 115 bp  54  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000354404  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0041  5S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 115 bp  54  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0049  5S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 115 bp  54  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.119375  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55020  5S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 118 bp  54  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0012  5S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 115 bp  54  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.702393  hitchhiker  0.00125226 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0011  5S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 115 bp  54  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.712208  hitchhiker  0.00122523 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55120  5S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 118 bp  54  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0003  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.701681  normal  0.952705 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0021  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0027  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.905353  unclonable  0.00000755245 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0054  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0109  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00459637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0130  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0010  5S ribosomal RNA  83.54 
 
 		 115 bp  54  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0020  5S ribosomal RNA  83.54 
 
 		 115 bp  54  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.8682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0055  5S ribosomal RNA  83.54 
 
 		 115 bp  54  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.533028  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55090  5S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 118 bp  54  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55050  5S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 118 bp  54  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55150  5S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 118 bp  54  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0086  5S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 115 bp  54  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919882  normal  0.263092 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0081  5S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 115 bp  54  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.258574 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0006  5S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 115 bp  54  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000380355  hitchhiker  0.00390757 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna55  5S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 115 bp  54  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0884571  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0105  5S ribosomal RNA  83.54 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0106  5S ribosomal RNA  83.54 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0007  5S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 114 bp  54  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00219563  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0013  5S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 114 bp  54  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.149045  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0007  5S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 113 bp  54  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.951123  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0013  5S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 113 bp  54  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.118637  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna48  5S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 115 bp  54  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0243319  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0017  5S ribosomal RNA  88 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0183737  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_r01  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 126 bp  50.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_r04  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 126 bp  50.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.596836  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAr01  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 119 bp  50.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1017  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 123 bp  50.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1581  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 123 bp  50.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1789  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 123 bp  50.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.055936  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0014  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 114 bp  50.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0022  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 114 bp  50.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0058  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 114 bp  50.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0068  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 114 bp  50.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0022  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 122 bp  48.1  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120854  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0044  5S ribosomal RNA  86.54 
 
 		 115 bp  48.1  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0027  5S ribosomal RNA  86.54 
 
 		 120 bp  48.1  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.979721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0044  5S ribosomal RNA  86.54 
 
 		 120 bp  48.1  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_R0002  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 110 bp  48.1  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.84828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_R0001  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 110 bp  48.1  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.119355  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5SB  5S ribosomal RNA  84.75 
 
 		 120 bp  46.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000511207 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0023  5S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.881601  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0042  5S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.1617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0047  5S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0065  5S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0015  5S ribosomal RNA  84.75 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00630184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0041  5S ribosomal RNA  84.75 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.190843 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0005  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0009  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0017  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0034  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0061  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.488897 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0089  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0101  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0104  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076366 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0108  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.329988 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0012  5S ribosomal RNA  84.75 
 
 		 120 bp  46.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34851  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0037  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 114 bp  46.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.10728 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0003  5S ribosomal RNA  84.75 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000118711  normal  0.523359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0008  5S ribosomal RNA  84.75 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97936 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0009  5S ribosomal RNA  84.75 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0016  5S ribosomal RNA  84.75 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0025  5S ribosomal RNA  84.75 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0062  5S ribosomal RNA  84.75 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0088  5S ribosomal RNA  84.75 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0093  5S ribosomal RNA  84.75 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000805148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0094  5S ribosomal RNA  84.75 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267932  normal  0.332624 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>