299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_R0020 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_R0020  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.8682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0055  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.533028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0010  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0015  5S ribosomal RNA  89.58 
 
 		 115 bp  111  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00630184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0041  5S ribosomal RNA  89.58 
 
 		 115 bp  111  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.190843 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0009  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0900632  hitchhiker  0.000000917011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0026  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0619749 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0028  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458962 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0032  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134368 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0127  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0023  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0019  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0404714  hitchhiker  0.0000248645 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0069  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.733499  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0024  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0127  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0003  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 121 bp  109  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.685817  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0007  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 121 bp  109  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0013  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 121 bp  109  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84229  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0016  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000743511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R16  5S ribosomal RNA  88.29 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R45  5S ribosomal RNA  88.29 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.161753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R5  5S ribosomal RNA  88.29 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.378855  normal  0.842536 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R56  5S ribosomal RNA  88.29 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R6  5S ribosomal RNA  88.29 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.305961  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R77  5S ribosomal RNA  88.29 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R90  5S ribosomal RNA  88.29 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000508356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0003  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0012  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0075039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0006  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0020  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0128  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 121 bp  109  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0012  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0140  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.626199  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1115r  5S ribosomal RNA  88.29 
 
 		 120 bp  109  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.155986  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0029  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0021  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.973202  normal  0.0141597 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0003  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0003  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000245604 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0006  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000035078 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0029  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0025  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0017  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0078  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 113 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0594811  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0138  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0135  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0013  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0102843 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0064  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 121 bp  109  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.648247  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0111  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 121 bp  109  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0121  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 120 bp  109  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.667113  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0015  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 120 bp  109  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.832778  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0030  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000472199 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0004  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.13622  unclonable  0.0000114116 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0010  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0035  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 116 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0035  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0119  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0042  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.190599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0090  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0138  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.571697 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0152  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.266818 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0147  5S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 115 bp  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0056  5S ribosomal RNA  90.43 
 
 		 114 bp  107  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0061  5S ribosomal RNA  90.43 
 
 		 114 bp  107  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0159471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0115  5S ribosomal RNA  91.01 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0134  5S ribosomal RNA  91.01 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0134181  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0078  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 115 bp  103  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0038  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 120 bp  103  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.988118  normal  0.154283 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0012  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 120 bp  103  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34851  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0070  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 115 bp  103  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.865708  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5SB  5S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 120 bp  101  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000511207 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5SC  5S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 120 bp  101  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.176964  normal  0.036827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5SD  5S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 120 bp  101  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.948307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5SE  5S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 120 bp  101  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.110384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5SF  5S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 120 bp  101  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_r01  5S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 120 bp  101  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.732599  hitchhiker  0.0000520516 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0025  5S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0087  5S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.102281  normal  0.68402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0017  5S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.23056  normal  0.0168107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0008  5S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97936 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0014  5S ribosomal RNA  90.11 
 
 		 115 bp  101  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0003  5S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.317777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA78  5S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 115 bp  101  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0023  5S ribosomal RNA  90.11 
 
 		 120 bp  101  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0093  5S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000805148 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0088  5S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0052  5S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.801763 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0010  5S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277848  hitchhiker  0.00608512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0094  5S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267932  normal  0.332624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0076  5S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0095  5S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356068  normal  0.334763 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6149  5S ribosomal RNA  91.58 
 
 		 120 bp  101  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.989968  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0045  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 118 bp  101  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.367607  normal  0.064154 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08610  5S ribosomal RNA  91.58 
 
 		 132 bp  101  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402546 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55620  5S ribosomal RNA  91.58 
 
 		 132 bp  101  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.431806 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62050  5S ribosomal RNA  91.58 
 
 		 132 bp  101  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70870  5S ribosomal RNA  91.58 
 
 		 132 bp  101  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0009  5S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0003  5S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000118711  normal  0.523359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0062  5S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0016  5S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 116 bp  101  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602402  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>